Basic Information

Symbol
PAN3
RNA class
mRNA
Alias
Poly(A) Specific Ribonuclease Subunit PAN3 Poly(A)-Nuclease Deadenylation Complex Subunit 3 PAB1P-Dependent Poly(A)-Specific Ribonuclease PAN2-PAN3 Deadenylation Complex Subunit PAN3 PAN Deadenylation Complex Subunit 3 PAN3 Poly(A) Specific Ribonuclease Subunit Homolog (S. Cerevisiae) PABP1-Dependent Poly A-Specific Ribonuclease Subunit PAN3 PAB-Dependent Poly(A)-Specific Ribonuclease Subunit PAN3 PAB-Dependent Poly(A)-Specific Ribonuclease Subunit 3 PAN3 Poly(A) Specific Ribonuclease Subunit Homolog PAN3 Poly(A) Specific Ribonuclease Subunit PABP-Dependent Poly(A) Nuclease 3 PAB1P-Dependent Poly(A)-Nuclease
Location (GRCh38)
13:28138207-28295335
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_175854.8
Sequence length
5590.0 nt
GC content
0.4179

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1630.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1737.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1390.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_175854.8 NCBI
ACCCGCCCAGGCUUUUAUCCGGCACCGGCAGCGUCUUCCUUUCCUCCCC… 5590 nt 0.4179
Summary

Contributes to poly(A)-specific ribonuclease activity. Predicted to be involved in nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening. Predicted to act upstream of or within deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA; positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly; and protein targeting. Part of PAN complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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