Basic Information

Symbol
PHLDA1
RNA class
mRNA
Alias
Pleckstrin Homology Like Domain Family A Member 1 TDAG51 PHRIP DT1P1B11 Pleckstrin Homology-Like Domain Family A Member 1 T-Cell Death-Associated Gene 51 Protein Apoptosis-Associated Nuclear Protein Proline- And Glutamine-Rich Protein Proline- And Histidine-Rich Protein Proline-Histidine Rich Protein PQ-Rich Protein PQR Protein Pleckstrin Homology-Like Domain, Family A, Member 1 T-Cell Death-Associated Gene 51
Location (GRCh38)
12:76025447-76031776
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007350.3
Sequence length
5913.0 nt
GC content
0.4296

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1814.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1919.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1479.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007350.3 NCBI
GUGGACGCAGCGGGCUUUGGAAAGGCCCCAAGUUAAUGAGGCGUGCGCC… 5913 nt 0.4296
Summary

This gene encodes an evolutionarily conserved proline-histidine rich nuclear protein. The encoded protein may play an important role in the anti-apoptotic effects of insulin-like growth factor-1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human left ventricular tissue and a rat ischemic cardiomyopathy model identified the PHLDA1 as a novel molecular marker, with its expression significantly elevated in patient samples, animal models, and hypoxic cardiac muscle cells [Wang et al. DOI:10.1007/s12031-018-1066-6]. A study in rats using an organotypic hippocampal slice culture model of traumatic brain injury demonstrated that the PHLDA1 was downregulated at 24 hours following a mild (10% Lagrangian stretch) injury, as identified through microarray analysis, where it was categorized among genes associated with apoptotic processes [Di Pietro et al. DOI:10.1089/neu.2009.1095].