Basic Information

Symbol
PDCD4
RNA class
mRNA
Alias
Programmed Cell Death 4 H731 Programmed Cell Death 4 (Neoplastic Transformation Inhibitor) Neoplastic Transformation Inhibitor Protein Programmed Cell Death Protein 4 Nuclear Antigen H731 Protein 197/15a Nuclear Antigen H731-Like
Location (GRCh38)
10:110871795-110900006
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014456.5
Sequence length
3481.0 nt
GC content
0.3818

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-936.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1001.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1115.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199492.2 NCBI
AGAGACUCUCCGAGGCGGCGGCAGAGACAGAAGAGCGGGGUCGGGGCCG… 3439 nt 0.3815
NM_014456.5 NCBI
AGAGACUCUCCGAGGCGGCGGCAGAGACAGAAGAGCGGGGUCGGGGCCG… 3481 nt 0.3818
NM_145341.4 NCBI
AGAGACUCUCCGAGGCGGCGGCAGAGACAGAAGAGCGGGGUCGGGGCCG… 3565 nt 0.3804
Summary

This gene is a tumor suppressor and encodes a protein that binds to the eukaryotic translation initiation factor 4A1 and inhibits its function by preventing RNA binding. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2010] CIViC Summary for PDCD4 Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that spinal cord injury (SCI) alone did not change the expression of the PDCD4 mRNA, but five days of post-injury cycling exercise significantly decreased its expression [Liu et al. DOI:10.1016/j.expneurol.2010.08.032].