Basic Information

Symbol
PHLDA3
RNA class
mRNA
Alias
Pleckstrin Homology Like Domain Family A Member 3 TIH1 Pleckstrin Homology-Like Domain, Family A, Member 2 Pleckstrin Homology-Like Domain Family A Member 3 TDAG51/Ipl Homolog 1 Pleckstrin Homology-Like Domain, Family A, Member 3
Location (GRCh38)
1:201464278-201469237
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012396.5
Sequence length
2749.0 nt
GC content
0.5897

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1174.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1216.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 831.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_012396.5 NCBI
AGGCGAGCGGCGGAACAUGUAAGGGCACAUCCCGCGAGCUGCCGCCCAG… 2749 nt 0.5897
Summary

Enables phosphatidylinositol phosphate binding activity and phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding activity. Involved in intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction; and positive regulation of apoptotic process. Located in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A review of human biological age estimation studies identified the PHLDA3 as an aging-associated transcriptome feature, where its expression was positively associated with aging in whole blood samples from a cohort of healthy people [Solovev et al. DOI:10.1016/j.mad.2019.111192].