Basic Information

Symbol
PAK3
RNA class
mRNA
Alias
P21 (RAC1) Activated Kinase 3 BPAK P21 Protein (Cdc42/Rac)-Activated Kinase 3 Serine/Threonine-Protein Kinase PAK 3 P21 (CDKN1A)-Activated Kinase 3 Oligophrenin-3 EC 2.7.11.1 Beta-PAK HPAK3 MRX30 MRX47 OPHN3 PAK-3 Adriamycin Resistance-Associated Mental Retardation, X-Linked 47 P21-Activated Kinase 3 EC 2.7.11 PAK3beta XLID30 ARA
Location (GRCh38)
X:110944285-111227361
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002578.5
Sequence length
9126.0 nt
GC content
0.4026

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2537.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2719.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2620.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001324330.2 NCBI
AGAGCAUCCUCAGCAGCUGCCACCGAAGCAGCCUCCUCCUUCUCUCUUC… 8956 nt 0.3986
NM_001324331.2 NCBI
ACCGCGGGCGGGCAGCUGUGCCAGCUAACCGUCUGGGAUCUCGCACUGG… 8978 nt 0.3992
NM_001324332.2 NCBI
ACCGCGGGCGGGCAGCUGUGCCAGCUAACCGUCUGGGAUCUCGCACUGG… 9129 nt 0.4027
NM_001324333.2 NCBI
ACCGCGGGCGGGCAGCUGUGCCAGCUAACCGUCUGGGAUCUCGCACUGG… 9104 nt 0.4028
NM_001324334.2 NCBI
ACCGCGGGCGGGCAGCUGUGCCAGCUAACCGUCUGGGAUCUCGCACUGG… 9059 nt 0.4019
NM_002578.5 NCBI
ACCGCGGGCGGGCAGCUGUGCCAGCUAACCGUCUGGGAUCUCGCACUGG… 9126 nt 0.4026
Showing 11 to 16 of 16 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a serine-threonine kinase and forms an activated complex with GTP-bound RAS-like (P21), CDC2 and RAC1. This protein may be necessary for dendritic development and for the rapid cytoskeletal reorganization in dendritic spines associated with synaptic plasticity. Defects in this gene are the cause of a non-syndromic form of X-linked intellectual disability. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2017]

Forensic Context

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