Basic Information

Symbol
PCSK1N
RNA class
mRNA
Alias
Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 1 Inhibitor ProSAAS SgVIII BigLEN SAAS SCG8 PEN Proprotein Convertase 1 Inhibitor Pro-SAAS Granin-Like Neuroendocrine Peptide
Location (GRCh38)
X:48831088-48835632
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013271.5
Sequence length
1025.0 nt
GC content
0.7424

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-531.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -547.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_013271.5 NCBI
GCAGCCUCGCCAGCUCGCCCCGGCACUGCGCACUUGCCAGCCAGUCCGC… 1025 nt 0.7424
Summary

The protein encoded by this gene functions as an inhibitor of prohormone convertase 1, which regulates the proteolytic cleavage of neuroendocrine peptide precursors. The proprotein is further processed into multiple short peptides. A polymorphism within this gene may be associated with obesity. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the PCSK1N mRNA was significantly downregulated in circulating T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881]. A study in rats demonstrated that the PCSK1N transcript was differentially expressed in the hypothalamus during hypothermia, with 23 tags in control samples versus 7 tags in hypothermic samples, identifying it as an RNA marker for hypothermic diagnosis [Takamiya et al. DOI:10.1016/J.Jflm.2012.04.017].