Basic Information
Symbol
PEX16
RNA class
mRNA
Alias
Peroxisomal Biogenesis Factor 16
Peroxisomal Membrane Protein PEX16
Peroxisome Biogenesis Factor 16
Peroxin 16
Peroxin-16
PBD8A
PBD8B
Location (GRCh38)
11:45909663-45918812
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
MANE select
Transcript ID
NM_004813.4
Sequence length
1668.0 nt
GC content
0.6343
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-743.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-769.99 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
432.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCAGGAAGCAGGGCGCCGCAGCCUGUCGUACGGUCCUUCUGUGGGUCUG… | 1668 nt | 0.6343 | |
| GCAGGAAGCAGGGCGCCGCAGCCUGUCGUACGGUCCUUCUGUGGGUCUG… | 1533 nt | 0.6380 |
Summary
The protein encoded by this gene is an integral peroxisomal membrane protein. An inactivating nonsense mutation localized to this gene was observed in a patient with Zellweger syndrome of the complementation group CGD/CG9. Expression of this gene product morphologically and biochemically restores the formation of new peroxisomes, suggesting a role in peroxisome organization and biogenesis. Alternative splicing has been observed for this gene and two variants have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans investigated gene expression in peripheral blood after gamma-hydroxybutyric acid (GHB) intake, evaluating several candidate genes including PEX16 [Mehling et al. DOI:10.1007/S00414-017-1609-3].