Basic Information

Symbol
PAK2
RNA class
mRNA
Alias
P21 (RAC1) Activated Kinase 2 PAK65 S6/H4 Kinase PAKgamma P21 Protein (Cdc42/Rac)-Activated Kinase 2 Serine/Threonine-Protein Kinase PAK 2 P21 (CDKN1A)-Activated Kinase 2 P21-Activated Kinase 2 EC 2.7.11.1 Gamma-PAK PAK-2 P58 EC 2.7.11 KNO2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_002577.4
Sequence length
6139.0 nt
GC content
0.3996

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1652.44 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1767.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1395.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.............((((..(((((...((.((((((((((((..((((.((.....((.((((...(((....)))...)))).))((.(((...............)).).)))).)))).)))))))))))).))...))((((((....))))))(((((((((((........))))..(((((..((((.((((((((...((((((((.(((..((((((((((.(.((((....))))).))))).((((((..(((((((((((((....))))))....)))))))..))))))....(((......)))((((....))))..((((((.(.(((((((((.......((((.....))))...((.((((((((((((((((.(((((((((...(((.....))).)))..)).))))))))).....(((....(((((((((((.((((..((....))............((((.((((((((.........((((.((((.................(((((((.((((((.(((((.(((.(((((.(((..(((((((((.((((......)))).)).))))........)))..))))))))))))))((((................................)))).................((((((.((((.(((.((......)).))))))).))))))..)).)))))).)))).)))))))))))))))))))..)))).)))))))))))))))...))).((((((((((((((((((.......(((.((((((((.((((((.((..(..........)..)).))))))..))))))))...)))..((.......))................((((.......)))))))))))).......))))).)))))......))))))))))))).(((....)))...(((((((((((((..((((.((.((((((.....((((((((..........)).)))))).....((((((...(((...(((((((.(((.............(((((.((((((...(((.((((.(((((.(((..((((((.(((((((((((((((((((.(((((((.(((.(((.....((((((((((((((.((((((((.((((((((((.....(((.(((..............))))))...))))))).....))).))))).))).((.((((..(((((((((.((.((((((((..((((..((..(((((((((((....))))..........((((((((((((((((((........(((((.(((.....))).)))))((.((((((.(((((..(((((.(((((((((((.(((((....((((((((......))))))))((((((((.(((((((((((((...((((((.((((..((((((.(((.......))).)).........)))).)))).))))))..((((((..((((((((.((..((((.(((.....(((((((((.((((((((((...........(((((((((.((.(((((((((....((((.((((............((((((.(......).)))))).)))).)))))))))))......(((....)))......)))))))))))))...(((((.((.((((((.((((.((.......)).)))).))))))..)).))))).((((((((((...((((........(((.........))).....(((((..........(((((((((...(((..((((.((..........)).))))..)))....))))).......)))))))))(((((((((((((.(.(((((((.(((((((..(..((((........))))..)..)))))))((((((..(((((((((((((..................)))...))))))).)))..))))..))...))))))).).)))))))...))))))))))....)))))))))))))))))(((((.((....)).)))))..........))).)))).)))))....))).))))....))))))))))..))).)))......(((........))).......))).))))))))))..)))))..))).)))))))))........))))))).)))))...)))))..)))))).)).)))))))))))..................((((((((((((.((((.((.(((((((.....((((.(((....)))...))))......))))))).))...((((((((((((((((((.((....))))))))))..))))))))))(((((.....)))))..(((((....(((((.(((((((..((((...((((((..((((...(((((.(((((((((....(((.((((((((.((((((((.......)))))))).......)))))))).)))((((((......((((((.((((.....(((((((............)))))))...)))).........(((((((((.((((...................))))....))))))))).(((((.(((((.........)))))..))....)))(((((((((.((..(((((((...))))...)))...)).)))))))))))))))))))))))))))))).))))).....))))))))))