Basic Information

Symbol
PCMTD1
RNA class
mRNA
Alias
Protein-L-Isoaspartate (D-Aspartate) O-Methyltransferase Domain Containing 1 Protein-L-Isoaspartate O-Methyltransferase Domain-Containing Protein 1 FLJ10883
Location (GRCh38)
8:51817575-51900042
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_052937.4
Sequence length
4044.0 nt
GC content
0.3422

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-965.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1052.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 930.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286782.1 NCBI
AGAUGGGGGCGUCUCCCGGCCUUGUUGACUUUGGCGUCCGCGGGGAGCU… 3697 nt 0.3554
NM_001286783.2 NCBI
ACUCGGCGGUGGCGUCCGUGUUGUUAUUGUGGUGGUAGCGGCGUCUGGC… 3834 nt 0.3459
NM_001363193.1 NCBI
ACUCGGCGGUGGCGUCCGUGUUGUUAUUGUGGUGGUAGCGGCGUCUGGC… 1341 nt 0.3766
NM_052937.4 NCBI
ACUCGGCGGUGGCGUCCGUGUUGUUAUUGUGGUGGUAGCGGCGUCUGGC… 4044 nt 0.3422
Summary

Enables ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity. Involved in protein ubiquitination. Part of Cul5-RING ubiquitin ligase complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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