Basic Information

Symbol
PHKG2
RNA class
mRNA
Alias
Phosphorylase Kinase Catalytic Subunit Gamma 2 Phosphorylase B Kinase Gamma Catalytic Chain, Liver/Testis Isoform Phosphorylase Kinase, Gamma 2 (Testis) Phosphorylase Kinase Subunit Gamma-2 PHK-Gamma-LT EC 2.7.11.19 PHK-Gamma-T PSK-C3 Phosphorylase Kinase, Gamma 2 (Testis/Liver) Serine/Threonine-Protein Kinase PHKG2 Phosphorylase Kinase Gamma Subunit 2 EC 2.7.11 GSD9C
Location (GRCh38)
16:30748293-30761176
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000294.3
Sequence length
5384.0 nt
GC content
0.5349

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2016.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2107.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1382.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((......((((((.(((.....))))))).)).(.(((((((((((.....((((.((((((((((..(.(((...))).)..)).)).)))))).))))....((.((((....)))).))((((..((.(((.(((.....))).))).))..)).)).....))))))))))).))).)))))))).....((((((((..((((((..((((((.(((..((.((((((.((((.((((((((.((((((((.(((........))).)))((..((((((.(((..(((((..((((((.((......)).))))))..))....)))....))).)))).))..)).....(((((....)))))...))))))))).)))))))).))).))).((((.(((((((((((.((..(((.....)))((((((.((....))))))))....((...)).(((((..(((((((.((((((((....))))..((((((((.(((((((.....))).)))).))))....)))).((((....(((((((((.(..(((...((((((((((..........))))))....))))...)))..).)))).)))))..))))))))))))))))))))((((((((.((((.(((((((((((.............))))....(((((.........(((..(((((....)))))..))).)))))((((......))))(((.(((((((((((.(((....((..((...((((.(((...))).))))..))..))...))).)))))))..))))...)))....(((((((((((....((((((((((.((((......)))).(((.(((((((.((((.((...((((((((.(((.((((((.((((.((((((.((((((((((.....((((..((.(((((((((((.(((.((((((.(...........).)))))))))))))......((((((((...((..(((.(.(((((((....((((.....))))..)))))))).)))))...))))))))((((..((.....((((((....))))))))..))))...........)))))))))))))...)))..((((((((((...((((((.((.((.(((((((((((((.((((((....(((((..((((......))))....))))))))))).))))(((((.((((((.((((..(((.((.(((((((..((((.....))))..)).))))).)).)))..)).....)).))))))..)))))..((((.((((...(((((((..((......((((((..((((...))))...))))))))))))))).....)))))))).....)).)))))))..))))))))))...(((((((.(((((....))))).((((.(((((.((.((((((((...((((..((..(((((..(((((((.....)))))(((.((........)).))).....((((((.((((((((...))))).))).)))))).(((((......))))))).)).)))..))..))))..)))))))).)).))))).))))((((((((.............)))))))).)))))))..((....)))))))))))).))).))))..))))))))))....(((((......))))).....((((((((((((((.....)))(((((((..((.(((((((.((((((((((..(((((.......(((((((......))))))))))))..)))).)))).)).))))))).))...).))))))..)))))))))))..)))))).)))(((..((((((.(((((.....)))...)).))))))..)))(((((....))))).(((((.(.((((..((((.....((((((((((((((((.((((((((((((((..(((.(.((((((((((((((((..(((.....((((((.......((((.......)))).))))))(((((((.....)))))))....(((((.(((((((((((...((((((((.......((((((((((.((((((((((((....((((((.(((..((((......))))....))).)))...((((........))))...)))....))...)))))))))).))))))))))...((((((.((((...............)))).))))))((((((((((((.((((((((.((((((((((.(((((....((((((((.((((((((.(((..(((((...((.........))...)))))...