Basic Information

Symbol
PIAS1
RNA class
mRNA
Alias
Protein Inhibitor Of Activated STAT 1 GBP GU/RH-II DDXBP1 ZMIZ3 DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) Box Binding Protein 1 Protein Inhibitor Of Activated STAT Protein 1 Zinc Finger, MIZ-Type Containing 3 E3 SUMO-Protein Transferase PIAS1 RNA Helicase II-Binding Protein E3 SUMO-Protein Ligase PIAS1 DEAD/H Box-Binding Protein 1 Gu-Binding Protein AR Interacting Protein EC 2.3.2.-
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_016166.3
Sequence length
7980.0 nt
GC content
0.4021

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2066.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2221.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2123.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..((((((((((((((.(((((((.....((((((.((((((((((((((((((......((.((((.((.((((((((((..((((....((..((..........))..)))))).....((((..((....))....))))))).))))))).)).))))...)).......)))))))))).))))((((....................)))).(((((((((...................))))))...)))..(((.....((..(((((......................)))))..))..))).)))).)))))).......(((((((...(((((((............))...)))))...........(((.((.....((((.(((((((...((((...((((((((....))))).)))))))))))))).)))).............((((......)))).......)).)))...)))))))(((.(((((...(((((((.........)))).)))))))).))))))))))..(((....))).(((((...((((....)))).....)))))...(((((((((((...(((.............((((.((((((.............)))))).))))....)))..))))))))))).(((((...)))))...(((((((((.......))).)))))).....((......))...................))).)))))).))))).((((((((..........)))))))).......(((((......(((((.......)))))..)))))....((((((((((.((((....)))).)))((((....)))))))))))(((((((((((((((((((((....(((.(((((((.........(((((((.(((...(((((.(..(((.(((((((((....(((((...(.((((...(((((........))))))))).))))))....(((((((.((((((...........((((((..(((((...((......))...))))).))))))...((...(((((......)))))...))(((.((((((((..(............)..)))))))).)))))))))..))))))).......(((((((((((((((((((.......(((..(((((.((((((...(((((.(((.((((((((((....((((((.((((((((..(((((((((.....(((..(...((((((((((((((((...))))))((((((((((((((........(((.(((.......((......)).....)))..)))........)))).))).)))))))((((.(((((.((..((.(((....)))))..))...))))))).)).......................(((((.......))))).....))))))))))...)..))).((.......))....(((((((((...(((((......................(((.....((((((....((.....)).....)))))).....)))..(((((..((....)).))))).......(((((...................))))).)))))...)))))))))..(((.((.....(((((((((...........((((((((......))).............)))))..)))))))))...)).)))))))))))).))))).))).((((.((..(((((((((.(((((((((.....((....((((((.((((..........))))))))))..(((((((.((((((.(((((.(((.((((((((((((((((((.(((((.......)))))............((.(((.....))).))..(((((((((((((((.(((((.(.((((.(((...(((.....((.(((((((((((((..(((....((((..((((((.....(((((.....((.(.(((((((((((((((((...............(((.((((((((((...((((((........))))))..))))))))))...)))......((..((((......))))..))......))))))))))))))))).).............................((((((((((........))))..))))))......((((....(((..((((........))))..)))...)))))).......))))).....)))))).))))....))).)))))))))))))..))....))).))))))).).))))).)))))).))))).))))..((...((((.(((((((((.((((((.((((((...((.(((....))).))...)))))).....((((....))))..))))))....(((((.....)))))))))))))).)))).)))))))))).)))))))...)))))).))))).)))........(((((...((((((.((((.((..((((.(((((((.............(((((.(((((((((......((...((((((((((......(((((.((((...................(((.((...((((.(..((((((((((....................))))))))))