Basic Information

Symbol
PGP
RNA class
mRNA
Alias
Phosphoglycolate Phosphatase Aspartate-Based Ubiquitous Mg(2+)-Dependent Phosphatase Glycerol-3-Phosphate Phosphatase G3PP AUM EC 3.1.3.21 EC 3.1.3.48 EC 3.1.3.18 EC 3.1.3 PGPase
Location (GRCh38)
16:2211593-2214840
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001042371.3
Sequence length
3164.0 nt
GC content
0.6078

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1439.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1494.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 855.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((((.(((((((((.((((((((((((((((((..(((((((((((.(...(((((((..((((......))))..)))))))...).)))))))))))..))).....)))))))).))).))))...((((((.((.((((((((.((...((((((((((((((...((.(((((((((((.((((((((((((.(((....(((..((((((.((........((((.((.......))))))........))))))))..)))))))))))))..))))))))))))))))))))))))(((....)))....))))))))...)).).))))))).)).).)))))..)))).))))).))))))))).......(((((((.((.((((((((..(((((((((.(.......).))))).))))((((((.((....))..(((((((..(((.......)))..))))))))))))).((((((..((((((.(((...))).)).))))(((((((((..((((((((.......(((((......))))).....))))))))..))))))).)).)))))).)))))))))).))))))).(((...))).(((.(((...))).)))....)))))))))).)))))).).((.((((.((((..((.(((((....))))))).)))))))).))((((.....))))...)))).)))))............((((((((((.(((.............((((((.((...(((..(((((....)))))..))).((((.((((.((((.(((((..((..(((((((((((..((((((.(.((((....((((((......)))))))))).).....))))))..))......((((((..(((.(((((.(((((......(((((((...)))))))....((....((.((..((((((((((((....(((((((((((.....(((((.............(((((.....))))).((((..(....)..))))((....)).)))))...(((...(((((((((.........)))))))))))))))))))))))...))))))))).)))..)).))..))))))).))))).)))..)))))).((((........)))).))))))))).))..)))))..))))..)))))))).)))))))).(((((.((((((((.(((((..((.(((((((((((((..(((..(((((((((...(((..(((((((((((((((..(((((.((....................)).)))))..)))))).(((((....))))).((((((..((....))...(((((((((..(((..(((.((((((((((.((....((..((((...))))..)))).))..)))).)))).)))))))))))))))(((((((((((..(((((((((((.((((((.((((......)))))))))).)))....)))).)))).))))..)))))))))))))..(((((((.....(((((.............))))).((((((((((.((((((((((((((((.....)))))))).....(((((..(((....)))..))))).....(((((....)))))...))).))))))))))))))).......((((....))))..............((((((((.(((.(((((.(((((((..(((((((((((((((((....)))).))))).))..)))((((.((((((...)))))).))))...)))..))))))).))....(((.....(((......))))))))).))).))))))))(.((((((((((..(((.(((((((((..(((..((((((.....)))))).)))...))))))).))..)))..))).))))))).)))))))).)))..)))))))))..)))))))))..(((((((.......))))))).((.((((((((......................)))))))).))(((((.(((((...))))).)))))...(((.((((((((((...((((..(((((...((((((((.......))))).)))..)))))))))....))))))))))))))))..)))))))))))))))...))))))))))))).))))).(((((((((((((((.....))).(((....)))..))))))))))))))).))))))).)))...((((((((((..(((((((((...(((((((((.((((((...(((((((.(((((....(((......)))......)))))......((((((((((....((((((((((((((((.((((((((.(..(((((((....)))))))..).)))))))).)).)).((.(..((((((((.(((((.(.((((((........(((.((((((((((((...)))).))))))))))))))))).)..))))).)))))).))..).))((((.....))))....)))).))))))))(((.(((((((.((((((..((((((.((.(((((....(((.((((.(((((((...(.((((....(((((((.((((.(((....................))))))).))))))).)))))...)))).))).)))).))).)))))))(((((((...)))))))))))))..)))((.((((((..(((.((((((.((....)).)))))).)))..))))))))))).)))))))..)))......))))))))))...))))))).)))))).))..)))))))((((((..........))))))......)))))))))..)))).))))))((((((.((((....((((..(((....)))..)))).)))))))))).(((.....)))........((((....))))..((((.((((.((((((((.((((....)))))))))...))).)))))))).....))))....))).))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((((.....)))))((((((((((((((((((((.((((.(((((((((.((((((({((((((((((..(((((((((((.(...