Basic Information

Symbol
PCTP
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylcholine Transfer Protein STARD2 StAR-Related Lipid Transfer (START) Domain Containing 2 StAR-Related Lipid Transfer Protein 2 START Domain-Containing Protein 2 PC-TP StARD2
Location (GRCh38)
17:55751051-55842830
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021213.4
Sequence length
1972.0 nt
GC content
0.4792

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-649.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -688.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 538.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001102402.3 NCBI
CUAAGGGUGUCCGCGGCCUGCCCUCCAGGCGGAGGAGCCCGGACUGCGG… 2205 nt 0.5016
NM_001330377.2 NCBI
CUAAGGGUGUCCGCGGCCUGCCCUCCAGGCGGAGGAGCCCGGACUGCGG… 2696 nt 0.4570
NM_001330378.3 NCBI
CUAAGGGUGUCCGCGGCCUGCCCUCCAGGCGGAGGAGCCCGGACUGCGG… 1009 nt 0.4916
NM_021213.4 NCBI
CUAAGGGUGUCCGCGGCCUGCCCUCCAGGCGGAGGAGCCCGGACUGCGG… 1972 nt 0.4792
Summary

Enables phosphatidylcholine binding activity and phosphatidylcholine transporter activity. Involved in phospholipid transport. Predicted to be located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.