Basic Information

Symbol
PAPPA
RNA class
mRNA
Alias
Pappalysin 1 IGFBP-4ase PAPP-A ASBABP2 PAPPA1 DIPLA1 PAPA Insulin-Like Growth Factor-Dependent IGF Binding Protein-4 Protease Pregnancy-Associated Plasma Protein A, Pappalysin 1 Differentially Placenta 1 Expressed Protein Aspecific BCL2 ARE-Binding Protein 2 IGF-Dependent IGFBP-4 Protease Pappalysin-1 Insulin-Like Growth Factor-Dependent IGF-Binding Protein 4 Protease Pregnancy-Associated Plasma Protein A EC 3.4.24.79
Location (GRCh38)
9:116153791-116402321
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002581.5
Sequence length
10971.0 nt
GC content
0.4727

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3482.68 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3686.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3215.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002581.5 NCBI
AGAGCAUCUUUUGGGGGGAGGGAAUUCAGCGGAUCAGUCUUAAGAGGAG… 10971 nt 0.4727
Summary

This gene encodes a secreted metalloproteinase which cleaves insulin-like growth factor binding proteins (IGFBPs). Following IGFBP cleavage, insulin growth factors dissociate from IGFBPs and bind to IGF receptors, resulting in activation of the IGF pathway. The encoded protein plays a role in bone formation, inflammation, wound healing and female fertility. Enhanced expression of this protein is associated with diabetic nephropathy in human patients and this protein may promote tumor invasion and growth in various human cancers. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in human samples demonstrated that the PAPPA is a predicted target gene for two microRNAs, miR-141-3p and miR-497-5p, which were confirmed as markers for distinguishing menstrual from peripheral blood using TaqMan RT-qPCR [Li et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2017.05.012].