Basic Information

Symbol
PANX1
RNA class
mRNA
Alias
Pannexin 1 MRS1 UNQ2529 PX1 Pannexin-1 Innexin OZEMA7 OOMD7
Location (GRCh38)
11:94128828-94181968
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015368.4
Sequence length
2852.0 nt
GC content
0.4951

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-970.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1024.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 747.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015368.4 NCBI
GUACUUGGUUUCCCCGCAUGGUUCCGGAAGAGCGCGGCGCAGCUGGCUG… 2852 nt 0.4951
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the innexin family. Innexin family members are the structural components of gap junctions. This protein and pannexin 2 are abundantly expressed in central nerve system (CNS) and are coexpressed in various neuronal populations. Studies in Xenopus oocytes suggest that this protein alone and in combination with pannexin 2 may form cell type-specific gap junctions with distinct properties. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.