Basic Information

Symbol
PGM2L1
RNA class
mRNA
Alias
Phosphoglucomutase 2 Like 1 BM32A Glucose 1,6-Bisphosphate Synthase FLJ32029 PMMLP Glucose-1,6-Bisphosphate Synthase Phosphoglucomutase-2-Like 1 EC 2.7.1.106 EC 2.7.1 NEDHFS
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_173582.6
Sequence length
8477.0 nt
GC content
0.3808

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2269.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2435.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2451.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.(.(..((.((...((((.....))))...))..))..)))))))).....((((((((((.(((((((((.(((.((........)))))))).)))))).....))).((((((((((((((((((.(((((....((((((((..((.(((.((((((((((.(((((((..((.(((.....(((......)))))).))....))))))).).)))..((((.(((((((((..(((((......))).....))..)))..))).))).)))).)))))).))).))...))))))((((.(((((((((.........))))...((((((.((((((.(((....))).)))..)))))))))......((((((.........(((((.........)))))......)))))).((((((((............)))))))).(((((.....)))))....(((((((...))))))).(((((((((((((((((((.(((((.((......)).))))).((((....(((((..(......)..))))).((((....)))).))))..((((((((((((((((((((((((((.((..(((((((.(((((..((((((((((((((((...(((..........))).))))))))))..))))))...(((((.(((((((((.........(((((..(((....)))..)))))...((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((((.(.((((((((((......((....)).((((..((....))..))))(((((....)))))((((((..((((((((..(((((((.......(((....(((...((((.((((((.....((((.((..((.((((..........(((((((........)))))))((((.....)))).))))))..)).))))..))))))...((((((.....)))))).....((((((.(((...(((.((.((((.((.(((((..(((....)))...))))).))))))(.((((....)))).).(((((((......(((((((((....(((.(((..((((((((.(((............)))...(((((...(((((((((............(((.....)))((.(((((((((((.(((.(((........((((...........)))).))).))).)))).))))))).))....(((((((((((.((((..((...(((...((((((..((....))..))))))..)))...)).)))).))).))))))))))))))))).)))))..))))))))...........(((((((((((((((((.(((...))).)))))))))((((.(.((((..(((((((..((((((.(((.((((.....(((((((((((.((((.......((((.(((((..........(((........))).........)))))..)))))))).))))))))))))))).))).....(((((.((....))..))))).)))))))))))))...)))).)))))(((...((((((...((((.....((((..(((.....)))..)))).....)))).....)))))).)))((...((((((.((((..(((((.....))))))))).)))))))).)))))))).((((((((...(((....(((((......))))).))).))))))))....(((((.....))))).((((........))))(((..(((......))))))...))).)))...)))))))))......)))))))...........)))))))).))))))(((((..(((((((..(((.............)))...))))))).)))))...))))..)))..(((.......))).))).....)))))))..))))))))..)(((....))).((((((((........((((((((((((.(((((((((((((((........))).)))...)))))))))(((((..((((((...........))))))..)))))((....))((((.((((((.((......((((((.(((((((((.((..(.((((((((((((.........(((....)))...((((((((........(((((....((.((((.(((.((((((.(((...(((((((....)))))))..))).)))))).)))...)))).))..)))))))))))))((((((....(((((((((((((...(((....)))(((((((((............(((((...........)))))..(((((..((((.........))))