Basic Information

Symbol
PFKP
RNA class
mRNA
Alias
Phosphofructokinase, Platelet PFK-C PFKF ATP-Dependent 6-Phosphofructokinase, Platelet Type Phosphofructo-1-Kinase Isozyme C 6-Phosphofructokinase Type C Phosphohexokinase EC 2.7.1.11 ATP-PFK PFK-P 6-Phosphofructokinase, Platelet Type Phosphofructokinase, Platelet Type Phosphofructokinase 1 EC 2.7.1
Location (GRCh38)
10:3066333-3137723
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002627.5
Sequence length
2626.0 nt
GC content
0.5784

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1027.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1069.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 734.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.((((((((((((((.(((((((.(((.(((.((((((((.(((.((.(((....)))))((((((..((((((((..((....))....))))).)))....))))))((((..(((...))).))))..)))..)))))))).)))..)))...))..)))))))))))......)))))))))))))).....(((((((((..((((..((((......))))..))))..)))..(((((..(.((((....((((.((((.((..(((((((..((...((((((..((((((......))))))(.((((.(((((((((((((((...((((((((.......))))))))...(((..((((((((((......))))).))))).)))....(((((..(((((((((((((..(((.(.....((((((.....(((((((((.((............)).)))))))))..(((((((.((((((...((......))))))))((((((((..(((((((.......)))))))..(((((...))))).......))))))))(((..((((..((((.((((((.((......)).)))..........)))))))))))..))).......((((((((((..(((.((((((........)))))).)))..))))......))))))...)))))))..(((((.((((((.((.(.(.((((((.((((.((((((((((((..(.(((......))))..)))))))))))).((((((((((......(((....))).((((.........(((((...........((((((.((..((((..(((((..............................)))))...)))).)))))))))))))))))..))))))))))....((.(((((..((....))...)))))))....((((((.....))).))).......)))))))))).).))).)))))).)))))(((((....)))))..))))))...))))..))).))))).)))))...))))).....))))))))).)))))).)))).).(.((((((.(((((((((((.(((.(..(((((......((.(((..((..............))..)))))........)))))..).))).))))).........(((.((((((.......((...((((......))))...)).......)))).)).)))))))))...(((((....)))))(((((.(.....).))))))))))).)..(((((..(((.(((...))).)))..)))))((((.....))))...(((..((((((((((((......))))).).))))))..)))(((((.(((..(((....((((((.((((((.....))))(((....)))........(((.(((((((((......)))))..)))).)))((((((((((.((((((...........))).))).((((((((((((...((((((((..(((((((((((.(.(((.((..((....))..))))).).)))))))..((((((((((((((.((((...(((....)))...((((.((((((((((((((.........(((((((.......)))))))................(((((((.((.....)).)).)).))))))))))...)))))))))))....)))).))))))))).))).))..(((((....)))))..(((((((((((((((((..........))))).............))))))(((..(.(((((..(((((........)))))...))))).)..)))........)).))))))))..))))))))..((((....))))..(((((((.(((..(((.((.((..((((...(((.....)))....))))..))....)).)))))).))))))).......((.(((((((...(((((.((((((...)))))).(((((((.((((...((((((..............)))))))))).)))))))...)))))...........))))))).))................)))))))))))).)))))))))).(((((((..((..((((..((((.(((((((.((((...))).).)))))))...))))..))))..)).....))))))).......((.(((((....))))).))((..((((......((((((........))))))......))))..)).....))))))))...)))))).)))))))))))...))..)))))))))..)))))))))))).)..)))))(((.(..(((((.....(((((......))))).....))).))....).)))((((((.......))))))......(((....)))......))))))((((((..(((((...((((((.((((((((...)))))))))))))))))))..))))))..............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((.((((((((((((((.(((((((.(((.(((.((((((((.(((.((,(((....|}}|}((((((..((((((((..{{,,..}}.},.))))).)))....)))))){{{,,.{{{..,))),)})}..)))..)))))))).))},.)))...)}..)}})))))})),.,,,.)))))))))))))).....(((((({{...(({(,,({{{...{{(((((((...(((..((((((((..(.((((....((((.((({.((,.(((((((..