Basic Information

Symbol
ARSA
RNA class
mRNA
Alias
Arylsulfatase A ASA Cerebroside-Sulfatase Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Metachromatic Leucodystrophy EC 3.1.6.8 EC 3.1.6 MLD
Location (GRCh38)
22:50622754-50628177
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000487.6
Sequence length
4294.0 nt
GC content
0.5990

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2036.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2104.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1294.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000487.6 NCBI
GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… 4294 nt 0.5990
NM_001085425.3 NCBI
GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… 4189 nt 0.5978
NM_001085426.3 NCBI
GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… 4141 nt 0.5962
NM_001085427.3 NCBI
GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… 4096 nt 0.5947
NM_001085428.3 NCBI
GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… 3904 nt 0.5920
NM_001362782.2 NCBI
GAGGCGGAAGCGCCCGCAGCCCGGUACCGGCUCCUCCUGGGCUCCCUCU… 3859 nt 0.5903
Summary

The protein encoded by this gene hydrolyzes cerebroside sulfate to cerebroside and sulfate. Defects in this gene lead to metachromatic leucodystrophy (MLD), a progressive demyelination disease which results in a variety of neurological symptoms and ultimately death. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

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