Basic Information

Symbol
PGR
RNA class
mRNA
Alias
Progesterone Receptor NR3C3 PR Nuclear Receptor Subfamily 3 Group C Member 3
Location (GRCh38)
11:101029624-101129813
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000926.4
Sequence length
13037.0 nt
GC content
0.4155

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3758.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((..........(((((....)))))..........)).)))))..(((.(((((...)))))...))).(((((((((.((((((((((((((((....((((((((((((((....)))))((((((...((.(((((((((.((..(((((.....)))))..((.(((((((((.((((..(((.....)))...((((((((((....)))...)).)))))..(((((((((((.((((((((.((...((((.(.(((((((.(.(((((.((((..((.(((((..(..((..((((((((((.(((((........((.(((((.((......)).)).))).))(((((..((((((((.....)))..)))))...)))))((((((((.(((.(((....))).))).)).....)))))).)))))...(((((((((.....))))))))).......))))))))))..))..)..)))))..))..)))).))........)))).)))))))))))).....(((((((((...(((((.((.(((....))).)))))))...(((((.((......)).))))).....))))).))))............................)).)))))))).))))...))))))).......((((((((((((((((.((((....))))))))).)))))))))))..(((((.....)))))((((..((((((.((((((...((((((((..(((((((((((((((.((((....)))).)))..............))))))).))))).((......)).)))))))).......)))).))))))))..))))((((.....(((...(((((((..(((((...........)))))..))))))).)))......))))....(((((((..(.(((((((((((((((.....(((.((((...........(((....)))...((((.(((((....))))).)))).)))).)))......)))))).))))))))).).)))))))))))..))))))))).))(.((((...((((.((.((.......)).)))))))))).)(((.(((((.....))))))))(((((....))))).))))))))))))).(((((((((((((......)))))..((((.((((..(........)..)))).))))((((((.((((((((((((.(((((.((........))))))).))))))).))))).)))))).))))))))..((.(((((((..((((....))))..)).)))))))))))))..)))))))))(((((....)))))((((((((((((((((.((.((((.((((((..((((.....((((((...((((((((((((((.....(((((((((.((((((((((((((((((.((((..(((((((((((((.((((((((((((....((((.((((((..(((....)))......((((((..(((((((((((((((((((((.(((...(((((((..(((((.((..(((((((...((((((((((((((..((((.....))))..)))).....(((.(((((..(((..(((.....))).(((.......))).((.((((((.(((....))).((.(((((((((.(((((.......))))).)))))))))))(((..(((...))).))).........((((((((((((.((.......(..(((((((..((((.((....)).))....))...)))))))..))))))))))))))))))))).))..........)))...))))))))(((((.(((.((((((......)).)))).))).))))).....))))))))))........(((((.....(((.....)))..(((((....))))).)))))((((((..((..((((..........))))..)).))))))..(((.......))))))))))..)).))))))))))))))))))))).))))))))).))))....))....))))))))))))))))((((.....)))).(((((((((((.((((......)))).).)))))))))))))))).))))))))))))))))).)).)))).)))))).....)))))))).(((((((....))))).))......(((...(((((((((.(((((((((..(((.((((.........)))).)))...)).)))))))..((.((....)).))...............)))))))))...)))..)))).))))))))).....(((((((.(..((((..(((((..(((((.....))))).)))))))))..)...)))))))......((((....)))).(((((((..(((((((((.......(((((((..(((((((..((((.......((((((((((..(((((((((((...(((.....)))..))))........(((((((((.((......))..))))))...)))((((..((((.((((((((.((((........((((.......(((((((..(.(((((..(((((.(((((.(.....).)))))....((((..................)))).......((.(((((((((((...((((((((((..((((((..(((...((((((((.((((((.((((((.....((.(((....(((.((((.((((...((......))...)))).......((((.....))))....((((.........))))((((((.....)))))).)))))))..)))))....)))))).)))))).((((..........)))).(((((((((.(((((((((((.....)))))))))......)))))))))))((((((....)))))).......))))))))...)))))))))))))).)))))...(((((((...((..(.((((((((((((((....)))))...............((.(((((......))))))).(((((.((((.(((((((((..(((((((.........((.(((.((...((((....(((.(((((((((((((......(((......(((((((....