Basic Information
Symbol
PFN2
RNA class
mRNA
Alias
Profilin 2
Profilin II
Profilin-2
D3S1319E
PFL
Location (GRCh38)
3:149964904-150050788
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_053024.4
Sequence length
2047.0 nt
GC content
0.4172
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-564.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-606.61 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
502.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCUCCUCGCCGUCCGCGCUGCAGUGCGAAGGGCUCGAAGAUGGCCGGUU… | 1725 nt | 0.4162 | |
| GCUCCUCGCCGUCCGCGCUGCAGUGCGAAGGGCUCGAAGAUGGCCGGUU… | 2047 nt | 0.4172 |
Summary
The protein encoded by this gene is a ubiquitous actin monomer-binding protein belonging to the profilin family. It is thought to regulate actin polymerization in response to extracellular signals. There are two alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in cynomolgus macaques demonstrated that acute and chronic methamphetamine administration induced significant hippocampal volumetric atrophy and altered gene expression [Choi et al. DOI:10.1016/j.taap.2018.05.031]. In humans, analysis of blood gene expression profiles after severe burn injury identified the PFN2 as a temporal expression profile gene exhibiting a significantly increasing expression trend from 0 to 7 days post-burn [Wu et al. DOI:10.1016/j.burns.2018.08.022].