Basic Information

Symbol
PCK2
RNA class
mRNA
Alias
Phosphoenolpyruvate Carboxykinase 2, Mitochondrial PEPCK2 PEPCK Phosphoenolpyruvate Carboxykinase [GTP], Mitochondrial EC 4.1.1.32 PEPCK-M MtPCK2 Phosphoenolpyruvate Carboxykinase 2 (Mitochondrial) Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Phosphopyruvate Carboxylase PEP Carboxykinase
Location (GRCh38)
14:24094053-24110598
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004563.4
Sequence length
2179.0 nt
GC content
0.5888

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-902.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -940.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 385.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001018073.3 NCBI
GUGGCUCGCUUCGCCGCGCUCCCUCCUUCCCCGCCUUCCAUACCUCCCC… 1869 nt 0.5602
NM_001291556.2 NCBI
GUGGCUCGCUUCGCCGCGCUCCCUCCUUCCCCGCCUUCCAUACCUCCCC… 2013 nt 0.5936
NM_001308054.2 NCBI
GUGGCUCGCUUCGCCGCGCUCCCUCCUUCCCCGCCUUCCAUACCUCCCC… 2590 nt 0.6042
NM_004563.4 NCBI
GUGGCUCGCUUCGCCGCGCUCCCUCCUUCCCCGCCUUCCAUACCUCCCC… 2179 nt 0.5888
Summary

This gene encodes a mitochondrial enzyme that catalyzes the conversion of oxaloacetate to phosphoenolpyruvate in the presence of guanosine triphosphate (GTP). A cytosolic form of this protein is encoded by a different gene and is the key enzyme of gluconeogenesis in the liver. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.