Basic Information

Symbol
PI15
RNA class
mRNA
Alias
Peptidase Inhibitor 15 P25TI Cysteine-Rich Secretory Protein 8 25 KDa Trypsin Inhibitor Protease Inhibitor 15 SugarCrisp CRISP-8 CRISP8 PI-15 P24TI
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification

MANE select

Transcript ID
NM_015886.5
Sequence length
6735.0 nt
GC content
0.3302

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1561.09 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1700.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1553.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((.........)))...))).((((((.(((((((.(((......))).))).))))...(((.((((.(((((.....)))))..)))))))........((((((((((((((...............((((..((.(((((((((((((.(((.(....((((((..........((((.(((.....))).))))...(((((.((((((((..((...((((((..(((((((..(((((((..(((............(((((((....(((((...((((((..((((((...((...(((((........)))))....)).))))))......(((.((.((.((((((.(((((....)))))........(((...((((((((...)))))))).....)))..)))))).)).)))))........))))))...))))).)))))))......(((.......))))))....))))))))))))))....(((((((.((((..(((((.....((.(((.((((((....(((((..........((((((.((((......)))).))))))((((...)))).((((((..((((((........))))))..))))))....))))).....)))))).))).))))))).)))))))))))((((....))))....)))))).)).(((((.....)))))..))))))))))))).((((((..((....))..))))))...)))))).....).))).)).)).))))))))).)).))))....(((((....)))))..((((((.(((((((..(((((((.((((((((..............((((((((.....))))))))....((((((((((((((((((.((((((((((.((.((((((((......))).......)))))))..(((((....))))).....)))))))))))))))))).(((((((....)))))))(((.((((((...(((((..............))))).......)))))))))..((((.(((..((((((...(((.(((.((...((((((..(((((...(((((((((((((((((.((((((((..............................((((.....)))).(((.((((((((((((((((((((.((...........(((((..((((((.(((....)))))))))..)))))...(((((((((((.(((.((((((((((((((((((((((((((....)))))))))....))))))))))))))((((((..((((((......))))))...(((((...(((.((((.((((((.(((((((...((((...))))...)))))))........(((((...((((.((((.......((((((............))))))......(((......)))((((((....(((((((((....(((((..((((((..........(((....(((((.....)))))....)))((((......))))..((..(((((....)))))..)).....((((((.((..((((..(((((.((((((.........)))))).)))))...))))..)).))))))((((((..(((((......)))))))))))..(((((((((.((((((.(((...((((((((((((......(((((.((((((((((((........)))))......)))))))))))).(((((((...((((((((((((((((((((((((...(((((..((.(((((((((((((............(((((.((((((((........(((......)))....)))))))).)))))...............((((.((....)).).))).)))))))))).))).))((((((((.((....(((((((.(((.........))).(((((..(((.......)))..))))).....((((.(((((((((((..(((.((.((((((((.(((.(((....((((..((((((...((((........(((((....)))))....)))).)))))))))).((((((((..(((((((((...)))))))))))))))))(((...((((((((((((...((((((((...........((((((((.(........).))))))))...(((.....)))((((((..((((..(((.(((..(((((..(((.(((......))))))))))).))).)))..))))..))))))...((((.(((((((...........((((((((.(((((..((((....))))))))).)))..)))))....((((....))))....((((((((..((((((((.((.(((((....))))))).))))))))......(((......)))............))))))))..(((.(((((((((.((((((..((((((.((((((((((......(((((((...........))))))).......))))....)))))).)........)))))..))))))..))))))))).))).))))))).))))....)))))....)))..))))))))))))...)))((((...))))....))).))).)))))))))).....((((((..((((.....)))).....(((((.........)))))..(((((((..((((...)))).)))))))......(((((....))))).....)))))).((.((((((((....))))))))))..............)))..))))))))))).)))))))))))......)).))))))))...........(((((((((((((((((..((.((((................))))))))))..)))))).))))))))))))...)))).))))))))........))))))))....(((((((..(((..((.....)).))).)))))))))))..))))))))))))))).........(((((.....)))))