((((((((((......(((....)))......))))))).)))................))).))))))))..)))))..)))((((.(((((.(((((....))..))).).)))))))).((((((((.....)).))))))......)))))..))))))))))))))))))................((((....))))..)))))).))))))..))))))))...)))..).))))))).))))))))..)))).)))))))))))).).)))..)))))))))..................))))).))))....)))))).))))))......))))..))))...).))))).....(((((......)))))(((..((((..((..(((((((.((((((((((((((((.....)))).)))))))..)))))...))))))).)).))))..))).)))))))))).))))))))))).))).......((((.((((((...((((.(((((...........))))).))))((((..((...))..)))).)).)))))))).....(((((..(((((.....))))).)))))...))))))))))..((((((((......))))))))...(((((..((.(................).))..))))).(((((........((.(.(((((((.((((..........)))).).))))))..).)).......)))))..........(((...((((((.((((....)))))))))).))))))).)))))))))))))).))))(((((((((.((((((...((((.((((((.((((((......)))))).........((((..............))))..)))))).)))))))))).)))))))))(((..(((...)))..))).))))))))))))))))))).)))))).))..))))))))).))))))((.(((....))))).....((((((((((((((((((((((....((((......(((((((((((((((((((((..((((.(((((((((.((((((.(((((((((.(((........(((..(((((((......)))))).)..)))........(((((((....(((((((((...(((.....))).....)))))..((((..((((....(((((....))))).....))))......))))..((((((((((..((((((((((....)))).....)))))).(((((((((..((........))..)))..)))).))..(((((.(((...))).)))))...........((((((((((.(((.(..(((.(.((((.((.((((((((((((((.......)))))))))......)))))...)).)))).).)))..).)))...(((((....(((..(((.(((....(((((((((.(.((.((((((((((((((((((((((...(((((..((((((((((((.......(((...)))........))))))).....)))))...((((((((.(...(((((((((........(((((((.((.((((((((((((........((((....(((((((((......((((.......((((...((((........))))...))))....(((....((((((.(((.......))))))))).....))).....)))).....))))).))))..))))...)))))))).(((.(((.......)))))).(((((((((((((((((((((......))))))...............((((((............(((((.((((((.........)))))).)))))))))))..(((((...)))))))))))))))))))).................)))))).))))))).)))))))))...).)))))))))))))((((.((((((..((((((((.((..(.(((((..........(((((.((((((((.............))).)))((((((((((((((....)))........))))))))).))..(((...))))).)))))....))))).)..)).)))))))).)).))))..))))((((....(((...)))..)))).)))))...))))))))).........)))))))))).).).))))))))..)).).)))..)))))))))))))))))).)).)))))))).(((..((.(((((......................))))).))..)))....)))).)))))))......))).))))))).))...).))))).))))))))).))))((((..((((((....)).))))..))))(((((.(((((..((((((((((............((..((((((.......))))))..))...))))))))))..))))).)).))).((((((((((((((((((...((((((.(......)))))))))))).)))............)))))))))).((((....((((....))))..)))))))).))))...)))))(((((.(((((.............))))))))))(((((......(((((((....))))..))).....)))))...........)))))))).......))))..)))))..)).))............)))))))))))))...............((.((((((....((((((((.((((....))))...)))))))).(((((((.........)))))))...((((((..(((((.....(((....))).....)))))..))))))..)))))).)).....)))))))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((,.....,((((((.(((..,,,}}))))).}},{.(((((((((((.....((((.((((((((({,,(.{(,...,}}.}..)),}),)))))).))))..,.((.((((....)))).))((((..((.(((.(((.....))).))).))..)).)).....))))))))))).))),)))))))),||.,((((((((...