((...(((((({,((((((,..,,,}}||||{{((((,(((((((({((((((,,.((((((((.......)))))))){{{,,,..(((((,,(((....,,,))))}}}))),}},....{{{{{..{{{{{({((((((.{(((.{{((({(((((((({,{(({((((,,.,||,{,||,|{.||||,||||||||}{{((((....,,||||}}.{(.....||||}||||(({{{{||,|(((((((.......))))))).,{{{{|.,,)))))}.....,})))))))|||.||{{{..{{|{.|||||,,{{,,|}}}}}}},|,{{|}.||.,||}||||||}|,.}}}.}}}}},||{||{((((..(((.((((((........)))))).)))..))))..,,..))))))},..,)))))}}|||||,((((((.({{(.(.((((((.((((.((((((((((((..{.(((......)))}..)))))))))))|.((((((((((...,,,(((,,..|||.((((|,.......{((({{(((....})}}{{|||,{,.,({{{..{((,,...,,...........}}..||}|}}},...}},...,||||,|}}}}}}})})))))))..)))))))))).}..((.(((((..((....))...)))))})|..,({{(((,...,))).})).,...,.)))))))))).).))).)))))).}},,,(((((....)))))..,}}}}|,,,})}},|,,.,|}}}},|}}}},..}|||}.....}}))))|}}||||}}|,||||{|{({(({(({{(,((.,{{,({{({({({.,,((({{({{.(({((({.{..{{{,.,.{{{,{{,,..|||{......}}})}}}}},}.))).)}))),,.,)}....||..))}})))))..,},}}},|||},,}..}))),...}.,)}.))))},}}},|||||}}}}..||||{{.,,.)}}||(((((,(.,,..|.))))))),}||,},,|{{||.,|||,(((...))),)))}.}))))}}}))..{(((((...))))))((((({(((({......))))).}.))))),.....(((((.{({..{{(|.,.((((((.({{{((,,,||}}}}||,}}}}))),.......(((.(((((((((......)))))..)))).)))((((((((((.{{{{((...{{......))),))).((((((((((((...((((((((..((((({(((((,(.(({.{{..{{,,,,)),,),}||,|.}}}}}}},,|{({((((((((((,{(((..,(((....|||,,,{{{,,((((((((((((((.........(((((((.......)))))))................{{(((((.((.....)).))}})}.}})))))))...))))))))))}....,,,}.))))))))),))).,,.||((({....))))}.,||||||(((((((((((,.........))))).............)))))){((..(.(((((..(((((........)))))...))))).)..))}........,}.,)}}))))..)))))))).,((({....}}}).,{((((((,({,.,.{{.{{.((..((((...(((.....)))....))))..))....)),})|})),}}}}||}.......{|,{{{{{||.,,|||{(.((((((...)))))).(((((((.((((...((((((..............)))))))))).))))))).,.)))))...|||..,},))))))).))................)))))))))))).)))))))))).(((((((..((..((((..((({.(((((((.((((...))).).)))))))...})))..))))..)).....))))))).......((.(((((....))))).))((..((((......((((((........))))))......))))..)).....)))))))),,.,},))).)))))))))))...))..))))))),,}})))))))))))).)..))))))))..)))...)))))))||{{......}}},,.......(({,....}}}..((((((.......))))))......|||}}}})))}....,))))))((((((..(((({.,,,(((((.{(((((((...)))))))})))))))))))..))))))...........,,,......,,,.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001410880.1 NCBI
AUUGCCUGCUGCGCACCCGGACGUGCGGCUCCCCUCGGCCUCCUCGCCA… 2779 nt 0.5793
NM_002627.5 NCBI
AUUGCCUGCUGCGCACCCGGACGUGCGGCUCCCCUCGGCCUCCUCGCCA… 2626 nt 0.5784
Showing 11 to 12 of 12 entries
Summary

This gene encodes a member of the phosphofructokinase A protein family. The encoded enzyme is the platelet-specific isoform of phosphofructokinase and plays a key role in glycolysis regulation. This gene may play a role in metabolic reprogramming in some cancers, including clear cell renal cell carcinomas, and cancer of the bladder, breast, and lung. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2016]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PFKP gene was downregulated in skeletal muscle of heavier co-twins in BMI-discordant monozygotic twin pairs, indicating its involvement in mitochondrial membrane transport in acquired obesity [van der Kolk et al. DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100226]. Separately, a study in humans identified the PFKP transcript as an important feature in a machine learning model for predicting multiple organ failure from blood samples collected within 24 hours of traumatic injury, where it was implicated in immune responses as a glycolysis regulator [Duran et al. DOI:10.1186/s13613-024-01364-5].