Basic Information

Symbol
PARP3
RNA class
mRNA
Alias
Poly(ADP-Ribose) Polymerase Family Member 3 PADPRT-3 ADPRT3 ARTD3 IRT1 HPARP-3 ADPRTL3 ADP-Ribosyltransferase (NAD+; Poly (ADP-Ribose) Polymerase)-Like 3 ADP-Ribosyltransferase Diphtheria Toxin-Like 3 Protein Mono-ADP-Ribosyltransferase PARP3 DNA ADP-Ribosyltransferase PARP3 NAD(+) ADP-Ribosyltransferase 3 Poly [ADP-Ribose] Polymerase 3 Poly(ADP-Ribose) Synthetase-3 NAD+ ADP-Ribosyltransferase 3 Poly[ADP-Ribose] Synthase 3 ADPRT-3 ADP-Ribosyltransferase (NAD+; Poly (ADP-Ribose) Polymerase)-Like 2 Poly(ADP-Ribose) Polymerase 3 Poly[ADP-Ribose] Synthetase 3 EC 2.4.2.- ADPRTL2 PARP-3
Location (GRCh38)
3:51942252-51948871
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001003931.4
Sequence length
2337.0 nt
GC content
0.5665

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-853.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -893.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 607.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001003931.4 NCBI
ACCGCGCGACCGGCAGAUGCGUGCUGCAGGCCCCGGCCACAUGAGCAGC… 2337 nt 0.5665
NM_001370239.1 NCBI
ACCGCGCGACCGGCAGAUGCGUGCUGCAGGCCCCGGCCACAUGAGCAGC… 2459 nt 0.5689
NM_001370240.1 NCBI
ACCGCGCGACCGGCAGAUGCGUGCUGCAGGCCCCGGCCACAUGAGCAGC… 2680 nt 0.5713
NM_005485.6 NCBI
ACCGCGCGACCGGCAGAUGCGUGCUGCAGGCCCCGGCCACAUGAGCAGC… 2342 nt 0.5666
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the PARP family. These enzymes modify nuclear proteins by poly-ADP-ribosylation, which is required for DNA repair, regulation of apoptosis, and maintenance of genomic stability. This gene encodes the poly(ADP-ribosyl)transferase 3, which is preferentially localized to the daughter centriole throughout the cell cycle. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A review of human multi-omics studies for biological age estimation, which synthesizes findings from numerous cited investigations, identifies the PARP3 as a gene whose expression is positively associated with aging in whole blood samples from a cohort of healthy people [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].