..))))).....)))))))))(((.((((...................((((((((((............................))))))))))....)))).)))(((((((((...(((((((...............)))).)))))))))))).)))))))))))))))))))((((((((..(((((((.((((.(((((......)))))))))..))))))).....(((((.....)))))..)))))))).)))))))))))).)..))))))))))).))))))...((((((((......))))))))((((((((((((..(((((((...(((((.((..((((((.((.....)).))))))..)))))))...((((((...((((.(((((((((((((..((((((((((..........)))))..))))).)))...........(((..((((((((((......((((....))))...)))))))))))))((((((((((....((((((((((....((((.(((((.............))))).))))....))))))))))))))))...))))....((((.......))))......................((((......))))..))))))..)).)).))))....)))))).((((((.(((.((((.......)))).)))))))))(((((((...........(((((........)))))))))))))))))))..))))))))))))..........((((((.....))))))..(((((((((.(((...............))))))))))))............)))))))))))).....))))))))))))((((((((...)))))))).....))))))))))))).))).))))))))))))))))))))((((((....))))))((..((((((((.(..((((...((((((((((...))))..)))))).......))))..)))))))))..))......((((((..(((((((((((((((((((((.(((((((((.((((..(((...(((.(.((((((.....)))))).).)))..))))))).)))))))).).))).......)))))))))))))....(((.....))).((((((((.(((...............(((((....)))))....))).))))))))..(((((((((.(((..(((((..(((((((((((((((((.(((((((.(((((.((.((((.(((((((...((...(((((...(((((((((((........)))))))...........))))...))))))).))))))))))))).)))))))))).))....................(((((.(((..((((((((((((..(((((((.((((.(((((((....((.((((((((((((.((((((((......(((((((((((((((((.((.((..............(((((((...((((..........)))).)))..)))).(((.....)))........................(((((((...((((((.(((....(((((((((.(.((((((.(((..((((((((...))))))))))))).)))).).)))))....(((.((((.(((((...((((((.((((.(((.(((.(((((((..((.(((.((((((.....((((((....)))))).....))))))))).))(((........))).((((...(((((((...((((((........)))))).......)))))))...)))).(((((...((((((((((((((((((((((((((.....))))))))))).))))))))))).))))...))))))))))..)).))).)))..))))))))))))))))))).))).)))).....))).))))))...))))))).(.((((.((((((((.........(((((.(((.............))))))))..)))))))).))))))).)).))))))).)))))).)))).......(((((((((((..((((((......((((((((((((...((((...((((((((....(((((.((((((((((((((((....(((.......((....))........))).....)))))))))..........((((((.(.(((...(((((((...((((........))))..((((((.((((.(((.(((((((((((...))).)))))...)))...)))...))))))))))..))))))).)))).))))))(((((....)))))))))))).))))))))))))).(((.....))).......))))))))).)))))))......))))))..)))).)))))))...((((((((....)))))))).....))))))))))))))))))))))..((((((((((........))))..........................((((((((....))))))))((.((((((((.(((((...(((((..((((..........))))..))))).....))))))))))))).)).......))))))..(((((.(((((((.....((..((((.....(((...(((.(((((((((.(((........((((.......))))))).))))))....))).)))..))).......))))..))..)))))))))))).............))))))).........((((((........)))))).....(((.((((.(((....))).)))))))(((((((((((((.(((((.(..((((((((((((((((.......))))))..(((((((((((...)))))))))))))))).....)))))