Basic Information

Symbol
PDYN
RNA class
mRNA
Alias
Prodynorphin PENKB ADCA Neoendorphin-Dynorphin-Enkephalin Prepropeptide Beta-Neoendorphin-Dynorphin Preproenkephalin B Proenkephalin-B Preprodynorphin Leu-Enkephalin Leumorphin Rimorphin SCA23 Spinocerebellar Ataxia 23 Beta-Neoendorphin Dynorphin
Location (GRCh38)
20:1978757-1994285
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024411.5
Sequence length
2556.0 nt
GC content
0.4906

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-881.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -928.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 591.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001190892.1 NCBI
AUCCCAGUCGAGAUCCAUUGCAAAGCAUUGCAGAAUGUCGAUCCUCUUC… 2588 nt 0.4826
NM_001190898.3 NCBI
CAUUUGAAGGGGCUUUGGUGGUGUUCACAGCUGCCUCUUUGGCACCUCC… 2553 nt 0.4904
NM_001190899.2 NCBI
AGAAUCCGCCCCCUCCCCAACACGGCUGCCUUCCUCCUCCACAUCCCUG… 2740 nt 0.4964
NM_001190900.1 NCBI
AGACCAGUGAGAGACUGCUCUUUGGACUCUCCCUUUCUGCACAGUCCUG… 2487 nt 0.4805
NM_024411.5 NCBI
CAUUUGAAGGGGCUUUGGUGGUGUUCACAGCUGCCUCUUUGGCACCUCC… 2556 nt 0.4906
Summary

The protein encoded by this gene is a preproprotein that is proteolytically processed to form the secreted opioid peptides beta-neoendorphin, dynorphin, leu-enkephalin, rimorphin, and leumorphin. These peptides are ligands for the kappa-type of opioid receptor. Dynorphin is involved in modulating responses to several psychoactive substances, including cocaine. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

A study in cynomolgus macaques demonstrated that acute methamphetamine administration significantly increased hippocampal PDYN mRNA expression, while chronic administration significantly decreased it compared to controls [Choi et al. DOI:10.1016/j.taap.2018.05.031]. In human postmortem brain tissue, PDYN was identified as a striatal marker enriched in the nucleus accumbens of unaffected comparison subjects relative to those with opioid use disorder [Seney et al. DOI:10.1016/j.biopsych.2021.06.007].