Basic Information

Symbol
PBLD
RNA class
mRNA
Alias
Phenazine Biosynthesis Like Protein Domain Containing MAWDBP MAWBP Phenazine Biosynthesis-Like Domain-Containing Protein MAWD-Binding Protein FLJ14767 Phenazine Biosynthesis-Like Protein Domain Containing Unknown Protein 32 From 2D-Page Of Liver Tissue Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Epididymis Secretory Protein Li 306 MAWD Binding Protein EC 5.1.-.- HEL-S-306
Location (GRCh38)
10:68282657-68334114
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022129.4
Sequence length
2588.0 nt
GC content
0.4293

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-736.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -785.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 722.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((((((.....))))))))))..((((....(((((..((((................))))..)))))))))...(((((((((........((((((((((............)))))...((((.........))))....((((((..(((((((((((((((.(((((((.......)))))))(((((((........)))))))(((((((.((...((((((((.((.(((((((((((...))))).(((((((((((.((((((......((((((((((.((((((.........))))((((((......)))))).....)).))))))))))..(((...(((......((((((.(((((((((....)))))).((((((.(((........((((((((......))))).(((((...)))))...((..((((.(((.(((((((((.................))))))))))))...(((((((.((((.(((.....))).))))...))))))).((((((((((..((((((((((((((((((((((.((.((.((....))(((((...)))))...)).)).))))))))........)))).......))))))))))...))))))))))))))..)).....)))......))).))))))...((((((..(((((..((....))..)))))...)))))).((((...)))).)))))))))........)))..)))..(((((..........)))))..((((.(((...(((.((((((((..((((((((.......)))))......)))((((.....))))((.((((......)))).)).)))))))).)))))).))))((((((((.((..((((((...)))))).))........((((.(((((((((((((((.(((.(((.(((....((((...))))))).)))...)))..)))..)))))).)))))))))))))))))))))))).)))))....))))))...)))))).)).))))))))))))))))).......(((((.((..(((((........)))))..(((((((((((.....(((....)))...))))))).))))...(((((((((...........((((((((.......))))))))...........)))))...)))).(((((.(.((((((((((.((((....))))))))).)).))).).))))).)).)))))........)))).............)))))).)))))(((((....))))))))))).)))))........))))))))).((.((((((..(.((((...((((((.((.((....(((((((..............)))))))))))..)))))).....)))).)..)))))))).....((((((.....((((((......(((((((((((((((((((((((.((((.((((........)))).))))))..((((((....))))))((((.((((((((((....((((.((.....))))))..........((.((((.(((((((.........))))))).)))))).)))))))))).))))............((((((((....)))))).))..(((......)))))))))))))).........((((((....))))))....(((((....)))))........(((((((..(.((...(((((((.((((..((((....((((((((((((..........))))))........)))))).))))..)))).))....)))))...))((((((((((.(.((((((.((....(((((...((.(((((((((((((((.(((((((..............((.(((....))).)).................(((((((((((...(((((((((..((((........))))....((..(((.......((((((....(((((....))).))...))))))......)))..))..)))))))))....(((((((......))))))).(((...)))((......))((((.....)))).............(((((((.((......)).))))))))))))))))))))))))).)))))))))...)))))).))...)))))...)).)))))).).)))))....)))))...(((((((............))))))).((((.((....)).))))....)..)))))))..(((((((((((((((((.....((((....))))((((((........))))))......((((.........))))))))))))).)))))))).......)))))))))).(((((((..(((..(((.((((((((((.((((....)))))).)))))))))))..)))..)))))))....))))))......)).))))...........))