(((....((((((.((...(((...))).)).))))))....)))..))))))))))..))))))))))))).))).....))))...)).)))))........))))))).)))))))...)).)))).)))))...)))))))))((((..((((....))))..))))...)..))...)))))))((((((.(((.......)))))))))(((.((((.((((..........)))))))).))).((((((.........))))))))))))))))).)).(((((.......)))))...(((((((((((((......(((((..((((..(((.((((((((((((((((.........(((....))).((((.........(((((((((((((((((((((..(((((((..((((.((((((((((((...((((...)))).)))))))))......(((......))).))))))))))))))...))))))))).(((.((.....((((...........)))).....))..)))..........((((((((..((((.(((((((((..((((((..((............))..)))))).)))))))))..(((((((.((((((((.........((((((....))))))...))))))))..)))))))............)))).....))))))))..(((((((.(((((((...(((((((...(((((((........))))))).....................)))))))..))))))).))))))).....)))))........))))))).........)))).....)))))).......)))))...((((((((((......).)))))....))))(((((((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))...(((((........))))).....(((((((((((((.((((....)))).................((((.((((((((...((((.(((((..........(((....))).........))))))))).)))).)))))))))))))))))).)))..(((((((......)).)))))(((((((........))))..))).)))))))))).(((((((........))))))).((.((((((..(((((((((((((((((........)))))))))))))))))...)))).)).))(((....))).))))).))).)))).)))))......)))))))))))))..)))))..))))))..)))))))...)))).........)))).))))))))))))..))))(((((((...((((.......(((((((((((.....((((....))))...(((...)))...((((((((((((((((((((..((((((((((....(((......)))))))))))))((((((((((.((((((......((((((((....(((.......(((.(((((..((((...)))).))))).)))..(((((...((((((....(((((.....))))).....)))))).......)))))....)))..))))))))...)))))).))))).....................(((((((............(((((..(((((((.(((((....)))(((((((((......((((((((..(((....))).))))))))(.((((.(((...........(((((((((((..((((....))))))))))..)))))..........))).)))))........(((((((((((.....((((......)))).....)))))))))))(((((((.(((.((........(((((((((.((((((.((((((((((((...))).))))))....((((((((((((.......)))))))))..)))......))).)))))).)))))))))........)).)))....))))))).)))))).))).....((((.((((((((.....)))))))).))))....((((.......)))))).))))))).)))))................((((((((.........(((.((((((..((..(((((...)))))))..)))))).)))))))))))..((((((....((((..((((((((....)))))))).))))......))))))............))))))).............................)))))..........(.((((((......)))))).).......))))).))))...)))))...))))))..................................(((((((((.......)))..))))))))))))))))))))).)))))))((.((((...((((...((((((..........))))))....))))...)))).)).....)))))))..)))))))))).....(((((((...............(((((.((((.((((....)))))))))))))..(((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((((.((.(((.(((....))).))).)).))))))).)))))......)))))))...))))))))))))..............((((....))))....))))..))))).)))))))...............................((((((((.......(((((((((...................((((((((.......((((((..(((((.(((.(((.....)))))).))))).......((((...(((((((((((.(((((...(((((((((((........(((((((.....(((..((((....))))..)))...(((((...)))))....)))))))...(((((((..(((((.((((...((...((((.((((((.(..(((((.((((...((((((((((((((((.....))))...))))))...))))))...)))).)))))..).))))))..))))...))...)))))))))..)))))))..(((........)))..........))))).)))))).)).))).)))).)))))))..)))).((((((....))))))))))))...)))))))).....)))))))))......))))))))))))..))))))).)))).)))...(((((((..((((...((((((((((((((......).))))).(((((((.((((..((((.....(((((.(((.(((((............................(((((((((.....)))))))))......(((((((.(((.((((((((.((((((((......(((((((.((((((.((((((((((((((((..((....))..)).))))))........))))..))))....)))))).)))).))).......)))))))).)))))))).)))