..).))))...)).))).......(((((((((((((((((....((.(((........((((((((((((..(((....)))..))))).((((....))))....)))))))........))).)).....))))))))))...))).)))).......)))).)))))))))))))))...))....)))))))))...))))).......(((((((((.(((.....))).)))))))))(((....)))((((.((((((((....((((.((.....))))))..............(((((((........(.(((((......((((....)))).....(((((((((.........((((.(((..((((.....))))....))))))).(((....((.(((((((......))).))))))))))))))))))(((((((((.(((((.(((....(((((........))))).((((.(((((((...(((((((...))))))).....)))).))).))))(((((.......(((((((....))))))).......))))).)))))))))))))))))))))).)........))))))).(((.((((.(((((.((...)).))))).)))).))).....)))))))).))))...))))))).))))....)).))))...))))))..)))))..((((....))))...(((...))).....(((((..............)))))((((((((((..(((((.((((((((((.(((((((...((((.(((((.................))))).)))))))))))))))...((((.....))))))))))))))).....)))))))))))))..)))))))...(((((((...)))))))..))......))))))))).......(((..(((((.(((.........(((((((((((((((((.(((((((((((.((((((((((..((((((((.....((((.....)))).....)))).))))...........))))))))))..)))))))..(((((((.....)))))))...((((((((....................)))))))).........((((((((.....)))))))).......((.((......)).))...)))))))))))))....)))))))).........))).)))))..)))..(((((((...(((((((((...(((((((((((((..(((((((((((.....(((((.(((.................(((((((((.(((.((.((((((.((((((........)))))))))))).)).((..((((.(((((..........))))).))))..)).....)))))))))))).((((((((.((((.(((....((........(((((.((((((((((..(((......(((........))).(((((...))))).........)))..))))))..))))..)))))........))...))).)))).)))))))).))).)))))....)))))))))))..))))...........)))))))))...)))))))))...))))))))))))))))..)).))))))))))(((..((((((.....)))))).)))........)))))))))))))..........(((((...((.((.(((((((((...))))))))))).))......))))).((((....))))..((((((((.....................))))))))(((....))).....))))).))))))((((.(((((......((((.((((........)))).)))).....)))))))))..........)))))..))).....)))))))......(((......)))..))))))))))))(((((((((((.(((((((....)))))))...)))))))))))...........))))))))).)))..).)))))..))))))))))........(((((((.((...(((((((................((((...))))..((.((((....))))))........(((((.......)))))..((((....))))...............)))))))..........)).))))))).))))))))))...))))))))))))......)))))))))......)))))))...(((.((((.............(((((..(((((.......)))))..)))))..........................((((((((......((((..(((((((.....)))))))........((((((......)))))).(((((((((((.....((.(((...((((((.....((((...(((((((.((((((((((((.....((((((((((((((((((((((((((((....))))))..((((..((((.......((((((.(((((..(((.......))))))))..))))))....)))).))))......((((.....))))((((((....(((((.....(((......)))..............(((((((.....(((.((.((((....)))).)).))).....))))))))))))..))))))........(((((((..((...((((........))))...))..)))..))))...(((((((......(((((.((((((...(((.........((.(((((((((((.(((((...))))).)))).................((((((...))))))....)))))))))........))).)))))))))))......)))))))))))))))))))).))...............))))))))))))))))))).)))))))..)))).....))))))))).))))))))))))).....(((((.(((((...(((..((((..(((.((((((..(((((...((((((..(((((((((....((((...(((((((...(((((((((..(((((...((((((((......((((......)))).((((((((...))))).)))...............((((((.(((((((((((...(((....(((..(((.......)))..))).((((.....))))....(((((.....)))))(((..((((((((..((((((....(((...)))....))))))......))))))))..)))..)))...))))...)))))))....................(((((.....)))))................)))))).)))))))))))))(((((..........))))).(((...(((((....(((((.(..((((((..(((.(((..((((......)))).))).)))