Basic Information

Symbol
PDE10A
RNA class
mRNA
Alias
Phosphodiesterase 10A CAMP And CAMP-Inhibited CGMP 3',5'-Cyclic Phosphodiesterase 10A DJ416F21.1 (Phosphodiesterase 10A) 3',5' CAMP/CGMP Phosphodiesterase Phosphodiesterase 10A1 (PDE10A1) Phosphodiesterase 10A7 (PDE10A7) EC 3.1.4.17 LINC00473 HSPDE10A PDE10A19 EC 3.1.4 ADSD2 IOLOD
Location (GRCh38)
6:165327287-165988117
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001385079.1
Sequence length
9334.0 nt
GC content
0.4274

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2811.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2986.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2230.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130690.3 NCBI
AGCAGUAGUCACCGCGGCGGCGGUGGCAGCGGCGGCGGGCGGCGGCGGC… 8373 nt 0.3877
NM_001385079.1 NCBI
AGUGGGCGUCUUCUGCCGCCGCCGCCACCACCGCCUCCACGGGCAGCGG… 9334 nt 0.4274
NM_006661.4 NCBI
AGCAGUAGUCACCGCGGCGGCGGUGGCAGCGGCGGCGGGCGGCGGCGGC… 8501 nt 0.3875
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the cyclic nucleotide phosphodiesterase family. It plays a role in signal transduction by regulating the intracellular concentration of cyclic nucleotides. This protein can hydrolyze both cAMP and cGMP to the corresponding nucleoside 5' monophosphate, but has higher affinity for cAMP, and is more efficient with cAMP as substrate. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PDE10A is a primate-specific, female-specific driver of stress resilience [Xu et al. DOI:10.1016/J.Biopsych.2020.05.004].