Basic Information

Symbol
PFKFB2
RNA class
mRNA
Alias
6-Phosphofructo-2-Kinase/Fructose-2,6-Biphosphatase 2 6-Phosphofructo-2-Kinase/Fructose-2,6-Bisphosphatase 2 6PF-2-K/Fru-2,6-P2ase 2 PFK/FBPase 2 Fructose-2,6-Bisphosphatase, Cardiac Isozyme 6PF-2-K/Fru-2,6-P2ASE Heart-Type Isozyme 6PF-2-K/Fru-2,6-P2ase Heart-Type Isozyme PFK-2/FBPase-2 PFKFB, Cardiac
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis

MANE select

Transcript ID
NM_006212.2
Sequence length
7073.0 nt
GC content
0.4340

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2165.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2299.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1943.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.....(((((((((......)))))....)))).....).)))))))))..(((((((.((...(((((((((..(((((((((.(((....(((((...(((((((((......)))))).))).........)))))...................(((((..........)))))....(((.(((((.(((((..(((((...((((.((((((((((....(((..((((((((.......))).)))))..(((((...........))))).....)))....))))))))))..(((....)))((((((((.(((((((...((((((.....((((.(((....(((((....))))).....))).)))).((((((((.....((..((((((.....)))(((((((((((..(((((...((((..(((...((((......))))...)))(((((((((((........))))........((......)).((..((((.(((...((((((.(((((((((((((..(((((....))))).)))))...)))))((.((((((..((((((.(.((.......(((((.(((((.(((.....))).))))).((((...))))...(((((..((.(..((..(((((..((.((...........)).))))))).))..)))..)))))...))))))).).))))))))))))..))..))).))))))...)))))))..)).)))))))......))))...)))))..)))...)))))))).)))..))..)).)))))).......))))))(((((((((((((((..(((((((((((((((.((((((..((((..(((((((((((((.(((..(((.....((((.((.(((((((.(....((((((((((((.((.(..((((..((((((......))))))........((((......(((.....)))......))))..((((((.((((((.(((((((((((((...((((.....))))...)))))))..)))))).).)).))).))))))..((((((...((((.((((......((((.............))))(((.(((((((((..((((((((..(((((.((((.(((((((((((......((((..(((((((((..(((....))))).))))).))..)))).(((..(((((...))))))))..)).))))))))).)))))))))..(((....))).)))))))).)))..((..((......))..))...)))))).))).)))).)))).)))))).........))))..)))...)))))...((((............)))).......)))))))...).))))))).))...)))))))..))))))))))))..........(((...)))..))))..)))).))))).).)).(((((((((..((((((((((.(((.(((((.(........).))))).)))((((((((..((.(((..(((......).))..)))....))..).)))))))((((.............)))).(((((((((.(((((..(((((.((.(((....((..((((.((...(((((((.((((..(((((..(((((.....)))))(.((((((((.....(((((((((((((((((................((((((((.(((..((....((((((..((((((((.....)))))))).............((((((((......)).....((((((........)))))).((((.((((.(((((((((..((((............))))..((((((.......))))))..))).)))))).))))))))..)))))))))))).))..))).))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))..))).((((((.((((......))))))))))...(((((((((((((((((((.......)))))..........(((.((((((((((((((..((((((...(.(((((...))))).)....))))))....)))).)........))))))))).))).)))))..)))))))))...((((((.(....((.....))).)))))).....((((((((.(((((((((...............)))).......))))))))))))).)))))))).)).)))).))...))).)).))))).)))))))))))..)))...((((.((((((((((...((((((((.........((((....))))...(((.....((((((((.((..((((((.((.(((...(((((((((..(((((.............(((((((..