(((((((.,((((......)))),,)))))))...,.)))))))))))..))).....))))))))}})).))))...((((({.,{.((((((((,((,.,{((({((({(((({{,{((.(((((((((((.((((((((((((.(((..,{(({.,((((((.{{........{{((.{{......,)))))),,...,,,}}}}}))).,)))))))))))}}}.))))))))))))))))))))))},)}|,||,}}},,}}}||}}})),..}}.).))))))}.,,,,})))))..)))).))))).)))))))))..,...((((.,.{.((((((...)))))),,,))))((((((((((..(((((({((({{({(((({,{,{((((((((((..(((.,....,)))..))))))}|||}.},,))}}},}))}))}}|||.||||,|||,{|{{({(({(((({{((((((({....((...,,,}}....})))))})}})},,))))}})))}}},.|{{(({{{...))))},})).})))))).}},.}}))).}..)))))}})))).......)))))))))).))))}((.(((((....)))))))..)))((((((((({|{((({{{,{(({({((((.....}))),.{((((((((({.{((((((({{.{{{(((({{{(((....(((..((..(((((.(((...}}||.})),}},.,,))))))))))))..((((((.((((((.((({....}))),{(.((((..((({({...||}..))})))}.},.,))))))))))).........,|||}},,}}}},,},((((((..(((.(((((.((((({.{,..(({((({...}}}}|||,,{,.,...,((.{(,.(({({(((((((,{({,{{{{||||||,,,},{{{{,.............(((((.....))))).((({..,....,,,))))||....)),,}})},,}|||,..{{{{{{({{...,,,,..}}}}}}}}}}}||}}}))})))}}),))))))))).))),,)),}),,,)))))).))))).)))..))))))..}}}.,}}},||||(.({{{{{..,.}))})))))}},}}))))))))))))))),}))))))){(({{({,,,(((((((((((.(((((.........)))))...)))))))))))..{(((.((((((((({.,.,(((((..{.,(((({........{,,.....,,,..)))))},.,.)))))|(((((((..((((((..{{....}}...(((((((({.,(((..(((.((((((((((.({.,,.((..((((...})))..)))).))..)))).)))).)))))))))))))))(((((((((((..(((((((((((.((((((.((((......)))))))))).)))....))))))})).)))).})))))))))))))..)))))))}....(((((.{.{,...,,.,.))))).,,|,|}}}}}}))).,.)})}(((((({,||.,.....,)},...})))))){{(,..,|||{{,||{{{{{{{((((.{{,,,.,,,{{{|},.,})))),||||||||.,.....((((....))))....}||,,||||}((((((((.(((.(((((.(((((((..(((((((((((((((((....)))).))))).))..)))((((.((((((...)))))).))))...)))..))))))),||{...|||,....(((......))))})))).))).))))))))({((((((((((..(((.{{(((((((..(((..,(((((.....)))))}.)))...))))))),)}..)))..))).))))))},)|,,,...{((({,((((((.((((((((..((((((((((({.......})))))).{(.((((((((..................,...)))))))).}}(((((.((({,...,)))).)))))...(((.((((((((((...((((,.(((((.{.((((((((.......))))).))).})))))))))..,.)))))))))))))(((((((,.,,((({(((((....))}}}.}}})))}|,,|||||||(((((((,(((.....})).,{{.,,}))),.}}}||||}|||,...,|||.}|}|}}....((((((((((..(((((((((..,{((((((((.((((((...(((((((.((((((((((((,.{,((,((((.,,.((((.....)))}..,|.((((..(((((((((((((((((.((((((((.{..(((((((....)))))))..).)))))))).)).}}.{{.{..((((((((.(((((.{.((((((,.......(((.((((((((((((...)))).)))))))))))}))))).,..))))).)))))).))..}.}}((((.....)))).}}})))).))))))))).})))|((((((((((,(((,{{.,,,,.)).)))})}))))}}))}..}.))))})),.}.)))))))).))))((((.(((....................))))))).(({(....,((..((((({.((....))..)))))).))....,)))).{(({((((((.,,{...,,,...((((((..(((.((((((.((....)).)))))).)))..)))))))))))},)))),|((((((.,...,.))))))}....))))))).)))))).)),.,)))))}((((((..........))))))......)))))))))..)))).))))))((((((.((((....{(((..(((....)))..)))).)))))))))).|||},...},}......)))))..)))))))).)))))}}))))))}.}||,)))),}}.,,))))))},.}.)),)))|,|||,...,))}.,....))))))))))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001042371.3 NCBI
GAGGGCGCCGCGGCGGGCGGCUGCGAGGAGCGGCCGGCGGGCGGCGGCG… 3164 nt 0.6078
Summary

Enables glycerol-3-phosphatase activity and phosphoglycolate phosphatase activity. Involved in glycerol biosynthetic process; glycerophospholipid metabolic process; and negative regulation of gluconeogenesis. Predicted to be active in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A systematic review of human and animal model studies found that the immunohistochemical expression of the PGP in heart tissue is reduced starting from 7 days post-mortem, decreasing to approximately one-third of its initial value by 11 days, providing additional information for post-mortem interval estimation [Salerno et al. DOI:10.3390/diagnostics12092114].