Basic Information

Symbol
ASB5
RNA class
mRNA
Alias
Ankyrin Repeat And SOCS Box Containing 5 Ankyrin Repeat And SOCS Box Protein 5 ASB-5 Ankyrin Repeat And SOCS Box-Containing 5 SOCS Box Protein ASB-5
Location (GRCh38)
4:176213673-176277571
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_080874.4
Sequence length
3031.0 nt
GC content
0.3669

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-734.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -796.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 765.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001410863.1 NCBI
UUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCAGAGACAAGUUCUCACUAUGUUGCCCAG… 3237 nt 0.3642
NM_080874.4 NCBI
ACCAGCUGAUAUUUUCUUUCCUCAGGACCAGCUGUUCAGGAGCAUCCCG… 3031 nt 0.3669
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the ankyrin repeat and SOCS box-containing (ASB) family of proteins. They contain ankyrin repeat sequence and SOCS box domain. The SOCS box serves to couple suppressor of cytokine signalling (SOCS) proteins and their binding partners with the elongin B and C complex, possibly targeting them for degradation. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described for this gene but their full length sequences are not known. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.