Basic Information

Symbol
PCSK2
RNA class
mRNA
Alias
Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 2 PC2 Neuroendocrine Convertase 2 KEX2-Like Endoprotease 2 SPC2 NEC2 Prohormone Convertase 2 EC 3.4.21.94 NEC 2 Proprotein Convertase 2 EC 3.4.21 NEC-2
Location (GRCh38)
20:17226107-17484578
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002594.5
Sequence length
4691.0 nt
GC content
0.4632

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1449.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1534.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1291.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001201528.2 NCBI
AACUAGCACCCUCGCUGUCCUUGUGCAGUGGAACGUCCCCAGGUCUGAG… 4674 nt 0.4688
NM_001201529.3 NCBI
GCUCUUUCUCUCCGGUACACACAGCUCCCCACAUUCGCACCCCUGCCCG… 4586 nt 0.4616
NM_002594.5 NCBI
GCUCUUUCUCUCCGGUACACACAGCUCCCCACAUUCGCACCCCUGCCCG… 4691 nt 0.4632
Summary

This gene encodes a member of the subtilisin-like proprotein convertase family, which includes proteases that process protein and peptide precursors trafficking through regulated or constitutive branches of the secretory pathway. The protein undergoes an initial autocatalytic processing event and interacts with a neuroendocrine secretory protein in the ER, exits the ER and sorts to secretory granules, where it is cleaved and catalytically activated during intracellular transport. The encoded protease is packaged into and activated in dense core secretory granules and expressed in the neuroendocrine system and brain. This gene encodes one of the seven basic amino acid-specific members which cleave their substrates at single or paired basic residues. It functions in the proteolytic activation of polypeptide hormones and neuropeptides precursors. Single nucleotide polymorphisms in this gene may increase susceptibility to myocardial infarction and type 2 diabetes. This gene may also play a role in tumor development and progression. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic cocaine treatment altered the expression of numerous microRNAs in the nucleus accumbens and at striatal synapses, with the miR-8 family being highly enriched and regulated at synapses [Eipper-Mains et al. DOI:10.1261/Rna.2775511].