Basic Information

Symbol
PCLAF
RNA class
mRNA
Alias
PCNA Clamp Associated Factor KIAA0101 NS5ATP9 OEATC-1 PAF15 PCNA-Associated Factor P15(PAF) Hepatitis C Virus NS5A-Transactivated Protein 9 Overexpressed In Anaplastic Thyroid Carcinoma 1 HCV NS5A-Transactivated Protein 9 PCNA-Associated Factor Of 15 KDa P15PAF PAF PCNA-Clamp-Associated Factor P15/PAF OEATC1 OEATC L5
Location (GRCh38)
15:64364304-64387687
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014736.6
Sequence length
2132.0 nt
GC content
0.4109

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-606.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -647.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 623.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001029989.3 NCBI
CCUUGUCCAGUGAAACACCCUCGGCUGGGAAGUCAGUUCGUUCUCUCCU… 1969 nt 0.4083
NM_014736.6 NCBI
CCUUGUCCAGUGAAACACCCUCGGCUGGGAAGUCAGUUCGUUCUCUCCU… 2132 nt 0.4109
Summary

Enables chromatin binding activity and molecular adaptor activity. Involved in several processes, including DNA metabolic process; centrosome cycle; and response to UV. Located in centrosome; nucleus; and perinuclear region of cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PCLAF is a marker for cycling myeloid cells and is upregulated in a neutrophil-like monocyte cluster (C9) enriched following clodronate pre-treatment and controlled cortical impact brain injury, correlating with a proliferative phenotype and neuroprotective outcomes including reduced lesion volume and improved cerebral blood flow [Gudenschwager Basso et al. DOI:10.1186/s12974-024-03032-8]. In human skin wound healing, the PCLAF is identified as a marker for cycling myeloid cells [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013].