Basic Information

Symbol
PDE3A
RNA class
mRNA
Alias
Phosphodiesterase 3A CGI-PDE CGMP-Inhibited 3',5'-Cyclic Phosphodiesterase 3A CGMP-Inhibited 3',5'-Cyclic Phosphodiesterase A Cyclic GMP-Inhibited Phosphodiesterase A CGMP-Inhibited CAMP Phosphodiesterase Phosphodiesterase 3A, CGMP-Inhibited EC 3.1.4.17 CGI-PDE A CAMP Phosphodiesterase, Myocardial CGMP-Inhibited CGI-PDE-A EC 3.1.4 HTNB
Location (GRCh38)
12:20368537-20688583
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000921.5
Sequence length
12486.0 nt
GC content
0.4004

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3528.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000921.5 NCBI
GCUAGUCUCUCGGUCUGGCUCUCUCUCCGACGGGACUUAGCAACUUCUU… 12486 nt 0.4004
NM_001244683.2 NCBI
AGUCUAACAGAAUCUGAACUUUAAAGAACAUCUCAUUACUGAUUAUACA… 10820 nt 0.3621
NM_001378407.1 NCBI
GCUAGUCUCUCGGUCUGGCUCUCUCUCCGACGGGACUUAGCAACUUCUU… 12180 nt 0.3972
NM_001378408.1 NCBI
GCUAGUCUCUCGGUCUGGCUCUCUCUCCGACGGGACUUAGCAACUUCUU… 12627 nt 0.4014
NM_001378409.1 NCBI
AGUCUAACAGAAUCUGAACUUUAAAGAACAUCUCAUUACUGAUUAUACA… 4090 nt 0.4570
Summary

This gene encodes a member of the cGMP-inhibited cyclic nucleotide phosphodiesterase (cGI-PDE) family. cGI-PDE enzymes hydrolyze both cAMP and cGMP, and play critical roles in many cellular processes by regulating the amplitude and duration of intracellular cyclic nucleotide signals. The encoded protein mediates platelet aggregation and also plays important roles in cardiovascular function by regulating vascular smooth muscle contraction and relaxation. Inhibitors of the encoded protein may be effective in treating congestive heart failure. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

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