Basic Information

Symbol
PCM1
RNA class
mRNA
Alias
Pericentriolar Material 1 PTC4 Pericentriolar Material 1 Protein HPCM-1 PCM-1 Pericentriolar Material 1, PCM1 RET/PCM-1
Location (GRCh38)
8:17922746-18029996
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006197.4
Sequence length
8652.0 nt
GC content
0.3925

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2230.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2384.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2394.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352650.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 9106 nt 0.3945
NM_001352651.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8701 nt 0.3933
NM_001352652.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8584 nt 0.3921
NM_001352653.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 8989 nt 0.3934
NM_001352654.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 5169 nt 0.4092
NM_001352655.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 5322 nt 0.4096
NM_001352656.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 5506 nt 0.4096
NM_001352657.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 5671 nt 0.4087
NM_001352658.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 5334 nt 0.4083
NM_001352659.2 NCBI
ACAAUGAGAUCCUAAGAUGGCGGUGGCUGCGGCGGUUGGCGCUGCGUAG… 2128 nt 0.4262
Showing 21 to 30 of 32 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a component of centriolar satellites, which are electron dense granules scattered around centrosomes. Inhibition studies show that this protein is essential for the correct localization of several centrosomal proteins, and for anchoring microtubules to the centrosome. Chromosomal aberrations involving this gene are associated with papillary thyroid carcinomas and a variety of hematological malignancies, including atypical chronic myeloid leukemia and T-cell lymphoma. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2015]

Forensic Context

A study in mice and humans using single-nucleus RNA sequencing identified the PCM1 as a protein marker for cardiomyocyte nuclei, utilized as an antibody target to isolate cardiomyocyte nuclei for sequencing analysis following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].