Basic Information

Symbol
PAM
RNA class
mRNA
Alias
Peptidylglycine Alpha-Amidating Monooxygenase PAM-1 PAL PHM Peptidyl-Alpha-Hydroxyglycine Alpha-Amidating Lyase Peptidylglycine Alpha-Hydroxylating Monooxygenase Peptidyl-Glycine Alpha-Amidating Monooxygenase Pancreatic Peptidylglycine Alpha-Amidating Monooxygenase Peptidyl Alpha-Amidating Enzyme Peptidylglycine 2-Hydroxylase Peptidylamidoglycolate Lyase
Location (GRCh38)
5:102753981-103031149
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001177306.2
Sequence length
3990.0 nt
GC content
0.4594

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1252.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1323.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1404.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000919.4 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 3993 nt 0.4596
NM_001177306.2 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 3990 nt 0.4594
NM_001319943.1 NCBI
AUUUUCCUCUGCUUCUCUCAGGGCAGCUGGCGUGGCCACCUCGCAAGGC… 5976 nt 0.4557
NM_001364582.2 NCBI
CCAGUGUGAUUUCAGACAUCUGUAGCAAUGGAAGGUUCUGAAUGAUGAC… 5315 nt 0.4301
NM_001364583.2 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 5379 nt 0.4328
NM_001364584.2 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 5376 nt 0.4327
NM_001364585.2 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 5178 nt 0.4312
NM_001364586.2 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 5061 nt 0.4313
NM_001364587.2 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 5058 nt 0.4314
NM_001364588.2 NCBI
GCAGGCUCCGGCUUCCGUCCCGGACAGAGCCCGUGGUCGCGCAGGUUCU… 5055 nt 0.4313
Showing 1 to 10 of 19 entries
Summary

This gene encodes a multifunctional protein. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature enzyme. This enzyme includes two domains with distinct catalytic activities, a peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase (PHM) domain and a peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase (PAL) domain. These catalytic domains work sequentially to catalyze the conversion of neuroendocrine peptides to active alpha-amidated products. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes an isoform that is proteolytically processed. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

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