Basic Information

Symbol
ASGR1
RNA class
mRNA
Alias
Asialoglycoprotein Receptor 1 CLEC4H1 C-Type Lectin Domain Family 4 Member H1 Hepatic Lectin H1 HL-1 ASGP-R 1 ASGPR 1 ASGPR1 ASGPR
Location (GRCh38)
17:7172535-7179648
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001671.5
Sequence length
1310.0 nt
GC content
0.5939

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-517.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -538.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 252.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001197216.3 NCBI
ACACAGACACGCAGACACAGAGACACCGGGGCCCAGGGCCCUCCUAUGG… 1193 nt 0.5876
NM_001671.5 NCBI
ACACAGACACGCAGACACAGAGACACCGGGGCCCAGGGCCCUCCUAUGG… 1310 nt 0.5939
Summary

This gene encodes a subunit of the asialoglycoprotein receptor. This receptor is a transmembrane protein that plays a critical role in serum glycoprotein homeostasis by mediating the endocytosis and lysosomal degradation of glycoproteins with exposed terminal galactose or N-acetylgalactosamine residues. The asialoglycoprotein receptor may facilitate hepatic infection by multiple viruses including hepatitis B, and is also a target for liver-specific drug delivery. The asialoglycoprotein receptor is a hetero-oligomeric protein composed of major and minor subunits, which are encoded by different genes. The protein encoded by this gene is the more abundant major subunit. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.