Basic Information

Symbol
ASH1L
RNA class
mRNA
Alias
ASH1 Like Histone Lysine Methyltransferase KMT2H HuASH1 ASH1L1 ASH1 Absent Small And Homeotic Disks Protein 1 Homolog Histone-Lysine N-Methyltransferase ASH1L Lysine N-Methyltransferase 2H ASH1-Like Protein Ash1 (Absent, Small, Or Homeotic)-Like (Drosophila) Probable Histone-Lysine N-Methyltransferase ASH1L Ash1 (Absent, Small, Or Homeotic)-Like EC 2.1.1.359 EC 2.1.1.367 EC 2.1.1.43 KIAA1420 MRD52
Location (GRCh38)
1:155335268-155563162
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018489.3
Sequence length
12037.0 nt
GC content
0.4430

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3507.68 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3732.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2794.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001366177.2 NCBI
GAGGCUUGGGCUUGCGCCGUUGAAGGUACGCGUGAGGGCCUGCGCCGGC… 12052 nt 0.4427
NM_018489.3 NCBI
GAGGCUUGGGCUUGCGCCGUUGAAGGUACGCGUGAGGGCCUGCGCCGGC… 12037 nt 0.4430
Summary

This gene encodes a member of the trithorax group of transcriptional activators. The protein contains four AT hooks, a SET domain, a PHD-finger motif, and a bromodomain. It is localized to many small speckles in the nucleus, and also to cell-cell tight junctions. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ASH1L gene was downregulated in the ileum of methamphetamine-treated animals compared to controls, and its genomic location is near SNPs associated with inflammatory bowel disease [Sun et al. DOI:10.21037/Atm-20-7741].