..)))))).)))))).))))))).(((((.(((.((...........)).))).))))))))).)))))))((((((..........((((.((.((((((((.((.((...(((((((.((............((((((((((....))))))))))..........)).)))))))...)).)).)))))))))))))).)))))).....................(((((((((.......((((......)))).((((((((((((((((((..........)))))))...(((((((.(((((((....))))))).))..))))).(((........)))(((..(((.....))).))).....))))))))))).)))))))))(((((((((((((((..(((((((....)))))))))).((((((.((((....(((((((..((..(((((((..(((((..(((((............(((((((....)))))))......((((.((((((.(((........))))))))).)))))))))..))))))))))))..))..)))))))..(((((.((.......)).)))))........((((.((((((((.((((........)))))))))))).))))...)))).)))))).......((((.(((..((((.(((.........)))))))..)))..))))..)))))))))...)))))))))))))))..)))...)))))....((((.((((.((((.........)))))))).....)))).(((((......))))).............((((((.....)))))).)))))))))))).)))))..)))))..)))))))))))))))))))))))(((((....))))).((((((((.(((((......)))))))))))))............))))))))).)).))))...))))).))))).....(((.(((((((((((........((((((((((.(((....))))))...)))))))))))).)))))).)))...(((((((((..............))))).))))..((((((((.......))))))))...))))........))))))))))......))))).))))..)))..)).)))))..))))))))))......((((((.((((((.....))))))..((((((.......((((..((((...))))..)))).......))))))((.(((.((((...........)))).))).))))))))....................))))))))))).........(((((.((((((..........)))))).)))))..((((((((((((((((.(((((((((.(((.....((((((((((.(((...((((.....(((..((((.......))))..)))(((..((.((.(((((((((((........))))))))..))).)).))..)))...(((((((((((......((((((((.....)))))))).((((((.((((...)))).))))))........(((((((((((...........((((((((((...(((((((((((.....)))))).))))).....((((((..(((((..((((.....))))(((((......((((((((.....((((((...((.............))...)))))).....))))))))))))).........)))))..))))))(((...((((((...)))))).(((((((.............)))))))(((((((.......)))))))..((((..........)))).))).))))))))))..(((((....((((........)))).....)))))((((..((((((...((((((...(((((((..(((((...........)))))..)).))))).))))))......))))))..))))..................))))))...))))))))))))))))..((((((((((((((.(((((...((((.(.((((..((....(((((((((.((((((........)))))).)).....)))))))(((((.......)))))))..)))).).))))..))))).)))))))..)))))))......................((((((((((((...((((.........)))))))))).))))))......))))...)))...)))))))))).((((((((.......((((((((((((....)))))).))))))..((((((((........).))))))).((((..(((((...))))).))))..))))))))....(((((((.((((((((..........)))))))).)))))))............((((.....(((((........)))))..))))(((((((........((((.((((.(((.(((((...((((......)))).....))))).))))))))))))))))))..))).)))))......)))).)))))))))))..((((((((.......(((((....)))))......))))))))))))).)))))))))))))))))))((((((....((((.(((((((.((((((.((........)).)).))))....))))).)).)))).....))))))(((((.(((..........))))))))...))))).))))...............))...))))))))))))))))))).(((((((....(((((......)))))....)))))))..(((((((((.....(((........))).....))))))))).))))(((((...((((....))))...)))))...............))))