...))))))..).)))))...)))))..)))....)))))))))..)))))))....))))..)))))).)))((((((...........))))))))))))..)))))...)))))).)))..)))).)))((((((((.........))))))))..(((((((((...(((((((.....))))))).((((((..(((..(((..((........))...))).)))....))))))...)))))))))....((.(((.((((((.((((.((((...((((.....((((.((....((((.(((((((...(((((((((((((.((((...(((.....(((.((((((((..((((.(((((..(((....)))..)))))...))).).....))))).))))))..)))))))..((((((((....((...(((((((.(((.(((.(((((((((((((((((......((((......))))...(((((((.((.(.......((((((((..............)))))))).((((((((....(((((((.(((((((((..(((((((((.............))))))(((((.(.....((((...((((((.....((.((((...(((((....)))))...)))).)).....)))))))))).(((((..(((((((((((((...(((((.(((((.(((((.......)))))...)))))..))))).))))))....((.(((.......))).))((.((((((((.((..((.......))..))..)))))))).)).......((((((.(((((....)))))..)))))).)))))))..)))))((((.(((((((((((((.(((((.....................))))).))))))...))))))).))))).)))))...((((((......((((((.....(((((........))))).)).))))...))))))....((((((.((..(((((((.......(((((((((...............))).)))))).....)))))))..)).))))))))))))))))))......((((...(((((((..(((((((......)))))))(((....)))...((((....))))..((((...)))).......((((((((....))))).)))........))))))).))))..)))))))..)))))))).).))))))))))))))...)))))....)))))))(((....))).....))).))))))))))..))..))))))))...(((((.(((((..........)))))..)))))((((((..((((((..........(((((.((((.......)))))))))((((...((((((((..........))))).)))...))))........))))))..))))))..))))).))).)))))...)))))))))))....)))))).......)))))).))))))))))))))).))..))))).))))).))))......)))))))).((((......))))....................((((((....))))))....)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.{(((((.((((((((,(({{{{...,{...,||||,,,,((((((((((((((....,.{{.((((.((.(((((((((({{((((,...,(..,(..........}}..}))))).,...{(((..((....))....))))))).))))))).)).))))...})....,..)))))))))).)))){{{||,,,}},,.......,..,.}||,.(((((((((............,......))))))...)))..)),....})))}})))}}.....,,,,.....,,,,,,((((((({,...}}.))))))||{{{{...{(({({{{{((,,,{{({{{{.......,,..{||...|}}}}...........,{{,,......((((.(((((((...{{{{...(((,(((,....,}))).)))}})}))))))).))))...........,,(((({,....||||,,,{{{{.,{|||,,.||||,,,(((.(((((...(((((((.........)))).)))))))).))),,,|}||{{(((,,,,|||,(((((...((((....)))).....))))).{.,((((((((((....,,.....,..,,,,,{{{{.{{{{{({{{{{..{{{.,,|,,,})}}))).}}})))..))))))))))),{((((...)))))...{((((((((.......))).))))))....,||,.....}}.,.,,,.............,..,,|||||{||{|,.{{{|||||.........})))))))),,.}}))))||{.|,,,.{((({,,,,.,,})))),,}|}|},...,|||||,|||.((((....)))).}}}{{,{....))))},}}}}}{{|||||||{,{(((((((({((,.{{{,,{{(((({...,,,,,|||||||,|{|..,|||||.{..(((.(((((((({...,.{({{,..,{{{{({{{(((((........)))))....{.((((((((......))))}}})),..........((((((..(((((...((......))...))))).))))))..))))}.,{|||....,}))))}||{{{,({{,.|,,.}},|||,(((({,,{(((((({((....})).))..))))))))))...}}}..((((((((((((({(({(({{,....{{,..,,{{(.((((((...{((((.(((,{(((((((({....((((({.((((((((..(((((((({.....(((..(...((((((((((((((({...})))))((((((((((((((........(((.(({.......,{......}}.....)))..)))........)))).))).))))))){,((.(((((.({.,((.(((....)))))..)).,.))))))).}}.......................(((((.......))))).....))))))))))...)..))).{(.......)}....(((((((((...(((((................,.,,,.{((.,...((((((....,,.....},.....))))))...,.}}}..,{|||..,(,,,..|{||||........|||||,.,,,,.............,}}}}.)))))..,)))))))))..(((.{{.....(((((((((...........{{{{{(((......))).............}))})..)))))))))...}).)))))))))))).))))).))).((((.((..(((((((({,(((((((((.....