...)))).....))))))).)))))....)))))......(((..((((((.((((((...............(((((((((((((((((...((((((............((((((((....((((..............((((((((.......)))))))).......(((..((.((.(((((.((.((((((.(.(((....((.(((....((....(.((((((.((...((((((...........(((((((((((((((((((((.((((.....))))(((((.(((((((((.((((((...))))))))))))).)).)))))((((......))))..(((((.(((.(((..((((((((..(((((.........))))).))))))))..))).))).))))).((((((((((.(((((((.....(((((...))))).........))))))).)))))))))).(((.........))).....)))))))))).............(((((...))))))))))))))))....))))))...)).)))))))..))..)))))..))).).)))))).)).))))).))))..)))))))..)))))))).))))))...)))).)))..........))))))))))..((((...((((((((.((..((((((((.............(((((.(.(((((((((((..((.((((.(((((...((....(((((.....)))))....))...))))))))).))....))))))))...........(((((((((..............)))))))))........))).).)))))((((((((..((..((...((.((((((...(((((((((((...((.(((((.(((((......(((((.(((....)))))))).)))))...))))).))...))))))))))).((((((....((((...((.(((((.((.(((.....((((((........)))))).)))))))))).)).)))).....)))))))))))).))..))..)).))))))))))))))....))...)).)))))))))))))))))).))))))..))))))).)))))).))))))....))))))).....(((((..........(((((..((......))..)))))..)))))...((((......))))..)))))))..)).))))...))))).))))).))))))))).((((.(((((....((((........))))..))))).)))).....((((((.....))))))........(((((((((.....))))))))).....((((((((((...........))))))))))..)))).)).........)))))))...........(((((.((((((((......)))))))).)))))(((((.(((((((.(((((((......(((((......)))))...)))))))....))))))).))))).))))))).....))).))).)))))))((((((...))))))..(((((((.(((((((((((((..((....))..))))))))..)))))...)))))))....(((.......)))..))))))))))((((((((.(......(((....)))......).)))))))).................(((((...)))))........(((.(((.(((.(....(((((((....)))).)))..).)))))).))).))))..))))).)).))))..))))))))..)))).))).)))))).))))).............))).)))))))...)))...))))))......((((....))))...(((((((((((((........(((((((((..((...))..)))))(((((((...))))))))))).......))))))))))))).))))))))))))..)))))))).))))).((((((((((......(((((.((.....(((((...)))))..))))))).....))))))))))...(((((..((((..(((...(((((((((((............).))))).)))))...)))....))))...)))))..((((((..........(((((((.(((.((((..(((......)))..)))).((((((((.(((((((.(((.((((.(((..((((............))))....)))))))))).)).....(((((....)))))......((((((....))))))(((((((...(((((..((((((.......(((((.......(((((.(((((...........))))).)))))....)))))............(((((((.((.(((.....)))..)).))))))).....)))))).)))))...)))))))((((((........))))))))))))))))))))))))))).))..........))).)))))))))))).)))))))(((((.....))))).....(((((((((...))))))))).....(((((((((((.((........)).)))))))))))........((((((((....)))))))).....)))))...).)).))))).))).))))..))))...).)))..)))))..))))))).((((((((((((((((.(((((......((((((.((((........(((((........)))))..)))).))))))....(((((((((....(((((((((((((((((((........).))))))))))))))))))(((((((((((.(((((.(((((...((((((.......)))))).))))))))))...))))))))))))))))))))...((((.((((((((((((((..((((.......(((....)))..................................(((((....))))).........))))..)))))))....)))).))).))))....)))))))))))))))))))))......((((((....))))))...)))....))))........(((((((.((.((....))..)).))))))).((((((.(((((((((((......)))))).))))).))))))..(((.((((((....((((((((((.((((...)))).)))))))))))))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