(((((..((((...(((.(((.((,,.{(.....((((..((((...(((.((((((.(((.(((((,,(((.((.(((((,((..(((....((((((.((......)).)))))).}))..}},)},}))|}},,.{((((.(((((...(((((....))))){({{.((,(({.{{{.,.{{{,...,)}|}}}.)}})}}(((.((((((.,,({({.((((...)))).|||((((((((.((,...(({.....,,})),((((((({({.{(({{{{{|||}}.},}}},||,,,{{||{,{.....,)),||||((|((((((,{({{,({((...,|}||......,..,,,,,,.,{{||{|{.,,,,,}},,)))||}|,,.|{((({...{{,,..{(((({(.((((..{.{{{||(((,{((((((((,((,.....((.((((((.,((({...{(((((.(((.((.....)).)))))....)))}.,|}||.....)))))))))).)))))|..,}}}...)))})))}.))))..))))))}.,,.,,)))),..))),,})))}).})}}}}..}))))))))).))))))))}...,}}},,})))}},|}}}}}.))))}}}..{{,(({{(((((((,.{{.((((.....||||||((({(((({{...|},,.)),,}))))).}}}}{|,||,,(((.((((((.{,,,......}.).))))))..))}.||||,{(({((((((.{...........}.)))))))))))))})}}}}))},||((|||(({{(((...(((((((....((((.....))))..))))))),.||..{{{.(((({(((((((..((.....((((((....))))))))..)))),.,,}}}.,.)))).))),}}|{{,..||{..((((.{..{(...((((((.((.,(.((((((((((((({((((((....(((((..((((......))))....))))))))))),))))(((((.((((((.((((..(((.((.(((((((..((((.....))))..)).))))).)).)))..)).....)}.))))))..)))))..(((,{((((...(((((((..{(......((((({..((((...))))...)))))))}))))))).....)))))))).....)).))))))).}}})))))))).))},))))..}||||}},.},|{((((((((({{..((((({...,{({((((((((((((({((.(.((((((.....)))))),.............((((((((.{((((((.((((((((...))))).))).))))))((((((......))))))..{.(((.(((((((((..(((..(((.((({...}))))))..)))(((((((((...(((((((.((...{(((((((((((((,((((((..,,{|,}}},{|||||}}|||.((((.{{{((((.....,})),))}))))((((((((((((((.....)))(((((((..((.(((((((.((((((((((..(((((.......(((((((......))))))))))))..)))).))))},).))))))).}),..),})))))..))))))))))).,|||.,,,)))|,{..((((((.{((((.....)))...}).))))))..}}.(((((....)))))..,{((((.((((....))))..))))}{(((..{.{,.(((((..(((((((((((((,,{{((((({((({((,.,,({((,,...,,||}}......,,,{{{{||||,||||{(,,(((((((,{,{,{{{.|(({|....}}}}},,{{{{,({{((,(,(({......,,,|||.|}}|||,},..}}}}}))))))),))))))}|,)))}}}..{({{{......{{{....(((({,((((.(((((.,.((((((.....,.(({{...,,..((((({{((((((((.(((((((..,(({............,((((((..((((((((.......((((((.((((.((((((((((({.{((.......))))))))),.})))))))}{.((.(((((({((.,((((((((((..{..((((((...))))))....)))),..((((((((((..(((((..(((((.(((((....,,.(((.(((({..((((((.(((((...((((.{...}.)))).))))))).))))..).)))).))).{{{((,((,||...}||||..((((((((..(((.{{({(.,((.,{(((((..{(({((,,,..((((....)))}..)))),),)))})),,))}))))|,..(((((((.(((..((((((((((((((((((({....{{{.,,.,.,,.......,.))}..})))))))}|{,,,|||}},{|||}}||,....||..,|||((((((((((((,({{,...{{{,{{{.{({.{{{.,,,.....((((((((...))))))))(((((((.((((((((((((((((,...,)))).)))))))..)))))...)))))))....((((..,,.||}}{(((((..{|,||}.,}||)))}}.})))))}.}}}{{((((.({{.{((({..............(((((..((((((((((((((((.(,((((((((((.((..((.((((,,{{((((({{{{.|,,,,.,.|,|}}}}}.))))).,,.)))).))..)).)))).)))))).,.))}})))))........((.((((..(((((((.{{.....{......((((((......)))))|.,.....,.....)),.))))))).)))).))...)))))))}...)))))..(((...((((((.((((....)))))))))),|||,.,,.....}))}),.))}..)))))){((((((,((.,,.{(((((((({{.(((((({.{((.(((.{.(((((.((((((((((((((,{((((,((((.........))))))))|((((((((((((((({,.(((........)))..),}})))...........................))))))))))