((((((..(((((((.(((...........(((((((.((((..((((((((((((..((((((((((((((.......)))))......)))).)))))........((((((................))))))....))))))))...))))))))))))))).((((((((......(((((...(((....)))...)))))((((...((((....(((.......((((((((((.((((((((...((((((.((........(((((((((((.((((((((((.((((((..................)))))).....)))))).))))..(((((((.((....(((((....((.......))....))))).....)).)))))))(((((((.(((((((((.((((((.......((((((.....((((((.......))))))...))))))....((((...(((((((((.......(((.........)))..........(((((((...((((((.(((((((.........)))..((((.(((.(((((((....((((((((..........)))))....)))....)))...((((((..((((.......)))).))))))))))....))).))))(((((((((...))))))))))))).))))))...))))))).....((.(((...))).))....((((......(((((((((((((((......((((((.(((((((((...........((((((((.(((((.........)))))))))))))......))))))))).)))))).......(((((((((((.((.(((....((((((.....(((((...))))).))))))..))).))..............................((((......))))(((((((((....((((((...))))))....((.((((((((.(((.(((((..((((.((((((.(((((((.((.........)).))))))).))))))..))))....................(((((((((((...(((((((....((((((....))))))...(((.(((((((((((.(((((((............))))......(((.......)))((((((......)))))).......(((.((((.........)))).)))......)))))))))))))).)))((((((......((((((((((((..(((.......((((((..............))))))........))).)))).............(((((......)))))(((((((((.(....)))))))))).(((((.(((......((....((((((((((....))...((((((((........)))))))).(((((..(((((...(((.....)))...))))))))))..).)))))))....))......)))))))).))))))))..((((...))))))))))..........)))))))..)))))))))))....)))))((((.((.(((((((((.(((((.(((((.((((..((((((.....))))))...((((.(....).)))))))).))))).)))))((((..(((..((.....))...)))..)))).((((........))))...((((((((..(((((((((.((((((.((..(((((((.......)))))))..))))))))..........)))))))))))))))))((((..(((...(((((....((((((.....(((((((((.....)))))))))))))))...)))))...........)))..)))).......))))))))).)).)))).((((((....(((..........)))....))))))))).)))))))))).......(((((.((((....))))))))).((((((............))))))....(((((((((.((((((........))))))...........(((((((..............)))))))((((((((((............))))))))))..((((((((((....(((....)))...(((((...))))).)))))))))).........((((((..........)))))).((((((((((((((.((((..((((((((((((..(((.....)))..)).)))))((((((......((((((((((...)))).........))))))..)))))).....)))))..)))).)))))))))...........))))).....((((....))))......)))))))))))))))))).......((((...........)))))))))))))))((((((..((((.((((((....)).))))..(((((.(((....(((((...((..(((.((((((((((((((.(((((((...((((.((.(((((.((.(((((((....((....))....))).))))))))))).))))))))))))).)))).((((((...((((((..((((.....(((((..((((.......))))..)))))((((((((......)))))))).....)))).))))))...))))))...........(((((((((((((((..(((((.((((.(((((...(.(((((.......((((((......((((..((((.....))))..))))....))))))))))).)..))))))))).))))).....(((((....((((.(((((.((((((((.((..(((.((((((......)))))).(((((.((.(((((((((.(((........)))..)))))))).....).)).)))))...))).)))))).....)))).))))).))))..)))))..)))))))))))))))...((.((.(((...))).)).))......)))))))))).)))..)))))))..)))...)))))..))))..)))))).....))))))))))))))).......)))))))))))))..)))).((((...)))).)))).)).))))))(((.....)))(((((.................)))))..................((....))))))))))))...))))))))))))).)))))).(((((.(((...(((((((((((.((.....((((.........))))........)).)))))))).(((((((...)))))))...(((((((((((.((((.(((((((..(((((.((..((((((..((((((........((((.........((((....)))).....(((((((...(((((......)))))...)))))))((((((((..(((........)))..))))))))...))))))))))...))))))..)))))))..)))))))..))))(((.(.((((..((((.(((((((((.(((((((...........((((.