Basic Information

Symbol
PCOLCE
RNA class
mRNA
Alias
Procollagen C-Endopeptidase Enhancer PCPE1 Procollagen C-Proteinase Enhancer 1 PCPE Procollagen, Type 1, COOH-Terminal Proteinase Enhancer Type I Procollagen COOH-Terminal Proteinase Enhancer Type 1 Procollagen C-Proteinase Enhancer Protein Procollagen COOH-Terminal Proteinase Enhancer 1 Procollagen C-Endopeptidase Enhancer 1 PCPE-1
Location (GRCh38)
7:100602334-100608175
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002593.4
Sequence length
1516.0 nt
GC content
0.6187

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-602.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -629.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 335.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002593.4 NCBI
GAUUAUCCUGCUGCUGCCGCCACCGCUGCUGCUGCUCUGCAAAAUUCAG… 1516 nt 0.6187
Summary

Fibrillar collagen types I-III are synthesized as precursor molecules known as procollagens. These precursors contain amino- and carboxyl-terminal peptide extensions known as N- and C-propeptides, respectively, which are cleaved, upon secretion of procollagen from the cell, to yield the mature triple helical, highly structured fibrils. This gene encodes a glycoprotein which binds and drives the enzymatic cleavage of type I procollagen and heightens C-proteinase activity. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

The literature review notes that the PCOLCE is a protein marker showing loss post-mortem in bone, contributing to post-mortem interval estimation in late PMI studies [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].