............,((((..{,{((({{({,((({((((((((..{{{({({....,{,.{||{...{||,,,,)))..,)))).|||,.....,.,,...,{..,,.||,|.||||.|||}.}}||||||}|||,|}.,,{{((((((.,..)))))}{((((({((((........)))).,({{{{..{{{{.{{{{{{{{...{{{{((({.,{|||||||||||||,|,||(|,,..}))}),))))).{((({{..{{|{(({{{{||{..,,)}))))....,)))))),,))))))....(({......))){(({....}))}..((((({,(.(((((((((.......((((.....))))...{(.(((((((((((...(({{.{((((((((((.....,,|||,{,,.....,,},}}}}...}}}}}|||,|{((((((((((.(({,..((....))......,{{{{{,,...((((((((.........((({,((((.................{((((({.((((((,(,(((.(((.(((((.(((..(((((((,{,|(((......)))}..},})))........)))..))))))))))))))((((.....................,,.........))))............,||..((((((.((((.(((.((......)).))))))).)))))),,|}.}))}}}.)))).))))))))))))))))))),})))},}))))))))))))}|||||,{{{{,,{({,..((((((((..,,...{||.((((((((.({((((,((..{..,.......}..)).)))))),.))))))))..,|}}..||,......,}................((((.......))))))))))))))}.})))))))},,.....}))}))))))))))))}.(((....)))...,((((((((({((..{((({(({,{({{{...,.,{{(((,(,,........||,,,||||.....((((((...(((...(((((((.(((.,{..........(((((.((((((...(((.((((.(((((.(((..((((((.(((((((((((((((((((.,((((((.{({.{{(..,.,(((({{((((((((.((((((((.((((((((((.....(((.(((..............))))))...))))))).....))).))))).))).((.((((..(((((((((.(,{((((((((..((((..((..(((((((.{{({{{,|||{,.,,{{{{{{.{(((((.,{(((((((,...{|{|,({,{{.|||,...,))),)}))||}}|||{{|}|||,...|||{{.(({((((({({.(((((...,((((((((......))))))))|(((((({.(((((((((({{{...((((((.((((,,(({(((.({(..,....))).))}.,},....}}}}.)))).))))))..,(((((..{{({{{{{.((.,((((,(((...,,((({(((({.((((((((((..........,(((((((((.((.{,(((((((....((((.((((,{...,,,,...((((((.(......}.)))))).)))).)))))))))))......{((....)))......},}})))))))))...{((((.((.((((((.((((.((.......)).)))).))))))..)).))))}.((((((((((...((((......,.(((.{.......}}}.....(((({..,,|{...,,,{,{(({(...{{{,.|{||,|{,,|,...,.,||,,|||..}||....}}}}},.,,,.}))),)))))(((((((((((((.{.(((((((.,{(({,,..,,.|((({.,,,....,}},}}}}}}|||{((.((((..(((((((((((((.....,,.......,,..)))...))))))).)))..))))..))}}}))))))).).))))))}..,))))))})))....)))))))))))))))))|{|{{.({,...)),))))),.........))).)})),}}))),|,.|}}.||||....))))}}}}}}..}}),}||{{,{..{{{........))),}},,..)}}.)))))))))),,)))},,.}|||}}}}))))}........}))}))).}))}),,,,||||{.||||.{{((({{({..,,|||.{{.(((({{{(((..{{(,.,.(.((((((((((.((.(((((((.....((((.(((....)))...))))......))))))).)}...((((((((((((((((((.((....)))))))))}.,))))))))))(((((.....)))))..(((((....(((((.(((((((..{,(({{.((((((..((((...(((((,{((((((((....(((.((((((((,((((((({,{....}))))))))...,...}))))))).))}((((((......{({(({.{{{{.,{{.(((((((..,......,..))))))).}})}}}....,,...({(({((({.{{({.,,.,,......,..||..}}}}....}}}}))))}.,{,...(((((.........)))))..||{.,,|,,{((((((((.((..(({({{(...}}}}...)))...)).)))))))))))}))))))))))))))))))))))),.....))))))))))..}))),.....))))))).)))))....))))).(({..{{...((((((((.((({,{((((,,{......,((((((((((((((((...((((((..........,.{(((((((....{(({,......,......{{((((((.......))))))}}......,(((..((.((.(((((.{{.((((((.(.(((....((.(((....(,....{.((((((.((...((((((........,,,(((((((((((((.{...((((({{({{...{{(|(((((.(((((((((.((((((...))))))))))))).)).))))){|||,.,,,,)}}}..(((((.(((.(((..((((((((..(((((.,,....,,))))).))))))))..))).))).))))).,,{{{.{(((((((((({,{{{,{((....)))}))}.})))))))))|{{{{|{{{{{{{.{,(((.,.......))),,,.,})))))))))}...},,,,,....)).)))...}))))))))))))).,))))))))...)).)))))),..}}..)))))..))).).)))))).}}.))))).)))),,))))))),,)))))))),))))))...)))).)))..........)))))))))}..((((...((((,..|}||...}}}|.,,.............(((((.(.(((((((((((,.