Basic Information

Symbol
PGS1
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylglycerophosphate Synthase 1 CDP-Diacylglycerol--Glycerol-3-Phosphate 3-Phosphatidyltransferase, Mitochondrial CDP-Diacylglycerol--Glycerol-3-Phosphate 1-Phosphatidyltransferase PGP Synthase 1 DKFZP762M186 EC 2.7.8.5
Location (GRCh38)
17:78378637-78425114
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024419.5
Sequence length
2297.0 nt
GC content
0.5742

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-931.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -971.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 502.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_024419.5 NCBI
GGAAGCGGCGAGUCUCCAUGGCGGUGGCGGCGGCAGCUGCGGCGGGACC… 2297 nt 0.5742
Summary

Predicted to enable CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase activity and calcium ion binding activity. Predicted to be involved in cardiolipin biosynthetic process and diacylglycerol metabolic process. Located in endoplasmic reticulum. Is active in mitochondrion. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human bone samples with a post-mortem interval (PMI) of 15-20 years identified the PGS1 as a key protein marker for long-term PMI prediction when screened using a random forest algorithm, achieving 100% differentiation accuracy in the model [He et al. DOI:10.1007/s00414-025-03625-9].