Basic Information

Symbol
PEX14
RNA class
mRNA
Alias
Peroxisomal Biogenesis Factor 14 Peroxisomal Membrane Anchor Protein PEX14 Peroxisomal Membrane Protein PEX14 Peroxin-14 Peroxisomal Membrane Anchor Protein Pex14p NF-E2 Associated Polypeptide 2 PTS1 Receptor Docking Protein PTS1 Receptor-Docking Protein DJ734G22.2 PBD13A Pex14p NAPP2
Location (GRCh38)
1:10472288-10630758
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004565.3
Sequence length
1922.0 nt
GC content
0.6160

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-804.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -837.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 506.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((.....)).)))(((((.((((((((.........((((.((((((...((.(((......)))))...)).)))).))))(((((.(.(((..((((..((((((.................(((((((((((((((((....(((....((((......))))...((......((((((..((((..(((..(((...(((....(((((((.....)))))))..(((((....)))))..(((((..((((((....))))))...))))))))...))).))).))))))))))......))..))))))))....))))).)))).)))...((((.((((....))))))))))))))...))))..))).).)))))..........))))))))......(((((((.((....(((((((((.....(((((...((((((((((.((((..((((((((((((.((.(..((...))..).)).)))))))).)))).))))...))))))))))....(((((((......)))))))....(((((((.((((((....))))))((((........))))..............)))))))((((....)))).............(((((..............)))))...((((((((((...(((((((((((((((((..(((.(((((.((((....((((((((((((......))))....(((.(((((.(((((....(((.(.((((((......)))....(((.(..(((((((((((...((...((((((((..(.(((((((((.((.(((..((((..(((((...)))))....)))).))).)).(((.((((....)))).))).))))))))).)..)))))).))....)))))))).)))))..).)))..)))..).)))....)))))..)))..))..))))))).))))..)).)).)))))(((((...)))))))).)))).)))))))))((((((((((.((((((((.(.((((((((((((((.(((((..((.((.(((.(.....(((((((((((...(((((((.(((...(((((.(((((((.....(((((((((.(((((((((........))).))))........))..).))))))))....)))).))).)))))((((((((((((((..((((((.((((((((((((((((((((((....)))))...))))((((.((((((((.(((........)))..))).))))).)))).))))).))))))..))........((....))....(((((((((...((((((((((((((.(((.....)))))))))))))))))...)))).))))))))))))))).)))))...((......))..(.(((((((....))))))).).(((((.(((((.((.....)).))))))).))).)))))..))).))).))))...)))..((..((((.....))))..)).)))))))))))))).)))))))))))))))........(((((..(((((((((.....))))).))).)..)))))................)))))).))))))))).......((....))..))))))))))((.((((((((((((((((...((((...))))....))))))))).)))))))))...))))))))))))))((((......))))..(((.....))))))))))))))))))).)))))))...(((((.((((....)))).))))).....((.......)).....)))))...........(((((........)))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,...((({{.....}}.))),|,,..((((((((..,,{{,{,((((,{{{{,,.}}||{(((....,.})))....,}.)))),)))}(((((.(.(((..((((..((((((..,,{{,....}}},,.,,((((.{,,.,|,|||}..,,||....((((,....,))))...,,.{{..(((((((((({{,{{{.{.,{,{,..((({,..(((((((.....)))))))..||{{{,,,,)))))..,||||}.{(((((....)))))).))))}})))))..)).{{....(((((.(((((..{({(.....))))....))))))))))...)).,.(((,{((((....))))))))))))))...))))..))).).)))))..........))))))))......(((((((.((..,.(((((((({..,,.(((({...((((((((((.((((..((((((((((((.((.{..{,...,,..).)).)))))))).)))).))))...)))))))))).,..(((((((......)))))))....{{{{(((,((((((....))))))((((,,,,,,..|}}}.....,{{{,....,)))))}((((....)))).............{{{((...,........,,})))}...((((((((({...(((((((((((((((((,,(((,(((((.((((....{(((((((((((......|}}).,..(((.(({((.((((({.,((((,(.((,(((......))).}}.(((.(..(((((((((((,{.{{...({((((((..(.(((((((((,({.(((..((((..(((((...)))))....)))).))).)).(((.((((....)))).))).))))))))).)..)))))).}}...,)})))))).)))))..).)))..)))..)}))).,..))}))..)))..)).,)}}}})).))}),,)).)),))}}},{{,,...}}}},))}.)))).)))))))}|((((((((((.((((((({.(.((((((((((((((((((({..,{.((,(((.({....{((((((((((...(((((((.(((...{{({(.(((((((..,.,((((((((,.({{{{{{{|,,,,..||||,.((({....,,|||}|,,.}})))))),},.))))))}),)))||((((({((((((((..((((((.(,((((((((((((((((((((....)))))...))))((((.(((((((((((((....}}}))}..,}).))))).)))).))))).)))))),,|},,||....)}....)}....(((((((((...(((((((((((({{{(((.....)))))))))))))))))...)))).))))))))))))))))))}}).,,{,......}}.,{.(((((({....})))))),}.{((((.(((((.{(.....)}.))))))).))}.)))))},))).))),)))).,.))),,{{..((((,,...}))),,)).)))))))))))))).}))))))))))))))........(((((..,((((((((.....))))).))).)..)))))................)))))).})))))))).......,{....}...))))))))))((.((((((((((((((((..,((((...)))}.,..))))))))).))))))))).,})))))))))))))).|||},}..}))),,)))}..,..},})}})))))))))))))}))))))).,,((({{.{{{{.,,,)))}.}||||,,,{.{{{.......,..,..}))|)|||||}|.,,,{{{,,...,,..,))))}.,)).,,...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004565.3 NCBI
AGUCAGGCCUCAGAAAGAUGGCGUCCUCGGAGCAGGCAGAGCAGCCGAG… 1922 nt 0.6160
Summary

This gene encodes an essential component of the peroxisomal import machinery. The protein is integrated into peroxisome membranes with its C-terminus exposed to the cytosol, and interacts with the cytosolic receptor for proteins containing a PTS1 peroxisomal targeting signal. The protein also functions as a transcriptional corepressor and interacts with a histone deacetylase. A mutation in this gene results in one form of Zellweger syndrome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.