}(((((((((........,{,..,,{...,}}.....))))))).)).))))))))))).))).)))))..}..)))))),,,))),}}}.)))))))))))),,,,)).)))))))}}..,,)}||||,((((((,.....))))})))..}}),.,....}}.)))},)))))))),,,,},..))))..))))))))))...,,..)))..)))))))),|||||,,,.,)))),.))))).)))))..))))).))))))))))..(((((({(((....}},,,},..)))))}.(({(((((({{{{.....,,}))}.})}..}})),)).})))))}(((...)))|{((((....)))))}..,))).)))))).)).).,((((.((({...)))).)))))))))}((((..(((((((.{,....,,...))))))).)))).))))))))..))))))))))..)))))))))))))))))))))(((((((.((.((((....)))).))))).))))...|||,..}},.))))))..))))))))))))))..,..))),,,,}}.)))))}}}}}}},...{(((((((.(...(((((((((........(((((((.((.((((,,((({({.....,,,,.||........(((({.{{{.,.{{{{,,.....}))),))).}))))..,{|.,,..,,}}}....{({....((((((.(((.......))))))))).....}))..{{((({{.,,,||||{{.,.,........}})))}|.,),|||,||........,,.}}}.(((((((((((((((((((((......)))))).....,,{..{{{..{{{{{|,,....,.,...(((((.((((((.{,....,,)))))).))))))}))))..{((({...))))}))))))))))))))).....,,,.}}.}}}..)))))).))))})).)))))))))...}.))))))))....{((((((...{({{((,,........)))))},...)))))))}))))},))))))))....))))).))))).,).,)))})))))))))).)))))).)))))))...))))))))),..)))))))))))).)..........,).))))))))...)).)))))))).)))))),..},,)))))).,))....)))))))))))}})))}},}}))))))}}...{((({{((.(((((((({.(((....))).}..)))))))).,,.))))...))),))}..))))).))).)))))).)))..,.)))))))).,..}).,},}}.))).))).))))..)))))........,((((..((((((.((((((..((((.,,,,,,,||||({{{..{||{{|,,,,)).)))}.,))}}...((.(((((..((((((((((..........,.((,.((({{,,,,.}}})},}},..,,...))))))))))..))))).)).(((((((((((((((((((((,..{(((((({(......)))))))))))).)))..........{{{{{..{,{...||}....}}}}}..,,,..,.((((((((((..(((((((...((((,,(((({....,.,..,...,}}}}|},,,(((((......(((((((....)))}.,))).....)))))...{(((({........{{,...,,,.....||.(((((.(((((..............))))))))))...........}}}}}),,,...))))))).)))))))))).}...))))))))))))))....))))))...(((((((((.....(((......))).....))))))))).(((....)))...))))))..)))).,........)))))))).....,.}},...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000294.3 NCBI
GACUGCAGGCAAACCCGGCGACAGCGCAGCUCGCGUCGACCCUGGCUCC… 5384 nt 0.5349
NM_001172432.2 NCBI
GACUGCAGGCAAACCCGGCGACAGCGCAGCUCGCGUCGACCCUGGCUCC… 2225 nt 0.5573
Summary

Phosphorylase kinase is a polymer of 16 subunits, four each of alpha, beta, gamma and delta. The alpha subunit includes the skeletal muscle and hepatic isoforms, encoded by two different genes. The beta subunit is the same in both the muscle and hepatic isoforms, and encoded by one gene. The gamma subunit also includes the skeletal muscle and hepatic isoforms, and the hepatic isoform is encoded by this gene. The delta subunit is a calmodulin and can be encoded by three different genes. The gamma subunits contain the active site of the enzyme, whereas the alpha and beta subunits have regulatory functions controlled by phosphorylation. The delta subunit mediates the dependence of the enzyme on calcium concentration. Mutations in this gene cause glycogen storage disease type 9C, also known as autosomal liver glycogenosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified in this gene.[provided by RefSeq, Feb 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.