((((.(.(((((((((.(((((...))))).))))))))).).)))).)))))))((((((..((....))..))))))(((((((..........)))))))....(((.....))))))))..)))..))))))))))).))))))..)).)))))))).....))).((((((((((((((((.........)))).)))))).)))))).))))))))((((.((((((((.(((....((((((....((((.......((((((((((((.(.((((((((((((((.(((((((((((((((....((((.((.((((((((((((....).)))))))...))))((((((.........(((....))).........))))))...((((.....)))).....((((...((((((((..(((((.(((...))).)))))(((..((((((((....((((((.((((..((((((((..((((((((..((........))))))))))...((((((((...))))...))))....(((((.((((((((..(((((((((((.....(((((((..((((....)))).))))))).....((((((.(........).))))))))))).......)))))).(((((......)))))..))))))))...)))))((((((((((.((.((((((.(((((((((....((((((.(((((((((((((((((((((((((......((((.(((.......)))..))))..((..((((((((((((((((((((.((.......((((((..(((((((................((((((((.(((...))))))))))))))))))))))))..........((((((((((((.......))))...)))))..)))...(((((((.........))))))).....((((.....))))......((((....))))......((((((...))))))))))))))))).)))).)))))))..))(((((((((((((.....))).))))))))))((.(((((((.((((((.((((....)))).)))))).)))))))))..((((..((......))..)))))))).))))))))))))).(((........)))..............((((((((.......))))))))...))))))))))))))..(((....))).((((((((((((((...)))))))).)))))).)))))))))((((...)))).)))))).)).(((((......)))))...((((((((((....)))))))))).((((((((((((((............(.((((((.((((((.((((........)))))))))).)))))).).((((((.(((((.(((((...((((((((((.(((..((((..(((((((....(((((.((((((((((((((((((.((((..((((......))))..).)))))))).(((........)))...(((((..((((((...(((((((...(((((.(((((((..............)))))))...)))))..)))))))(((.(((((...)).))).)))(((.((.((.(((((....))))))).)))))..(((((((.(.(((((((.((....)).))))))).)...)))))))..)))))).)))))(((..((((........))))..))).((((....)))).......)))))))))))))...((((..((.....))..)))).......((((((.(((.(((..((((((((.......))))))))...))).))).(((((.....)))))..))))))........(((((...)))))(((((((.((((.......)))).)))))))..((((((.(((......)))))))))....))))).)))))))..)))).))).))))))))))....)))))..))))).))))))...((((((((....)))))))).)))))....)))))))))........((((((....(((((((((((((.....(((....)))...))))).)))).)))).))))))((((((....(((..((((.(((((((((.(((.........))))))....))))))..))))..)))....))))))(((((((((((((((((((((....((((((............(((((((.....))).)))).((((((((((.....((((((..(((.(((......)))))).))))))))))))))))....))))))...)))))..)))))))..((((.((.((((((((.......)))))))).)).))))((((((....)))))).(((.((((.((....((....))..)).)))).))).....)))))))))..))))))))))((((((.....))))))....((((.(((((((((.((((((((......)))))))).)))))))))..)))).))))))))..)))))))))).....)))))).))..))).....))))))))...)))).........((((((....))))))......))))))...)))))))))))))))..((((..(((((((((((((((((((....(((((..........)))))))))))))....))).))))))))..)))).......((((...((((((((...........((((((.(.((((.((((((.....)))))).)))).).)))))).............(((((((((((((..(((........((((((.......))))))..))).)))))..))))))))...))))))))))))....(((((((.(..((((((((.((..(........)..)).))))))))..).)))))))...)))))))))))))).).))))(((((((.....(((((...(((.(((((((((((.(((((...(((((..((.(((....((((((....(((.....)))...))))))...(((......)))(((......))).))).))..)))))...))))).((((((.((((.(((.((((.