......................(((((((..(((((((((....)))).............((((((..((((((........)))))).))))))......((((((.......))))))..)))))))))))))))).))).)))))).)))))))))..............(((((.((.....)).))))).(((((.....))))).......))))))..)))))..)))))))))....))))))..((((....))))..........)))).))))))))).......((((((((....))))))))(((((.....((((((.((((.........))))))))))....))))).............((((..(((((((((((((((.(((((......(((((.....(((((...)))))....................(((((((((((..(((((.....((((((..(((((.((.....)).))))))))))).....(((((.((.((((((...)))))).))))))).(((((((....)))))))............)))))..)))))))...))))........)))))...)))))(((.....((((((((....(((((((((((((((((.((.......)))))))))........(((((((((((((.((((((((((((((.((((((((..((((((.................)))))).....))))))))...........((((((((..(((.....)))....)))).))))))))))))))))))...))))).......)))))))).............(((((((......((((((((((((.......(((((.....)))))........)))).))))))))......)))))))..))))))))))....)))).))))...))).........((((((((((.((.((.((....)).)).)).))))).)))))))))))))))).......((.(((((........))))).)).((((((...............))))))((((((((((((((...........)))).(((((((((((...(((.(((((((..(((((((((((((.((......((((((...(((((.....((((.(((((...(((((........(((((((((((.((((.........)))).))....(((((((..(((...........................(((((..((((..((((((((((.......)))).)))))).)))))))))..(((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((.(((((((((((((((((..(((((((((.((((.........)))).))))(((((....)))))..(((....)))....)))))..)))))..))))))))........((((((((......)))))))).....)))))))))).))).)))))))).)))))..)))))))).......((((.(((((((((((....(((((((.(((((((((((((...(((...((((((...)))))))))...))))))))(((((((.((.....)).)))))))......((((........))))..)))))...)))).)))....)))))....))))))))))....))).)))))))..)))))))))..........)))))...))))).))))))))))))))).)).))))).))))))))))))))).)))))))))).)))).))))).)))))((((((((((...........))))))))))....)))).))))..)))))).)))).)))....))))).........)))))).........((((((((...((((...(((((((((((((........)))).(((.((((((..(((((((((.(((((((.((((((((..(((((((((((((....................)))))))........)))))).........(((......)))((((.....)))).......(((((((((.(((......))).((.(((((((((.((((.....)))).))))))))).))...((((((((......................)))))))))))))))))........))))))))..))).))))..))))))))))))))).)))..............(((....)))....)))))))))....))))...........((((((...........((((((.........(((((((((....))))))))).........))))))))))))..))))))))((((((((((((((((((..((((((..................((((((((((......))).))))))).((((((....))))))...............((((((((((((...............((.((((((((..(((.......)))..)))))))).)).............))))))...........)))))).(((((((......)).)))))...............)))).))..))))))))))))))))))((....))(((((((..((((.((((.......))))))))..)))))))..)))))).)))))))))))...)).))))))).)))........(((((((....))))))).....)))))))))).)))..((((((........))))))..........))))))))..)))))))..))))))))))..((((((....))))))....))))).))))))...))...))))))...))))))......)))..))))(((((((..(((........)))...)))))))(((((((((((((...(((((((...(((.((.((((((((((........(((((((((((..(((((........................................))))).))))))))))).....)))))(((((........))))))))))...)).))))))))))...))))))))))))).........(((((((((....)))))).)))(((((((((((((...((((......)))).((((((((.((((((....((((((.(((.((((........(((((.((((((..............................)))))).)))))........)))).)))))))))...))))))...((((..(((((((((........)))))))))..))))..........))))))))((((.......))))...)))))))))))))...))))))))))..((((((.........)))))).))))))).).))))............)))..)))))))..)))))).))))))))))))))..........)))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{.({{.........))},{,||,.,|||||.{((((((.(((......))).)))}}))}...