Basic Information

Symbol
PDE5A
RNA class
mRNA
Alias
Phosphodiesterase 5A CGMP-Specific 3',5'-Cyclic Phosphodiesterase Phosphodiesterase 5A, CGMP-Specific EC 3.1.4.35 CGB-PDE PDE5 CGMP-Binding CGMP-Specific 3',5'-Cyclic Nucleotide Phosphodiesterase CGMP-Binding CGMP-Specific Phosphodiesterase CGMP-Specific Phosphodiesterase Type 5A CGMP-Specific Phosphodiesterase PDE5A2 Phosphodiesterase Isozyme 5 EC 3.1.4 CN5A
Location (GRCh38)
4:119494397-119628804
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001083.4
Sequence length
6959.0 nt
GC content
0.3765

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1826.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1959.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1851.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001083.4 NCBI
GUCGAAAGCCGGCCCGACUGGAGCAGGACGAAGGGGGAGGGUCUCGAGG… 6959 nt 0.3765
NM_033430.3 NCBI
GUCCUUUUGGAGGCGGCUGCGCAGCGGGCAGUCGGGGCGCUCGUGGGAA… 7262 nt 0.3925
NM_033437.4 NCBI
GAGUCCACGGGACAGCCCAAAGGCAACAUGACGGAACCUUGCCAAAAGA… 6720 nt 0.3670
Summary

This gene encodes a cGMP-binding, cGMP-specific phosphodiesterase, a member of the cyclic nucleotide phosphodiesterase family. This phosphodiesterase specifically hydrolyzes cGMP to 5'-GMP. It is involved in the regulation of intracellular concentrations of cyclic nucleotides and is important for smooth muscle relaxation in the cardiovascular system. Alternative splicing of this gene results in three transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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