Basic Information

Symbol
PDZRN4
RNA class
mRNA
Alias
PDZ Domain Containing Ring Finger 4 LNX4 IMAGE5767589 PDZ Domain-Containing RING Finger Protein 4 Ligand Of Numb Protein X 4 SEMACAP3-Like Protein DKFZp434B0417 FLJ33777 Similar To SemaF Cytoplasmic Domain Associated Protein 3 SAMCAP3L SEMCAP3L
Location (GRCh38)
12:41188320-41574745
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001164595.2
Sequence length
4102.0 nt
GC content
0.4910

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1352.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1426.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 951.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164595.2 NCBI
AUCACACCUCCCACCCGCCACCUCCCUCCACUGCCGCCGCCGCGAGACG… 4102 nt 0.4910
NM_013377.4 NCBI
AAGAUACUUAGGGAAAGCGAAGAAGAGCAUGCUGCUACACACCACUCUG… 3398 nt 0.4353
Summary

Predicted to enable zinc ion binding activity. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PDZRN4 was upregulated during long-term weight loss (0 to 12 months) in weight losers, with its expression pattern showing an opposite direction in acquired obesity when validated in BMI-discordant monozygotic twin pairs [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].