{|.,,.((((((.((((..........))))))))))..(((((((.{{{,......(((((((((.((.{..{{.,,{|.,,{{{((.{{,,..||||,.......,..,)))..}))).}),,,,)),)))))))))..,{{.{,{{,,({(.{,...((((..((((.((((.......)))).))))..)))}{{((((.{((((........((((((...(((((((((((((((((.....))))))))}......(((.((((((((((...((((((........))))))..))))))))))...}}}..((((.(((((((.((.....{((((((........((((((...({.,{({{{{((((.(((((((({.,,,.{{((({.(((((({(((........))))..))))))......{{.....,}.....})))}}|||{,.{{{{{((((..((..((({,{{{{....{(((((((.(((((((....,.((((..((({...})))..)))).}))))))))))))))}((((((((,..{(((((((((.((((...........{{{,(((((((((,(((((...{{.(((....))).)}...)))))}......{{{{{{{{((.(({.,,.(((((.(({{..((((........))))..)},})..))))).,.))).))}..})))}.}})))))).})).}}},...))))..))))))))))))))))))})}}))))..)))))))),}.}}}}}|,,,,(((((((((.,...,((,,.((((((((((,.....(((((,(({{....,,..........,,,(({.{{.,.((((.{..((((((((((.....,{,...,,,......))))))))))..}.)))).,,)),}))...{{,,((((({(((((((((((....((.(((........(((((((,,(((,,(((....}}}..}}}}}.||||},.,}}}},,..)))))))........))).))..,..)))))))}}}.,,})),})}),,.....)))}.)}))))))))))))).|,||,,|.})))))))|.,,,.((({(({,,.(((((((((.(((.....))).))))))))),|.....,,,...,,{,.,...{{{{,(((....((((((.((((.........(((((((((..(((((..,.({..,{{{....}||,|..,,,},,)))))..))))))))).........))))...)))))).,..))},))))),}},}}})))}}))))}(((((((......))).)))).}),})))))).))))))))))}.))))))))))))))).)))))))..))))...,,,,.,,|{{{{...(((((({...})))))).....}}}}.....,))))))))...)))))},,,{{,{{{{||||,,..}}}}}))}..||}|,{{{({.,((((,,,((({...}}}}..,}}))....|||}|{,|}|||||}||,..}},})))}.)))).)))...{{{{{{{{,(((({{{{.,,,,.|||,,}}}}}..}}}}}}}},|||||||,{{|..|{({((,..{|||}..,}|}.,,}}}.,}}}))||},,},.,}}}}}|.{{{{{.{(((((((((..{(({{.(((((,((((.((((({,.{(({,{.{((({.........,....,,,,,}}},,))))))))))))))..{((((.....)))))))))))}}}}.....)))))))))))))}})))))))...{{{{{({...|}}}))}..))......))))))))}.......(((.,(((((.(((.........{((((((((((((((((.,,.((((((((.((((((((((..,,,,{((({....}}}}}},,,|,,..{{{{,,.,}}},,...........))))))))))..)))))))}.(((((((.....)))))))...{{{(((((,...................}}}}}|||(((,,....((((((((.....))))))))....,,.)))}|}.....|},,}},,})}})))))))))....)))))))}.........))).}))))}.))).{(((((((...(((((((((...(((((((((((((..(((((((((((.....(((((.(({.,,{{{,....,}},..(((((((((.(((.{(.((((((.((((((........))))))}))))).)}.((..((((.(((((..,,....,,))))).))))..)).....)))))))))))).{(((({,({((({.{,({.{{{{........(((((.((((((((((..({,,,{...,((,.......},,.,((({...))}}}..,,,...})},..)))))}.,))))..)))))........}}.,,))}.}}))}))}))))).))).)))))....)))))))))))..)))}...........)))))))))...)))))))))...))))))))))))))))..)).))))}}}}}}{{{..((((((.....)))))).}}}...,..,.}))))))))))))..........(((((...{{.({.(((((((({...}))))))))}}.})....,.))))).{{({....}}}}..{((({{{{...,,||............,,}}}}}}))||{....))).....}}}}}.})}},}|{((,((({(.{(,,.((((.((((........}))).)))),.,.,))))))))),,,,,,,.,.}}}}),.}))},.,,}))}})}}}},,,{||.,.,,.})}.}))))))))))))((((((((((({(((((({...,)))))))...))))))))))}..,,,......})))))))).))).,),)))}}..))))))},,,..,,,...||||||||,,..||||,,|..,{,,,......,,,{((((..,||||..({.((((....))))}}........(((((.......)))))..((((....)))),,..(({.,,,..,,})}|}},{{{{,|||..,,.,)))),)}))},|||||,...))))),,}))))}}}}}}))),,))))}}....)))))))...{((,((({.............(((((..(((((.......)))))..)))))..........,{{{{......,,,,,({{{{(((......{{{|..|||{{{||,,..}}}}}}},,....,,||||||,,,,}}}}}}},.(((((((((((.....(({.,({{.{(((((.....((((...(((((({.((((((((((((.....((((((((((((((((((((((((((((....)))))),{((((..,,{{{{,{{,,(((({(.(((((..{{{.......}}}}}))}..}}}}}),,,,)))}.},,,......