(((.((((.(((((.....)))))..)))))))......,,((((((((((((({........{(({{.{((((..{(.{(((((((({(((.(((.{....((((({..........{(((.(((.....))).)))}...(((((.((((((((...,...((((((..(((((((..(((((((..(((.........,,.(((((((....(((((,,,((((({{{((,,{(,,....({(,,,,.}}}....))})}.})}).((....,.},...(((.((.((.((((((.((({(,...}}})),.,,,...(((...((((((((...)))))))).....)))..)))))).)).)))))........)))))).,.))))).)))))))....,.(((.......))))))....)))))))))))))),,.((((((((.{(((..(((((.....,(.(((.((((((....(((((...{{..,..((((((.((((......)))).)))))){{||,..}}},.((((((..((((({........})))))..))))))....))))).....)))))).)))},,))))).)))})))))))),|||,...},,....)))))).||.{((({.....})))).,))))))))))))).{{{(((..{(....||,,}}}}}),,,))))))...,.).))).)).}).))))))))),}).)))}.}.,||||(....))}}|..((((((.(((((((..((({,,,.{(((((((,,,,.,........((((((((.....))))))))...,(((((((({(((((((({{((((((((({.,,.{{{{{(((......))).......}}}}},}..{((((....))))}.....}))))))))))))))))),(((((((....)))))))((({((((((,..(((((..........,...))))).,,....}))))}}))}|((((.(((..((((((...(((.(((.((.,.((((((..(((({...(((((((((((((((((.((((((((.......,,........,,.........}}|,{{....,||||.{{(.((((((((({{{((((((((.{{.......,,,.(((((..((((({,(((....)))))))))..))))),,.(((((((((((.(((.{{((((((((((((((((((((((((....)))))))))....)))))))))))))}.{{({{..{{|||{....,,|||||}.,,(((((...(((.((((.((((({.{((((({...{{{{...,}}}.,.))))))}...,....(((({,.{((((.((((.......((((((............))))))......{((......,,,((((((,,,.(((((((((....(((((..((((((...,.,....{{,...,{((((.....,,}}}..,,|||{{{{......||||,,{{,.(((((....)))))..,,.....((((((.,(,.((((..(((((.((((((.,....,..)))))).)))))...))))..,),))))))((((((..(((({......))}}}))))))..{((((((((.((((((.(((...{((,((((((({......((((({((((((({{{{{.,,{{...}}})),,....)))))))))))},(((((({...((((((((((((((((((((((((...(((((..{{.(((((((((((((............(((((.((((((((........(((......)))....)))))))).)))))...............{{((.{(....)).).})}.)))))))))).))).}}|(((((((.((....(((((((.{({.........}}}.(((((..(((.......)))..))))).....((((.(((((((((((..(((.((.(((,,{{(((((((((((.(((,((((,,({...,|,,))}}.}}}.}})))),,)))),,..{{||,|.,,|},}}}}..(((((((,.,(((((((((...))))))))))))))))).,|,.,((((({{(((((,,.{(((,.,{,,,,..,,,,,{(({{{{(,(,,..,,,,|,||}}}}}},,}|||,,...,,,((((((..((((..(((.{,({.((((({,,{{.(((......)))}))))))).))}.)))..))))..)))))).,,({{,.((({{{{......,,,,.{((({(((.(((((..((((....))))))))).)))..})))).,...{((....)}}(((((((,(((....((((((((.((.(((({....})))))).))))))))....},|.....}}})))),,,,,,{{..{||||||||,,(({.(((((((((.((((((..((((({.((((((((,{.,...{{{{{{...,,{,.,......}}}}),})})..},},}},.}})))}.}......,.)))))..))))))..))))))))).))),||}|||}.}}}},...,})}},,,})))..))))})))}})),}}}}}{{{{...})))....},,,)))}}}}}))})))}||}}||{{,,|||||}}}}}.,))})}}..||||{.,.......,,}}}..{((((({..(((,...}))).))))))}((((..(((((....))))).....))))...((.((((((((....)))))))))).......}))}}..)))..))))))))))).)))})))))))......)).))))))),...........((((((((((((((((,.,((.((((.,{.,.....,,,.,.))))))))))}})))))}.})))))))))))...)))),})))))))........))))))))....(((((((..(((..((.....)).))).)))))))))))..)))))))))))))))...,.....{{{{{...,,))}}}.,,,,.......,,,,,....{(((((((..(((((((((....})))..,,,.,,.....{{{({{..((((({........)))))).}}}}},....,,|||||{,..,...}},}},,,)))))))))))))}}}.))).)))))).))))))))).,,,}}},,,}},,(((((.((.....)).))))).(((((.....))))).......))))))..)))))..))))))))),,,.))))))..((((....))))......,},.)))).)))))}))}...,,{.((((((((....)))))))).}}}....{{({((((.{{{{...,,,,,,)}}}}})))},...,,},,..|,,,......,((({..,,,,{(({(((({{{.|{{{{......{{{((,....({({(...}}}}}..,,................{{{({{(((((..(((({...,|{{{{{{..(((((.((.....)).))))),}}}}}.....(((((.((.((((((...)))))).))))))).(((((((....))))))){,{,,,,||,|.|||||,,|}}}}}}...}}}}..|,,,,.|||||{,,}||||(((.....