Basic Information

Symbol
PDE7A
RNA class
mRNA
Alias
Phosphodiesterase 7A HCP1 High Affinity 3',5'-Cyclic-AMP Phosphodiesterase 7A CAMP-Specific Phosphodiesterase 7A High Affinity CAMP-Specific PDE 1 TM22 High Affinity CAMP-Specific 3',5'-Cyclic Phosphodiesterase 7A Phosphodiesterase Isozyme 7 EC 3.1.4.53 EC 3.1.4.17 EC 3.1.4 PDE7
Location (GRCh38)
8:65714334-65842529
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001242318.3
Sequence length
6961.0 nt
GC content
0.4407

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2402.34 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2531.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1587.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001242318.3 NCBI
GUGAAUUACGCCGGGCUCGCGCCGGCGGCGGAGUGAAGUCAGGCUCCGG… 6961 nt 0.4407
NM_002603.4 NCBI
AGUCAGUGUCCCCUCUCUUUUGCCUCGGGACAGCUGGUAUUUAUCAGAC… 6443 nt 0.4080
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the cyclic nucleotide phosphodiesterase (PDE) family, and PDE7 subfamily. This PDE hydrolyzes the second messenger, cAMP, which is a regulator and mediator of a number of cellular responses to extracellular signals. Thus, by regulating the cellular concentration of cAMP, this protein plays a key role in many important physiological processes. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2011]

Forensic Context

A study in humans using RNA sequencing of peripheral blood from Chinese individuals identified the PDE7A as a differentially expressed gene overlapping with previously reported age-related genes [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373]. Another study analyzing human dried blood stains and whole blood RNA-Seq data from European and U.S. populations noted the PDE7A was previously found to be associated with age in blood [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102976].