Basic Information

Symbol
PFKFB3
RNA class
mRNA
Alias
6-Phosphofructo-2-Kinase/Fructose-2,6-Biphosphatase 3 6-Phosphofructo-2-Kinase/Fructose-2,6-Bisphosphatase 3 6PF-2-K/Fru-2,6-P2ase Brain/Placenta-Type Isozyme Renal Carcinoma Antigen NY-REN-56 6PF-2-K/Fru-2,6-P2ase 3 PFK/FBPase 3 IPFK-2 Inducible 6-Phosphofructo-2-Kinase/Fructose-2,6-Bisphosphatase Fructose-6-Phosphate,2-Kinase/Fructose-2, 6-Bisphosphatase 6-Phosphofructo-2-Kinase/ Fructose-2,6-Bisphosphatase IPFK2 PFK2
Location (GRCh38)
10:6144928-6254644
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004566.4
Sequence length
4482.0 nt
GC content
0.5556

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1710.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1788.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1339.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145443.3 NCBI
GAGUCGCGGGGCUGCCGCUUGGACGUCGUCCUGUCUGGGUGUCGCGGGC… 4170 nt 0.5446
NM_001282630.3 NCBI
AGCGUGAUGCUACGGUUGCCUGGAGGCUGUACCGGACUUGUUUUUCAAA… 4326 nt 0.5425
NM_001314063.2 NCBI
AGCCAAGCCGGAGAGGAGGCGAGCAGCAGGGCCUGGUGGCGAGAGCGCG… 4505 nt 0.5556
NM_001323016.2 NCBI
GAGUCGCGGGGCUGCCGCUUGGACGUCGUCCUGUCUGGGUGUCGCGGGC… 4193 nt 0.5447
NM_001323017.2 NCBI
AGCCAAGCCGGAGAGGAGGCGAGCAGCAGGGCCUGGUGGCGAGAGCGCG… 4532 nt 0.5552
NM_001363545.2 NCBI
AGCCAAGCCGGAGAGGAGGCGAGCAGCAGGGCCUGGUGGCGAGAGCGCG… 2315 nt 0.5862
NM_004566.4 NCBI
AGCCAAGCCGGAGAGGAGGCGAGCAGCAGGGCCUGGUGGCGAGAGCGCG… 4482 nt 0.5556
Summary

The protein encoded by this gene belongs to a family of bifunctional proteins that are involved in both the synthesis and degradation of fructose-2,6-bisphosphate, a regulatory molecule that controls glycolysis in eukaryotes. The encoded protein has a 6-phosphofructo-2-kinase activity that catalyzes the synthesis of fructose-2,6-bisphosphate (F2,6BP), and a fructose-2,6-biphosphatase activity that catalyzes the degradation of F2,6BP. This protein is required for cell cycle progression and prevention of apoptosis. It functions as a regulator of cyclin-dependent kinase 1, linking glucose metabolism to cell proliferation and survival in tumor cells. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2016]

Forensic Context

A study in human patients demonstrated that the PFKFB3 PFKFB3, an mRNA, was downregulated in myocardial fibrosis versus acute myocardial infarction and upregulated in heart failure versus myocardial fibrosis, showing involvement in fructose and mannose metabolism and HIF-1 signaling pathways [Wang et al. DOI:10.3389/fcvm.2021.664044].