Basic Information

Symbol
PCM1
RNA class
mRNA
Alias
Pericentriolar Material 1 PTC4 Pericentriolar Material 1 Protein HPCM-1 PCM-1 Pericentriolar Material 1, PCM1 RET/PCM-1
Location (GRCh38)
8:17922746-18029996
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006197.4
Sequence length
8652.0 nt
GC content
0.3925

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2230.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2384.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2394.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352640.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8490 nt 0.3928
NM_001352641.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8475 nt 0.3930
NM_001352642.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8494 nt 0.3925
NM_001352643.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 5451 nt 0.4098
NM_001352644.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8487 nt 0.3927
NM_001352645.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8824 nt 0.3936
NM_001352646.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8463 nt 0.3931
NM_001352647.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8395 nt 0.3927
NM_001352648.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8803 nt 0.3941
NM_001352649.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8466 nt 0.3932
Showing 11 to 20 of 32 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a component of centriolar satellites, which are electron dense granules scattered around centrosomes. Inhibition studies show that this protein is essential for the correct localization of several centrosomal proteins, and for anchoring microtubules to the centrosome. Chromosomal aberrations involving this gene are associated with papillary thyroid carcinomas and a variety of hematological malignancies, including atypical chronic myeloid leukemia and T-cell lymphoma. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2015]

Forensic Context

A study in mice and humans using single-nucleus RNA sequencing identified the PCM1 as a protein marker for cardiomyocyte nuclei, utilized as an antibody target to isolate cardiomyocyte nuclei for sequencing analysis following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].