Basic Information

Symbol
ASB15
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat And SOCS Box Containing 15 Ankyrin Repeat And SOCS Box Protein 15 FLJ43370 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Ankyrin Repeat And SOCS Box-Containing 15 ASB-15
Location (GRCh38)
7:123567010-123639481
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001290258.2
Sequence length
4605.0 nt
GC content
0.3963

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1167.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1252.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1298.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001290258.2 NCBI
AGAUACACAGAAGCACACAUUGGCUCCAGGGCACUUCCUCUGAUUUAGG… 4605 nt 0.3963
NM_080928.4 NCBI
AGGAUAAAUCCUGAUGAUUCUCUCAGGGACCUCUAGUAGAUUAGCUCAA… 2760 nt 0.4149
Summary

This gene encodes a member of the suppressor of cytokine signaling box superfamily. The proteins in this superfamily participate in the ubiquitin-proteasome system for the degradation of proteins in the cell cycle and signal transduction pathways. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.