((((((((.,,.((((((((((((((((({,(,....,,,))))))))........{(((({{,(((((.((((((((((((((.((((((((..((((((.................)))))).,...)))))))).........,,((((({(({{,((....,},}}},.)}})}})))))))))))))))))...))))}..}}}},,||||,,,,}},.........(((((((.,,...,,{{{||||||,.,,..,,({((({{,,{|,,},..}},..,))))}}))))|||....}.)))))))..)))))))))).,,.)))).))))...}}}.........{(((((((((.({.{,.{,....},.},.}}.))))).))))))))))))}))),,,,...|{,(((({,,......}))}),)),|||||{..............})))))}{(((((((((((((...........)))}.(((((((((((...(((.(((((((..(((((((((((((.((......((((((...(((((,....{(((.(((((...(((((........((((((((({{,((((.........)))),)),...{((((((..(((...,{{,,..........,,}}},...(((({..((((..((((((((((,...,,.})))}}})))).))))}))))..(((.(((((..(((((..{(((((({(((.((((((.,,(,(((((((((((((..(((((((((.((((.........)))).,))}(((((....)))))..,{{....}}}....)))))..)))))..)))))))).,,{{{{{((((((((......)))))))}..,}))))))))))).))).)))))))).)))))..))))}})}.......((((.(((((((((((....(((({,({{{{{{((((((((...(({..{(((({,...}))))))))...))))))))|((((((.{(.....}).)))))),......((((........))))..,}}},..|))}).)))....)))))....))))))))))....))).))))))}..}))))))))..........)))))...))))).))))))))))))))).)).))))),})))))))))))))).)))))))))),}))).)))))})))))((((((((((...........))))))))))....}}}}.}},}..}))))).)))).)))....)))))......,,.}))))),.,,,....{{{{(({,.,|||||,|.|||,...((((((........)))))}{{.(((((,.,(((((((((.(((({(({((((((((..{(((((({({{{{.........,,,.....,,,}}}||||{{......))))}),.,,.,...{((......))}((((.....))))..,,,,.((((((((({(((......))).((.(((((((((.((((.....)))}.))))))))).))..,(((({(({.....,},,}}},..,......,})))}})))))))))),,......}))))))}..}))}))))..))))))))))))))).))}.,,,|,}|,,}}}}||||,,||||||..{{{({.,....}})))|{...}},,|,,}}}}}|.,}},,..,|.{{{{{,..{{{....(((((((((....))))))))).......}})},,,}})))))..}))))))}((((((((((((((((((..((((((...,..,,,,,,,,....,,,,,|||{{,,,,{{{{|{|||,||,.((((({....}))))).}}.,}}},,,,...,,{{,.(((((({{{..,,,......{((,{{{(((((..{{{.......,}}..))))))))}),....}}}..}}},})))))..,.,,,,,,})))}}}.,{(((((......))},)))},|,............)))).))..))))))))))))))))))((....))(((((((..((((.((((.......))))))))..)))))))..}}}))).))))))))))).,,)).))))))),,})...,..{.(((((((....))))))).}...)))))))))}.))),.((((((........))))))..........})))))))..)))))))..)))))))))),.{(((({....})))))}...}}}}}.))))))...}}...})))))...))))))......)))..)))}{((((((..(((........)))...))))))|(((((((((((((...(((((((...(((.{{.((((((((((,.,.....(((((((((((..(((((,{((({.........................,}}}},...))))).)))))))))))..},.}))))}((({....,,,.}}},,,,))}...)).))))))))))...)))))))))))))........{(((((((((....)))))).)))|((((((((((((..,{((,,,,,,,,,,,.((((((({.((((((....((({((((((.((((...,{,,.(((((.((((((.,,.......,,,,,.....,,}}},.,,.)))))).)))))..})}...)))).)))))))))...))))))...((((..{{((({{{(........)))))))))..)))}..........)))))))){{{{.,,,}},})))...))))))))))))}.},)))))))))},.{(((((.........)))))).))))))).}.}})}|...}}},,...}))..)))))))..)))))).))))))))}}}})),,,,,,....))))),.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCAGCAUUCAAACCUUGCAGAGCUUUGCUCUCAGAGAGUUUGUAAAAA… 6763 nt 0.3305
AGCAGCAUUCAAACCUUGCAGAGCUUUGCUCUCAGAGAGUUUGUAAAAA… 6735 nt 0.3302
Summary

This gene encodes a trypsin inhibitor. The protein shares similarity to insect venom allergens, mammalian testis-specific proteins and plant pathogenesis-related proteins. It is frequently expressed in human neuroblastoma and glioblastoma cell lines, and thus may play a role in the central nervous system. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human ex vivo skin explants demonstrated that the early burn response gene PI15 (peptidase inhibitor 15) was significantly upregulated in burned tissue at 1 hour post-injury [Foessl et al. DOI:10.3390/ijms22179209].