Basic Information

Symbol
PDS5B
RNA class
mRNA
Alias
PDS5 Cohesin Associated Factor B AS3 Androgen-Induced Proliferation Inhibitor KIAA0979 CG008 APRIN Androgen-Induced Prostate Proliferative Shutoff-Associated Protein AS3 Sister Chromatid Cohesion Protein PDS5 Homolog B FLJ23236 PDS5, Regulator Of Cohesion Maintenance, Homolog B (S. Cerevisiae) Androgen Induced Inhibitor Of Proliferation Androgen-Induced Shutoff 3
Location (GRCh38)
13:32586315-32778022
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015032.4
Sequence length
7472.0 nt
GC content
0.3643

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1892.62 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2043.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1851.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015032.4 NCBI
GCCAUUUUGAAGCGGAGAGGAGGAGGAACGGCAGGGCUGGCUGCGGAAG… 7472 nt 0.3643
Summary

This gene encodes a protein that interacts with the conserved protein complex termed cohesin. The cohesin complex holds together sister chromatids and facilitates accurate chromosome segregation during mitosis and meiosis. This protein is also a negative regulator of cell proliferation and may be a tumor-suppressor gene. [provided by RefSeq, Jul 2015]

Forensic Context

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