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,((({({(,,{{,,,,,.(((({(.{,|||},.,,}||,}..},}}}})}|||.,((((.,|)))}|((((((((.(((.((.......,)})))))).)))))}....,|,,|||||((((((((((((((.(((((..,,({((((((..((.(((.(((((({(((.(((((((..{{.(((.....(((......}))}}}.)),,..))))))).),,)}..((((.(((((((((..{{(({,.,..,,,,.}.}.)),,))}..))).))).)))).)))))).))).))...))))))((((.(((((((((.........))))...((((((.((((((.(((....))).)))..)))))))))......((((((...,.....(((((.........)))))..,...)))))).((((((({...,{{....}})))))))}.(((((.....))))),...(((((((...)))))))((((((((((((((((((((.,,,,,.((,,....,}.|}}}}.{{{{|,,,(((((.,(......),.)))}|,((({....)))).,.,,,.,{(((({((({((((((((({(((((.((..(((((((.(((((..((((((((((((((((...(((..........))).)))))))))}..))))))...(((((.(((((((((,,,,,,,,,(({{(,,(((....|||..}}|||{{,((({((((((,((({{(.((((((({{{((({(((((((.({,...,{{{||||||{{||||||{{,{{{,..((((,,({,(|{{{,,((({{,,|(((((({({{,,({{{((({{({{(,,...,{,..,{{{{.......}})}}}.,||||,({({((,,,.,,.}}}}||,({{,,.....{(((((((........)))))))|{((,,..,||||{{|||,,..))})))),}.,,,,,,..((((((.....)))))}{{.,,,||||{((((...}}}}...((((.((.(((({..,((....})),..))))).)))))){.{{{|,..,}})),},,,,(((((..{{{,,....,,}}}.))))),{|..{{{{{||||||,..{,.,,,||{|{|||||||...||||{{,({((({{{((((((..{(((.....}}}|{.(((((((((((.(((.,((........((((...........)))),))).))).))))}}))))))||{.((.(((((((((((.((((..((...(({...((((((..((....))..))))))..}))...)).)))).))).)))))))).)).)}))))))))}}},},}))}}}}.......,,,,{{{,..((((,,(((...({{{{,,..))))),,,}}|,.}}}}||,}|||.,..,,{{,{(({(,,.,)),)}}..||||||||{((.||||,..,,,,(,,,.{{{{|}||}...,}}}}}}}}}..,||}.,{{{{{|||||||,.{||||||||,|}}}}))))))).)),}}}.}},)}))}}})}},}})))}||||..}}}|||{}|||||{|,,|}|||||||{{|.|||||,,}|||}}}|,|||}|.}|||,|..||.,}{||,|{{{{{.,,,,,{{{.,...((({,,{{({,..((((((.((({.,(((((,...,))))))))).))))))....,||{{{||{{((((((...(((....(((((......))))).))).))))))}|,,,{{((((.....}))}}.{{||...,,.,,}|||{{{,,{(({.,,,,||||||.{((.......,,.|||,,}||}.}}))),},}},...}}}}},}}}||||||||,|{|||(((((..(((((((..(((.............)))...))))))).}}}}|,{(((({{{..,{{{{(,,,,,,,{...,{{{..,,{.,|||(((.{....).)))(((((((....)).))))).}}}}||,,||||}||.....(((((((((((({{{,....,,,}}}.)))...)))))))))|||||,,|{{{{{.,|,.,,,,,.})))))}})))))|||,,.||.,{{|||}}|{{|{||{|||((((({.((((((({(,({.,{{(((({((((((({,.......||||,..}||||}||{((({{.,,,....{{{{|,|..((,((((,(((.({{(((,(((,,,(((((((....))))))},,,,,.,}))),.,}|,,,||||,||,|}}}|}}}}}}}}},|||,|.,..{{{{|||||{{{|,,,|||....|||(((({((({..,,,....,,|||||{...,,,...,.|}}},.,(((((,.((((.........)))),,)))))..,,.|||||||||,{.,{,({{{{{({{{,{{,.,,{{{{(((,,,||||}}}....,,.........,||,||||.,||}|||||},..}}}}},}}|((((((((((,..(((((((.....,.........)))).))))))))))))))})}}}}}}}}}}|||||{{{|{{{{|,,||{{{{{,{{{{.{{{{{..,,{{||||},,,,.,))))))},{,,.,((((|....}}},)},)))))))}})))}}}}}))))|}..},})))))))).))))))...((((((((......))))))))((((((((((((..(((((((...(((((.{{..((((((.({.....)}.))))))..},)))))...((((((.,,{{((.,((((((((({{(,((((((((({(.,......,{|||,,..))))}.,,,...........{{,..{(((((((((......((({....))))...))))))))))}}}((((((((((....