Basic Information

Symbol
PCM1
RNA class
mRNA
Alias
Pericentriolar Material 1 PTC4 Pericentriolar Material 1 Protein HPCM-1 PCM-1 Pericentriolar Material 1, PCM1 RET/PCM-1
Location (GRCh38)
8:17922746-18029996
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006197.4
Sequence length
8652.0 nt
GC content
0.3925

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2230.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2384.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2394.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001315507.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8628 nt 0.3929
NM_001315508.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8160 nt 0.3917
NM_001352632.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8781 nt 0.3936
NM_001352633.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 9103 nt 0.3946
NM_001352634.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8664 nt 0.3924
NM_001352635.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8968 nt 0.3938
NM_001352636.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8607 nt 0.3940
NM_001352637.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8604 nt 0.3939
NM_001352638.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8849 nt 0.3947
NM_001352639.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8499 nt 0.3926
Showing 1 to 10 of 32 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a component of centriolar satellites, which are electron dense granules scattered around centrosomes. Inhibition studies show that this protein is essential for the correct localization of several centrosomal proteins, and for anchoring microtubules to the centrosome. Chromosomal aberrations involving this gene are associated with papillary thyroid carcinomas and a variety of hematological malignancies, including atypical chronic myeloid leukemia and T-cell lymphoma. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2015]

Forensic Context

A study in mice and humans using single-nucleus RNA sequencing identified the PCM1 as a protein marker for cardiomyocyte nuclei, utilized as an antibody target to isolate cardiomyocyte nuclei for sequencing analysis following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].