(((((...(((((((.(((......((((.((((((((((((...........))).))))))))).)))).....))).)))))))))))).))))..))).))))))))))..(((.((((((.(((....))).)))))).)))))).)))).))))))).))))).......)))))))))))))))........((.((((((......)))))).)).((((.((((((.((((.(((.(((.((..((.((((..((((....))))..)).)).....))..)).))).))).)))).)))))).))))....))))....))))))....))).)))(((((((((((.((((..((((((..((((((...)))))).((((((((((((.((((..(((((((((((............))))))..((((.((((((.(((((...(((((...((((((((........(((.....)))...(((((((....((((.....)))))))))))))))))))...)))))..((((........)))).(((((..((((.((((((((........)))))))).))))..))))).......))))))))))).)))).............))))).(((.....)))...)))).)))))).))))))..))))))...)))))))).)).))))).((((((....)))))).((((((...............))))))))))).)))).....))))))))))))))...)))))))))).)))))))))((((((((....))).))))).......((((((........))))))((((..(((((((..(((..(((((((.((.(((((((((....((((.(((((((..((.......((((((.........))))))...)).)).))))).))))......))..))))))).))))))))).))).....)))))))..)))).((((.((.......)).))))...))))))))...((.(((((...))))).))....(((((((((..((((....))))))))))))))))))..))))))))))))))).))))))).)))))))).))))...)))))...))))).))))).))).)))))))))).).)..)))))))))..)).)))))))....((((....(((((.(((((((((((((((.....(((((......))))).(((...((((((((..((((.(((((.....(((((....)))))...))))).))))..))).)))))))).)))))))...........))))))))..)))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({.....((((({(({{,,..,|}}}}.,..))}),,,.,).)))))))))..{((((((.((...(((((((((..{{(((((((.(((....(((((...(((((((((......))))))},)).........)))))...............,,..(((((..........)))))..|,(((.(((((.(((((..(((((...((((.((((((((((....(((..((((((({.,...,.|}}},,})),.(((((...,,......))))).,,,,}}}....))))))))))..{{{....}}}{{{{{{{{.||||{{{...{(({{{...,.((((.(((....{((((....))))|,,,,,||}.}}}}.{({{((,({,,{{,(,,{,((((,....}}}({((((((((({{(({{(,..{{||..|||}|.{{{|,|,,.,})}}.,,}}},{,||||||{{|}}.}}}}),}}........|||||}||||.|||,|.||,{|,,|,{{{{{|,|{.{(((((((((,,(((((....||}}}.)))}}...}}}||{{,((({{,..,|||||}||{{.,....,((.((((((({.(((,....}}}.}}}}}.|||,,,.,))}.|}|||||..|,},,}||,||||||,}||,||,},,,,.....}|.}}})))),}},.,,}.}))))},.,}),}.},.,.}|||}|||||}}.,)))}}}}}},}))),..,.,}}))}})}.)))}|},,,,}}}}})),,,))},},.}}},,,|}}}}}},.|}},,)),.}}.))))}},....,.))))}}(((((((((((((((,.(((((((((((((((,((((((..((((..(((((((((((((.(((..(((.....((((.((.(((((((.,....((((((({((((.{(((,.((({..{(((((......)))))}........((((......(((.....)))......))))..((((((.((((((.(((((((((((((...((((.....))))...)))))))..)))))).).)).))).))))))..,,{,{,.,||,,,.|{{{.{{{,{,...{(((,,,,({{(.{...{{,}|||,,,{((..((((((((..{((((.((((.(((((((((({{.....((((..((((((({({,({(....)))}}.))))).))..)))).{((..(((((...))))))))...)}))))))))).))))))))}..(((....))).)))))))).))}.,((|{(({{,,{.|,..,}...}}}|||,}}}.))}),,,}},)}))))}},.,,,..))))},)}}}}.))))),,.{(((..,.....,,..)))}....,,.)))))))...}.))))))).))...)))))))..)))))))))))))}........({{...,))..}}}}..)))).))))).,,}|.(((((((((..((((((((((.(((.((({(,(,,,.,,,,|,}||||.}}|((({{{((..((,(((,.((....,,,}.)}..})),...))..)}})))))}|,,,.||},.{,{{{{,(((((((((..,((.((.{.(((.....))}.})).)).(((((..(((((((,(((((.........,.}}}}}{{{.....,,,,((.((((((((.....(((((((((((((((((....,,,......,}|((((((((.{({{{(,....