((((((((((....((((.(((((.............))))).))))....))))))))))))))))...)))),,}}}}}},}})}.,|,||......,.}}...,........((((......))))..))))))},)).)),}}))....)))))).{((((,,(((..(((.......)))}.))))))))}(((((((...........(((((........)))))))))))))))))))..)))))))))))){{{{{{{{{.((((((.....))))))..(((((((({{(((...............)))))))))))),{,,..,},{{{{{|||||},,.......,,,,}||||,,(((((((({...})))))))},,|{|,,.|||||(((((((({,.,..,))))).))))|,..((((({....,))))){||,((((((((.(..((((.,{((((((((((...))))..))))))....,,.))))..)))))))))..}}.............,||{{|((((((((((((((((.(((((((((.((((..(((...(((.(.((((((.....)))))).).)))..))))))).)))))))).).))).......)))))))))))})}.}}{({.....))),|{(({{.....}))}............{{,.{|||||||||..|||}||||||||||..{{{(((((.,(((,,{{{((.,(((((((((((((({{,.|||{{{{.{{{{{.|{.{||{.((((({{..,|||..{{{{|,,,||||||{||||,})}}}|||||.}}.,,,,})))),,)))),},)))}}||.}}}})))))))),.))))}}}|||,}}...||||.............,||||}|||}|||||{|||||||,..||||,|}|||,.,,{{{{,....{{.{{{{||{||{||,||||{{||,....||||||{|{(|{{{((((,{...,..,..,,||.,,{|||,,,|,..,||||||||||,..}}|||,|}{{(((((.{({{(({{,,..,,,......,,...}},}}}}}}...))))))},}}))))}},,...}}}}|||||,|}||||}|,{{{,.|||||{{,,,.,))))))}))))},.,,,.}.},,))},.})))}}|||.}}})},,,,||||{.{{|{.,,,.|||}||{{{{{,,{,.(({{{{(({(,,,..{(((((....}}}}}},,,,.}}}}}}}}}.}|{{,{{.....}},}}||||||.{||||||,..||{|||},.,,},.}})))),,,.,,,))}}}||,{{||||.{{(((.,.((({((((((((((((((((((((((.....))))))))))).))))))))))).)))}...}}}}},})}}..,)})))}))),}))),}))))))}}}}}}}},}))}}}}}},,}.}})})})}}|||||||||||{({({{({((,,,|||}........,{(({{({{....,,..,,,,.}||||||||||}}}|}}},|}}},},,}||}||}}}}.}}}),,,})}}}|||,,.(((((((((((..((((((.,,,..((((((((((((...{((({..{{||||{{..,.(((((.((((((((((((((((....,,,..,{{{,(,....,,...,}}}}),,.....)))))))))..........((((((.(.(((...(((((((..((((..((({..{(((.....,.)))})))).))))..{(((((((...))).)))}}{{..(((((((....)))}}))).)}.))))))).)))).))))))(((((....)))))))))))).))))}|}}}}}},.,{|.....)),,,....,))},))))).)))))))....,,))))))..)))).)))))))...||||||{,..,,})))}}}},,,,.)))))))}}}}|}||}}|||||,,((({,,,{{{{,,.,,.,}}}}.,...,...,................((((((((....}))))))),{,((((((((,(((((...(((((..((((,{,....,}.))))..))))).....))))}}||||}||,||,.,.,|||}},||,.,,,{{.{,,(((({{{{.(({{(,,,.{{{{((,.{,{(({((((((((({(({,.....,.{{{{....},,}||}})}.}}}}||{,,|||},||},.,||......,))}).,))..}})}}|||||||{{.{{{,.....,|||||||{{{{{{...((((((........)))))},,....,|||,,(,((,.,,,|||{|||,,{.(((((((((((({.(((({,(..(((((((((({(((((.......)))))}..{((((((((({...)))))))))))))))).....)))))..)))))).}))))).))))))).,.}}}}}|..{{,||||.,....,|.|||||}},}})}},}},||,(((((((..........((({,({{((((((((.((.((...((((((({(,............((((((((({....})))))))))...........,,)))))))...)).)).)))))))))))))).))))))}}}||||{{||||,.......((((((({{.......{({(......)))}.{(((({{{{{{,,{((({.....,}},..,||,|,.,..,{,(((.(((((({....,}))))).)),..||||.,{{{,,{{,..,,}|||..{{{.....}}}.}}}.,|,.}))))))))}}.}})))))))|,,,{||{|||({({..(((((((....)))))))}})}||||||,||||.,,,(((((((..((..(((((((..{((((..{{{,,....,||,|,,.{{(((((....))))))},,.{{(((((.