Basic Information

Symbol
PALLD
RNA class
mRNA
Alias
Palladin, Cytoskeletal Associated Protein SIH002 KIAA0992 CGI-151 Sarcoma Antigen NY-SAR-77 Palladin Myoneurin CGI151 PNCA1 MYN
Location (GRCh38)
4:168497052-168928457
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001166108.2
Sequence length
5858.0 nt
GC content
0.4423

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1666.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1778.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1455.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166108.2 NCBI
ACAGUUGCCUCAAAGUGACCACGGACCAGGCAGUCUCUAAUGAAUAGGC… 5858 nt 0.4423
NM_001166109.2 NCBI
ACACUCCGCGCACACGCGCCCCUCGGCGAGACGCGGCGCAUUCGCGCGC… 4951 nt 0.4399
NM_001166110.2 NCBI
CCGCGGAGCCCGCUGCAGCUCCCGCUCGCUCCGGACGCGGAAUCGGGCA… 4321 nt 0.4691
NM_001367567.1 NCBI
CCGCGGAGCCCGCUGCAGCUCCCGCUCGCUCCGGACGCGGAAUCGGGCA… 3695 nt 0.4133
NM_001367568.1 NCBI
CCGCGGAGCCCGCUGCAGCUCCCGCUCGCUCCGGACGCGGAAUCGGGCA… 3700 nt 0.4146
NM_001367569.1 NCBI
CCGCGGAGCCCGCUGCAGCUCCCGCUCGCUCCGGACGCGGAAUCGGGCA… 3649 nt 0.4135
NM_001367570.1 NCBI
CCGCGGAGCCCGCUGCAGCUCCCGCUCGCUCCGGACGCGGAAUCGGGCA… 3746 nt 0.4143
NM_016081.4 NCBI
ACAGUUGCCUCAAAGUGACCACGGACCAGGCAGUCUCUAAUGAAUAGGC… 5807 nt 0.4419
Summary

This gene encodes a cytoskeletal protein that is required for organizing the actin cytoskeleton. The protein is a component of actin-containing microfilaments, and it is involved in the control of cell shape, adhesion, and contraction. Polymorphisms in this gene are associated with a susceptibility to pancreatic cancer type 1, and also with a risk for myocardial infarction. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in humans identified PALLD as a diagnostic and prognostic biomarker for neonatal sepsis, with its protein found to be elevated in the serum of affected patients [Li et al. DOI:10.1038/s41598-025-99619-z].