((((.((((((((.(((((......))))).)))).)))))))))))).......))))))).(((.....(((((((.......)))))))......)))((((......))))...................................)))))...)))).))))....)))).)))).(((((.(((......)))))))).....(((((...(((((.....))))).....)))))))))))))))).....(((((((............))))))).....(((((....)))))(((......)))........((((((((((.((.(((...((((((((((((.((((((...))))))(((..((((....(((..(((((((...)))))))..)))))))..))).)))))).......................((((((......))))))..)))))).))).)).)))))))))).......(((((...(((......)))...))))).................)))...))))))))....)))))))).))).))))))).......))))))))))).)))))).))((((.....)))).))).)))))))..)))))).)))))))......))))).))).)))))..((((((....))))))(((((......)))))((((((.....)))))).((((((...)))))).....))))..)))))))))))(((((((..(((((...((((((((..((((..(((((......)))))((((....((((((...((....)).....))))))...))))((((...))))))))..))))))))..))))).)))).)))))))))))......)))).....))))))).(((((((....))))))))))))))))...)))))))....(((((...))))).(((((.((((((.((((............)))).)))).)).)))))....))).)))))))))))(((....))).......))))))....)))).))))))..)))))).............((..(........)..)).((..((.((((((((....(((((...(.(((....))))...))))).))))))))))..)).))))).))))(((((((..((((((((((((((...........)).))))))).........)))))..).)))))))))).)))...(((((((((.(((..(((((...(((((((((.(((((.(((....))))))))..............((((....(((((((((((..((((.((((((((((((((((((((.......((((....))))...(((((.((((........)))).))))).....(..(((((((((((......(((.(((((((...........)))))))..))).......))))..(((((....(.(((....((((..((((.........))))..))))....))))...)))))....................)))))))..).............))))))))))).))))...))))).)))).....))))))).))))...))))...........))))))))).)))))((((((((((((....))).((((((((.((.........(((((...(((((.....))))).)))))...............(((.((((.............)))))))....)).))))))))...((((((((..((((......))))(((((((((...))).))))))...))))))))...(((((....)))))..))))))))).))).)))))))))...(((((.((((((...((((((((((...(((((((..(((..(((((((((.(......).)).))))))))))..)))))))...)))...)))))))......))))))((((((((((((((((....((((.....(((....((((((.((.((((....))))(((.((((((.(((.((((((..........)))))).))))))))).)))))))))))..))).....)))).....)))))..))))))))))))))))((((.((((((((.....((((.((((..((((..((((((((....))))))))((((.......)))).....))))..))))....))))..)))))))).))))............))))))))))..(((.....(((((((.....)))))))......)))))))))..)))))))))......((((((((....((((((((.....))))))))....(((((((((((.....)))))))))))))))))))....((((((((((((......)))))).))))))..)))........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000926.4 NCBI
AGUCCACAGCUGUCACUAAUCGGGGUAAGCCUUGUUGUAUUUGUGCGUG… 13037 nt 0.4155
NM_001202474.3 NCBI
AGCUGAAGGCAAAGGGUCCCCGGGCUCCCCACGUGGCGGGCGGCCCGCC… 12287 nt 0.4060
NM_001271161.2 NCBI
AGCUGAAGGCAAAGGGUCCCCGGGCUCCCCACGUGGCGGGCGGCCCGCC… 11981 nt 0.4052
NM_001271162.2 NCBI
AGUCCACAGCUGUCACUAAUCGGGGUAAGCCUUGUUGUAUUUGUGCGUG… 11043 nt 0.3676
Summary

This gene encodes a member of the steroid receptor superfamily. The encoded protein mediates the physiological effects of progesterone, which plays a central role in reproductive events associated with the establishment and maintenance of pregnancy. This gene uses two distinct promotors and translation start sites in the first exon to produce several transcript variants, both protein coding and non-protein coding. Two of the isoforms (A and B) are identical except for an additional 165 amino acids found in the N-terminus of isoform B and mediate their own response genes and physiologic effects with little overlap. [provided by RefSeq, Sep 2015] CIViC Summary for PGR Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.