{{{{.....)))}{(((({....{{{{(,,{..{{{......))),........,,,,,(((((((.....(((.((.((((....)))).)).))).....)))))))})))),,)))))}......,{{{,.....,}},,,{||{,|||}}||||}||,,|||||.|,,,......((({{((.,,...{(((,{((((((...({{.........{{.((((((({(((.(((({...))))).)))}||,,||......}}}},((((((...))))))....))))}))))}.}},...))),))))})))))}......))))))}))))))))))))).))...............))))))))))))))))))).}))))))..)))).....))))))))).,}))))))))))).....,((((.(((((..,(((..((((..(((.((((((.{(((((...((((((..(((((((((.,..((((..{(((((((...(((((((((..(((((...((((((((......((((......)))).((((((((...))))).)))....,,,........((((((.(((((((((((...,{(....(((..(((.......)))..))).((|||....))))....{((({.....)))}|{(({.((((((((,{((((((....(((...))).,..))))))..,},.})))))))..)))},)))...))))...))))))).......,,......,....{{{{(,,.,,}}}}}.,,.)},....,,...)))))).))))))))))))){((((..........))))}{{{,...(((((....(((((,(..((((((..(((.,((..((((......)))).))}.)))...))))))..).)))))...)))))..}})),..)))))))))..)))))))})..)))).})))))).)))|(((((.,.......,.))))))))))))..))))).}.)))))).)))..)))).))){(((((((.........))))))))..(((((((((...(((((((.....))))))).{(((((..(((..(((..((........))...))).)))....))))))...)))))))))....((.(((.((((((.(({({((((...(((({.,..((((.((....((((.(((((((.,.(((((((((((((,((({,.{{{{.....(((,({{(((((,{{(((.(((((..(((....)))..)))))...)))}),....))))).})))))..))}}))),.{(((((((..,,((.,.(((((((,(({.(({.((((((((((((,,{{({,,..,(((({.....,,||((,{(((({(.(({{,{((({,((((((((,,,........,,,|||}}}}}.,{{{,,,|...,||{{{{{|{{{{{{,,||.|.(((((((.............)))))))..,||||,,||,,}}}}}}.....||||.||||}}},))))}),)),,.}..|||.{|||{{,.,,,,.,,}},)))),(((((..(((((((,(((((...((((({{(({{.{(({{,,,.,,,|}}||...}}}}}.,))))}.))))}),,.,||,}||}}}...,}|||..((.((((((((.((..{{.......})..))..)))))))).))....}},((((((.(((({....}))))..)))))).)))))))..))))),(((((..((((((({,(,(..(((((..(((((((,.,.....}))))))).}}..)))))..)))))))))}..))))}.,(((((.,....((((((.....(((((........))))).)).)))).,.)))))}....{{((((.((..(((((((.......(((((({(({.,,.........,,),)})))))).....)))))))..)).)))))))}}))}}}}}|}...{{,{(((...(((((((.{(((((((......)))))}}(((....)))...{(((....)))}..((((...)))}..,,|..{({(((((....))))).))).,,,,.}.))))))).)))}..)}),,}}|,,,..})))},,}}))}))})))})),,.)))))....))))))}{{|}...)))}....|||{|||,,,}))).})),.))))))))...,(((,.{((((..........)))))..))))|((((((..((((({,.....,,,.,{(((.((({.......}))))}}}}||||.,.(({(((({...,......))))).))),,{|||}...}},,}))))))..)))))),.))))).))))))))).,.)))))))))))....))))))..,..},}))))).))))))))))))))).))..))))).))))}.}}||..,,..))))}))),((((......))))..,,.,,,,,,.........{{{|||,,,,)))))).,,.))}}.}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
UUGUUGUGGGCGCCUCUGGCGGGGGUGGCGGGGGAAGAGAUAGGGAGUC… 6342 nt 0.4048
GACAGACGCAAGAUGGCGGACAGUGCGGAACUAAAGCAAAUGGUUAUGA… 7980 nt 0.4021
Summary

This gene encodes a member of the protein inhibitor of activated STAT (PIAS) family. PIAS proteins function as SUMO E3 ligases and play important roles in many cellular processes by mediating the sumoylation of target proteins. This protein plays a central role as a transcriptional coregulator of numerous cellular pathways includign the STAT1 and nuclear factor kappaB pathways. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the expression of the PIAS1 (Pias1), an apoptosis-associated gene in the JAK-STAT signaling pathway, was transiently upregulated at week 2 following repeated administration of low-dose chlorpromazine in mouse heart tissue, as validated by real-time quantitative PCR [Tsai et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2011.04.006].