Basic Information

Symbol
PDE4D
RNA class
mRNA
Alias
Phosphodiesterase 4D DPDE3 CAMP-Specific 3',5'-Cyclic Phosphodiesterase 4D 3',5'-Cyclic-AMP Phosphodiesterase 4D PDE43 Phosphodiesterase 4D, CAMP-Specific (Dunce (Drosophila)-Homolog Phosphodiesterase E3) Phosphodiesterase 4D, CAMP-Specific (Phosphodiesterase E3 Dunce Homolog, Drosophila) Phosphodiesterase E3 Dunce Homolog (Drosophila) CAMP-Specific Phosphodiesterase PDE4D6 Phosphodiesterase 4D, CAMP-Specific CAMP-Specific Phosphodiesterase 4D Testicular Tissue Protein Li 136 EC 3.1.4.53 EC 3.1.4.17 EC 3.1.4 ACRDYS2 HSPDE4D PDE4DN2 STRK1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_001104631.2
Sequence length
8160.0 nt
GC content
0.4006

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2205.63 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2366.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2417.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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GGAUUCAAUACUUGUUGCAAUAAUUGCCCACGAUAGCUGCUCAAACAAG… 8147 nt 0.3767
Showing 1 to 10 of 17 entries
Summary

This gene encodes one of four mammalian counterparts to the fruit fly 'dunce' gene. The encoded protein has 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity and degrades cAMP, which acts as a signal transduction molecule in multiple cell types. This gene uses different promoters to generate multiple alternatively spliced transcript variants that encode functional proteins.[provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in human brain samples using RNA-seq data and machine learning identified the PDE4D as one of 99 key genes for classifying Major Depressive Disorder (MDD) and its suicidal subtype (MDD-S) [Verma & Shakya DOI:10.007/s11571-021-09724-8]. The PDE4D was found to be involved in the morphine addiction pathway, and a Random Forest classification model utilizing these genes achieved a test accuracy of 61.11% for distinguishing between control, MDD, and MDD-S groups.