(((((((({(........))))))))).))))))),},.)))},)))))))..))..)))))))..(((((.((.......)).)))))..,,,...((((.((((((({,((((........)))))))))))).)))),},))})})},)))},,....{(((.{((..{(((.(((.........))))))}..))}..)))),.})))),,))},.,,)))))))))))))}}))).},)},,)}}}}|||,.||||)}.||}}}}}}}}}.)))))))}....}},,.}}}...}}}},})}}}},},,,.......((((((.....)))))).,}}))}}}}}}}.))))).,))))),,))})}}}}})))|{|||||||.{{{(((..{{{.{{{..,,|||||},||||,.,.}}))))))),,,,,,.))))))}}}..}))))))))})).}))),..})))),}}}}},,...,{{.(((((((((({.....{{.((((((((((,{((....))))))...)))))))))))).)))))).}},,,...|||||||},,..}}}}.,,..}}}},.,}}}..((((((((.......))))))))..,)}))},}..,..))))})))))......))))).)))}..)))..)).)))))..}))))))))).,.....,{{,,.((((((.....))))))..||{{||..,||,.((((..((((...})))..)))).......}))}})||}|||}|||{{{||,,.....|}||.,,}.,}}}}|||{|||{,..,{|,...,,,,.}}}}||}|}}}.......,.,{||,.{{{|{{.,,},.....))}}}),)))))},((((((((((((((((.(((((((((.(((...,.((((((((((.......,{((.{{..(((..((((.......})))..}}}{{{..|||({.(((((((((((........))))))))..))).)}.}}..||},,,||||,||||||}|||,.{(((((((.....)))))))}.((((((.((({...}))).))))))...|,(((((((,{(({{{...........((((((((((...(((((((((((.....)))))).))))).....{(((((..(((((,.{(((.....))))(((((......((((((((.....((((((.,.((.............}),,.)))))).....))))))))))))).........)))))..)))))}{{{...((((((...)))))).(((((((..,.......}..)))))))(((((((.,....})))))))..{{{,..........,}}}.})).))))))))))..(((((....((((........)))).....)))))((((..((((((...((((((...(((((((.,(((((.,.......,.))))),.)).))))).))))))......))))))..))))..................,}))))...)))),))))))))))},.{(((((((((((((.(((((...((((.(.((((..((....(((((((((.{(((((........)))))}.)),....}))))))|((((.......))))}))..)))).).)))),.))))).)))))))..))))))}............{{({......((((((((((((...({{{.......,.}}}})))))).))))))...,,.,)))}......,.)))))))))).((((((((.......(((((,((((((....)))))).))))),..(((((((,........).))))))).((((..(((({...})))).))))..))))))))....(((((((.((((((((,,...,,...)))))))).)))))))..........{{((((.....(((((........)))))..))))||(((((,.......((((.((((.(((.(((((...((((......))))..,,.))))).)))))))))))))))))}..))).)))))......)))).)))))))))))..((((((((.......(((((....)))))......))))))))))))).))))))))))))))))))))..,((((((((,..{((((((((...})))))}}.,......,..))))))}},..,,.||.,}||.....,},,}}(((({{(((.,,....,}.))))))))...))))).))))|,,{,.,,..,.}}.}}...))))))))))))))))))},|||..,{{.|,,,,,,..,,,,,,,.,...|{{(||((({{...}))})..))})}}||||,,|{|{{.....,,.,,,},)}))))|||||...((((....))))...)))))|},...,,..,..,,)))))))}........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AUCUGGGACUGUUGUUCUCUCGCGGCGCGACCGCCUCAGUCACUUCGCC… 8477 nt 0.3808
Summary

Enables glucose-1,6-bisphosphate synthase activity. Predicted to be involved in glucose metabolic process. Predicted to be located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic alcohol exposure significantly downregulated PGM2L1 mRNA expression in the hippocampus, as identified through high-throughput sequencing and bioinformatic network analysis [Du et al. DOI:10.3389/Fphar.2024.1377501].