Basic Information

Symbol
ARSB
RNA class
mRNA
Alias
Arylsulfatase B ASB N-Acetylgalactosamine-4-Sulfatase EC 3.1.6.12 G4S MPS6
Location (GRCh38)
5:78777209-78986087
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000046.5
Sequence length
4852.0 nt
GC content
0.4720

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1567.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1655.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1464.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000046.5 NCBI
AUUCUAUCAGCGGUACAAGGGGCUGGUGGCGCCACAGGCGCUGGGACCG… 4852 nt 0.4720
NM_198709.3 NCBI
AUCCUCCCAGGGCAACUUGAAAGUAACCGCACCUUCCAAAGGGCACCGU… 2187 nt 0.5391
Summary

Arylsulfatase B encoded by this gene belongs to the sulfatase family. The arylsulfatase B homodimer hydrolyzes sulfate groups of N-Acetyl-D-galactosamine, chondriotin sulfate, and dermatan sulfate. The protein is targeted to the lysozyme. Mucopolysaccharidosis type VI is an autosomal recessive lysosomal storage disorder resulting from a deficiency of arylsulfatase B. Two alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ARSB was significantly altered in expression on day 7 following a 20% total body surface area burn injury [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].