((((((..((((((((.....)))))))).............((((((((......)).....((((((........)))))).((((.((((.(((((((((,.((((............))))..((((((.......))))))..)))},))))).))))))))..)))))))))))),))..))}.))))))))))))))))))))))))))))))))).))|.((((((((((((((((((((((.............)))))))))))}.....(((((.......))))).......,})))))))).,...,,((((..((((((...,.(((((...))))).}....))))))....)))).}......}))),}))..)))))||{{|((.(((((({,{(((((..((((...(((.....)))((((((((((((((((((((.(((((((((...............,,,......,}))))))))))))).((,.(((....)))..,},,|,{({(({,.(((.....((((((.((((((((..(((((..(((((((....)))))(((((((((((((((({{.((((.((.((((((.((((.(((....((((((((((((......((((((......)))))).,......))))))))))))))))))}...)))))).))..)))}}|((((..{(((,,(((((((((((((((((.,.(((((((((((...}))))(((((((..........))))))).(((..(((((((((((.{(,((((({{(((((((((..((((.((((((({((((((,,....(((((((.....{..((((((((((....,,,,||||,{{(({(({..,,|,{{((((((.....(((({,......|{{{{{....{((({....}))}|....|||,||||..,.,|,.,,|{{{{({((,,{.,,{,,{{{|{,.,,,.{.{{..{(((((((....}.))))))}..|}{|{(|{{,......,{{{{{,..,|}}}..,{{{{{|,,}}},.,}||||}|||||,,,....,}}}||{{(({({{{{{{{((((.{((,,,|||,}||||({.,.,(({{{{{{...{{(((({{{((.{((({(.....{{{,{{({,{{.,|||.,,,}})))),,))..})|))}}|...,{{{{(((({,,,{,.{{(({.{{,||{{{..{((((((({{{.....(((((((.,((((,...,}}}.))))))).....{(((((,{.,,..,,,).))})))}))}}.......}}||||,(((((,,,...}}}||..,}||||||{.,|||}},,}}})}))},,)}..))))|{|||||||,|||||||{{{{((((,{{{{{{{{|||,|}))}}|}))}}}},(((((((.((((((((.(((({..,{({,(((,,,,,,|{{||{{{({,,,|,,,....((((((..(((((((....,...........((((((({,(((...)))))))))))))))))))))))).,,},,,..}}}})}.))))))....)).)))))))..)))}}}))},.(((((((.,.....,.))))))).....,|||}}}))})},,,|,}}||||...,)}})||,,|{((((({...}}}))))}}}}}}}}},.})))))}}))))}}))|||||||||||||}}}}{|||{.,,,,,,,))|}}(((((((.((((((.((((....)))).)))))).))))))).,..((((..((......))..)))),||{{||||||,,,))))}|||},.....,}}}}}}}}}......,}||||||{|.}}}}}}))||||,|,,...|||||||,,,,)).)})))}}}))}{(((((((((((({...}))))))).))))))..))))))))))......))))))}........))))),,).)))))))..((((((((({....}))))))))).((((({{(((((({.....,....,.{.((((((.((((((.((((........)))))))))).)))))).}.((((((.{((((.(((((...((((((((((.(((..((((..(((((((....,((((.((((((((((((((((({{((({..{{((,.....))))..}.)))))))).{((........}}}...((((..((((......))))..)))),....,{((((((,.{{{,,,..(((.(((((({(({((((..(((((,(((,,,{....,,}.)}).}})}}||||((|((.(((((....))))))).))|}},.{|{,...,,.,,),.,))))))))))))))))})))))))))||{.{(((.,(((((((((........))))))))).,))))}},((((....)))).......)))))))))))))...((((..(({...,))..))))..,{{{{((((((.(((.(((..((((((((.......))))))))...))).))).||||{,,,...}|||{.,,})))}..,..}}||((({{.||,,.(((((((.((((.......)))).))))))).,|,|,|}}}}}}}}}}.||||,,.))))..))))}.)))))))..)))).))).))))))))))....))))).}))))}.))))))...((((((((....)))))))).}}|||{,,,|||,}}|||,{(((....)))}..,}.,,{||||||||||...|.,||,...))},.}))))}|))}),||||{{{,(((((((((....(((.{((((.(((((({{{.(((.........))))))....))))))..))),}})))....))))))))}))).,|((((((((((((..{,((((((............(((((((.....))),,))),((((((((((.....((((((..(((.(((......)))))).)))))))))))))))).,..)))))),..)))))..))))))),.((((.((.((((((((.......)))))))).)).))))((((({....})))))))))..)))))))))},{....,,..{{,...}})||{{{{{{(((({{.,|,,,........