((.((((.(((((...{(..,.{{{{{.....})))}.}..))...))))))))).))....))))))))...........{{({{((({..............)))))))))........))).).)))))((((((((..{{..((...((.((((((,..(((((((((((...{{.(((((.(((((.,....,((((.(((....))))))))})))))...))))).))...))))))))))).{(((((.,,.((((...((.(((((.{{.(((.....{(((({........)))))}.)))}}))))).)).))))..,,.)))))))))))).))..))..}).))))))))))).))))})))).}))))))).)).))),..)))).)))))).,...)))..)))))))))))))}...))))))))).}}||,||,,,.,,,...(((((..({......))..)))))..)))))...((({......))))..)))))))..)).)))}...))))),,)))).))))))))).((((.(((((..,.((((........)))).,))))).)))).,{{.((((((.....)))))).,,,..,.(((((((((.....))))))))).,...((((((((((...........))))))))))..)))).}).........)))))))}..,}}}}...{((((.((((((((......)))))))).))))}(((((,(((((({.{{{{{{{....,.{((((.....,}}}}}.,.||}}},,.,,,})))))},))))}.,)))))),....)}).}}}.))))))|((((((...))))))}.(((((((.(((((((((((((..((....))..))))))))..)))))...)))))))....(({.......)))..))))))))))((((((((.{......(((....)))......,.))))))))..............{{.(((((...))))),,......(((.(((.(((.,....(((((((....)))).)))..).)))))).))).)))),.,)))).)).))))..))))))))..)))).))).)))))).)))))..........,,.))).)))))))...)))...)))))),,..,,|{{{....}))),,,|((((((((((((........{{{{(((((..{{...,}..)))))(((((({...))))))),,,,.......))))))))))))}}))))))))))))}})))}))}}.}||||(((((((((((......,{{{,.((,,,..(((((...})}}}..}}}}}}},,,,.))))))))),...(((((..((((..(((...(((((((((((............))))))).)))))...))).,..))))...))))).......,..........,.(((((.(((.((((.{(((......))}.})))).((((((((.((((({({,,.....},|,|.,.,,|.,{{((.{{.(((((((({.,,,{{{{(,,...}}}}}(((((....))))}.....,{(((({....)))))}....,,{,{{((,,,.(({..((((((...,{{{{......,(((((.(((((...........))))).)))))}},,|||||{{,{,,,.....(((((((.((.(((.....)))..)).)))))))....,.,,,.,))))).))))))..}}))})))}})))))))).,))))))))))))))))))))))).,,}}.........)))))}))))))))).)))))))(((((.....))))).,...(((((((((...)))))))))..,},{((((((((((.({........)).))))))))))}........((((((({....}))))))).....}})}}...}.))}))))).))).))))..))))...|||||..)}}}}..}})))}).((((((((((((((({,(((((......((((((.((((........(((((........)))))..)))).))))))....(((((((((....(((((((((((((((((((........)}}))))))))))))))))),((((((((((.(((((.(((((...((((((.......)))))).))))))))))...)))))))))))))))))))).,.((((.((((((((((((((..((((......,{{{....}}|.....,.......,,....,,,...,,....,,.,{|||....})}})....,.,..))))..)))))))....)))).))).))))....})))}))))))))))))))))......((((({....})))))}}}),}....)}))........({(((((.{{.((....))..)).))))))).((((((.(((((((((((......))))))}})))).)))))).|(((.((((((....((((((((((.{(({...}))}.)))))))))))))))).))),

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUCUUCCUCCCCCAGGGUUGUGGCCACGCGCAGCGGCGGCGGUUGUUCC… 6139 nt 0.3996
Summary

The p21 activated kinases (PAK) are critical effectors that link Rho GTPases to cytoskeleton reorganization and nuclear signaling. The PAK proteins are a family of serine/threonine kinases that serve as targets for the small GTP binding proteins, CDC42 and RAC1, and have been implicated in a wide range of biological activities. The protein encoded by this gene is activated by proteolytic cleavage during caspase-mediated apoptosis, and may play a role in regulating the apoptotic events in the dying cell. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly upregulated the PAK2 in oligodendrocytes, where it is associated with the regulation of the actin cytoskeleton pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].