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((({(((((((((((.....))))))))))}.((((,..,(((((..((((,{....,.,,,,...|)}|}..}}}}|||||{(({{{({(({({,...(((((.(((((.(.(((((((((.((.((((((((((.........)))).((((((((,,....((((..(((....{((((((.......))))))|(((........}}},{((((((.(((.,({.(((..,((((((.,((.{{(((...})))),})}}))}))}.))),)})))))))))}..((((((((((.({((((.........))))((((((......)))))).....}).))))))))))...((({....}.))).}}}..))))....})}.)))))))))))))).)}((((....))))..(((((......))))).(((((...)))))..)))))))))}(((.((((((((({{..............}))))))))))))...(((((((.((((.(((.....))).))))...))))))).((((((((((..(((((((((({({{((((((((.(({((.{{....||{{{{|,..)}})).,.)).)).)))))))).,,,,...)))).......))))))))))...))))))))))))))).)))))...((((,,(({(,,....),)))((((((..(((((,.{{....}},.)))))...))))))..|||}...,,|{||,..||,|...,,.,,{({({{{({{,,((({{{.{{{{{.,,,,..,}}||||||}}.(((.((((((((..(((,{{{{,,,....,}})}......}}|((((.....)))}((.((((......)))).}).)))))))).))){{((||,,,}))}))..{{..|(((((...)))|||,|.,..{,,,.,,...},)))),,),))))).,,)))))))})))))))).....(((((({{....,},)))))){(((((({,{{(((({|(((((((((((..{{{{{|||||,|||.||||||...((((((((....(.(((,....,))).}))))))))...,,.{((((........)))))..{{{{|||||||,,,,,(({....))){{{|,,,,))}),,,..,|||{{||||...........{{|||{{{,}|,,,{||||||||{{.{{,.....|||||{{,||,,.((((,.{(((((((((((,((((.,,,|||||||,,..,}))..))))))).,||,|||||..,,,,(((({{,{{..............,.,(((((((((((.{..(((((((....(((((|....,))))),,,.,))))))),.|.}}}}|,...}|||||,{(({.{.{(,{((((((..............))))))))),).})))}},...,.|})}|}|})})}}}||}|,,.........,.,.,.......,,....)))..,,((((((((((({(.((((.((((........)))).))))}}..((((((....)))))}((((.((((((((((....(((,,((.....))))))..........{{.((((.(((((((..,......))))))).))))}}.)))))))))).)))),|{|...,},..,|||||{{.,,.}}}}})|}}..{{{......)}}))))))))))).,||.....((((((....||||}}....{{{||,,..},}}}..,,{{........,,..,,},}}}}.}}}}}))}|{{((,,,,..}}|||{{{,|{|....}}}.))))))))}}}{,,,,||{|,{(((((..{{|||||..,||||||{{||,,,{{((((((.,.{{{{{{.{{.,..{((((,{.((.(((((((((((((((.(((((((..............{(.(((....})).},................,{{((({((((({,.{{(((((((,.((((...,,...}|||...|||..,,|,,...,.((((((.,{.(((((....))).)).,,))))))}}}.))))),,},..))|}||}}}....(((((((......))))))).,,,})))),((......))((((.....)))).............{((((((.((......)).)))))))})))))}}}}}))))))).))))))))}..,)))))).)).,,)))))..})}.}}}}}},|.}}}}}}...,|||....(((((((............))))))).||||,||}}},}}.})))}|||||.,...,,,..{((((((((((((((((.....{(({....}}},((((((........))))))......{{{{.........}))}))))))))))}}))))))}}}}.......}}}.,.}}))}))|,))|)))|,|}|||||||{{{,(({{{{{.}}},}}.)))))))))},,}))..})))))))...,.}))))})))}))))})).)},........,}))))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001033083.2 NCBI
AGAAUUACAAAGGAGGCCGUCUGCCUCCUUUGUCCUGGAUUUGGGAGUU… 1225 nt 0.4686
NM_022129.4 NCBI
AGAAUUACAAAGGAGGCCGUCUGCCUCCUUUGUCCUGGAUUUGGGAGUU… 2588 nt 0.4293
Summary

Enables identical protein binding activity. Involved in maintenance of gastrointestinal epithelium. Acts upstream of or within with a positive effect on negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway. Located in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025] CIViC Summary for PBLD Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the PBLD was identified as a commonly upregulated gene in the prefrontal cortex of drug-naive SHR/NCrl rats, an animal model of ADHD, when compared to WKY/NCrl and Wistar control strains [Dela Pena et al. DOI:10.1111/Gbb.12388].