(((({{.....,}},,,||||,,,,.|||||((((.{(((({,,...||||||||}}},|||||}}||,,|}}||...,,||||,}|}||||||},...,}|||||,,,.,|||||...,})))))),,..,}}},,,..,,,|{{{{{....}}}})).))))).)))))}})))))).)),.))))))))))).))).{(((((.((({...}))).))))))..{({{....)))).....))))))..}.))))))).)))))))))).)))).))))|(((((((((...........((((((.(.((((.((((((.....)))))).)))).).)))))).......,,....(((((((((((((..({{........((((((.......))))))..))).))))}..))))))))...)))))))))}......(((((((.{..((((((((.((.,(,....,,,)..)).))))))))..}.)))))))..........))))))))))).))))).{({.....,,.,,,..,{(((((((.(......).)))))))}(((.((((....{{((((((....((,.....}))...)))))).})....)))).))).....))..))))))))}}))))))))))....))).))))))..{(((({,....}))))}(((((((((.(((......((((.((((((((((((...........))).))))))))).)))).....))).)))))))))).....((((((.....(((((({.(......,)))))))))))))....)))))))))))))))).))}},,}))))))))).)))}})))...))))))))){{{{(,((.((((((..,,..||||||.}|.((((.((((((.((((.(((.(((,((,,({.((((..((((....))))..)).)).,,,,)}..,,.))).))).)))).)))))).)))),..}}}}||,,{|{|..{||||||.,,..{||,{||||||,,|||}}|||,,,..{{((((...))))}}.{,,|||||{{||}|||{.,{{{{({((({{..,,,.,,,,,.}}}}}|,.((((.{{((((.{{(({{{{,,|{{{({{{{,.{,{{|,,....||{,....}}}.,}||{||||..,(((((.....)))))}}}}}},{{{(((({{({((.,((((((........}}||{....}}}||{|.,||||||{.,,,,,|}))}}}}}|.}}}}.,}}|||{{{{{..,}}}}}))))),))|||||,,{.,,,...,}}},.|,||},}}})}}},))))|)|||||.,}|},,.,|||}},.}}))}}}}},.,)}))))),||||{{...,||||||,{{||||,..,,,,,,..,,,,))))}),))}}}......}})},,,,.,,},.,,,...)))))))))).)))))))))((((((((....))).))))).,,,..,((((((........))))))|{{{,,|{{{{{{,,{{{..{{{{|||}{{,{{{{{,{{{.,,,{{{(.(((((((..,({{.....((((((,,....,,.)))))),},,,.)).))))),))}},....||||,,}}}}}}.,}}})))))}))},,,}.}}}}}}},.}}},.{{{{.{{.......}).))},,,})))))))),..||.{{((({{{||,,,.))}}}}}|(((((((..((({....})))))))))))},)))).,))))))))))))))).))))))).))))))}},))))...)))))...))))).))))).))}.)}}))))))).}.,..)))))))))..)).))))))}....((((....{((((.(((((((((((((({.....(((((......))))).{{{...((((((((..((((.(((((..,..(((({....))))),,.))))).))))..))).)))))},),)))))))...........))))))))..)))))..))))

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGUCCCGGCCACAAGCUGUCGGCUCGGUUCGGUCGCGUUACAGGGCAGG… 3533 nt 0.4472
GGUCCCGGCCACAAGCUGUCGGCUCGGUUCGGUCGCGUUACAGGGCAGG… 7073 nt 0.4340
Summary

The protein encoded by this gene is involved in both the synthesis and degradation of fructose-2,6-bisphosphate, a regulatory molecule that controls glycolysis in eukaryotes. The encoded protein has a 6-phosphofructo-2-kinase activity that catalyzes the synthesis of fructose-2,6-bisphosphate, and a fructose-2,6-biphosphatase activity that catalyzes the degradation of fructose-2,6-bisphosphate. This protein regulates fructose-2,6-bisphosphate levels in the heart, while a related enzyme encoded by a different gene regulates fructose-2,6-bisphosphate levels in the liver and muscle. This enzyme functions as a homodimer. Two transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human patients identified PFKFB2 as the most up-regulated differentially expressed mRNA in acute myocardial infarction (AMI) through RNA-sequencing of peripheral blood samples, and this expression pattern was validated by qRT-PCR [Wang et al. DOI:10.2147/IJGM.S329391].