Basic Information
Symbol
PDE8A
RNA class
mRNA
Alias
Phosphodiesterase 8A
HsT19550
High Affinity CAMP-Specific And IBMX-Insensitive 3',5'-Cyclic Phosphodiesterase 8A
CAMP-Specific Cyclic Nucleotide Phosphodiesterase 8A
EC 3.1.4.53
EC 3.1.4.17
Location (GRCh38)
15:84980440-85139145
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_002605.3
Sequence length
4036.0 nt
GC content
0.4576
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1196.38 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1278.37 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
963.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCCUCUCAGGGUCGCUCCAGGGCCGCGCUAGGAAAGGUGUGGACGGUCG… | 3762 nt | 0.4304 | |
| GCGGCCGAGGCGAGCCCGGCGAUGUGAGAGGCGGCCGUCGGCUCCUGCC… | 4036 nt | 0.4576 | |
| CCGCCGCCGCCGCAGCGCCCGCACCGCGAUAAAAGGGGCGGCCGCGUUU… | 3793 nt | 0.4495 |
Summary
The protein encoded by this gene belongs to the cyclic nucleotide phosphodiesterase (PDE) family, and PDE8 subfamily. This PDE hydrolyzes the second messenger, cAMP, which is a regulator and mediator of a number of cellular responses to extracellular signals. Thus, by regulating the cellular concentration of cAMP, this protein plays a key role in many important physiological processes. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Jul 2011]
Forensic Context
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